Detailed information on CNT30378086


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q8S8S7|PUB34_ARATH, E-value = 4e-109

BLAST vs NONCODE:
NONATHT003439, E-value = 0.0

Expression of CNT30378086

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MRSCSLSDKDWIKKPEDGTRGGASVLVIGL*

>peptide 2 (74 aa)
MYRRFRSFLEFFFTGQRYCFLIVLLFLETLTFASLFNFTKICFSIHYNFINIEIPFHTKTFLKMILGIKLLVTS*

>peptide 3 (48 aa)
MVTEESEHTWWLSCIFEGSMLEAMCAHSLSVTPFSPSPSLSLSLQHFI*

>peptide 4 (51 aa)
MICKPLCSFFDLFYTIFSVANIVMCQSTHCAVFVLFFTYSFHLCLLPSLSF*

>peptide 5 (41 aa)
MTYTEQKSGVDFIMLDCTSCGLLNIKDLAKVFFVDAPNTRLL

>peptide 6 (52 aa)
MSTVLNKKLAQIKLFTFLFAVSASLQAELYMSIVCLSSSFSLLISASISFCK*

>peptide 7 (52 aa)
MNQHIKMSIDIPLLCRLCNFMIATPSLCVPFFFRRLSIERDIPIGLISSAYI*

>peptide 8 (33 aa)
MFSQLPLSLILCTSLIYMGIMTILLTCTLFAIW*

>peptide 9 (37 aa)
MWSRFQLFLFLIFYDRCIEDSDLFLSFFLLVKDIVFL*

>peptide 10 (33 aa)
MSIRLILWLTFLFVGIQGLCNKTFLPQMSCGIA*

>peptide 11 (43 aa)
MHHDKNPYYFEKRDQLNPSLQTHHQIHQKTNFVTWDFFGRQLD*

Sequence

>CNT30378086
GCCAAAGATAAAGAAACACCTATCCTATAATAATTTAGAGCAATATACCTCCATAATGGAACATCTATATATATAAAGGTATCCGTATATCTCTATATAT
TATATTCATTGAGTTTAAAGTGGCTAGGGTTTATAGATGTATGTGATATTAAGAGATATGAAACATATTTGTCGACGGTTTGAGTGGTGAGGAATTGATG
GTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGGTTCCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCCGTCACCCCCTTCT
CTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGCATTTCATTTAGTTTTTAGAGTTAAACATTTTGATTTTGATTTTTACATCCATTCTTTTGGTTTTACA
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TGTTTTTGGAAACCCTAACATTTGCAAGTCTTTTCAATTTTACAAAGATTTGTTTTTCTATACATTACAACTTCATAAACATTGAAATCCCATTTCACAC
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GTAGGTCGTTTGTCATCTCACACTCTTTACACAAGACATGTCTCAACCAGTTAATGTAAAATTTATTTAAAACAAAAAACAGTCTTACATCAAGTGCTTC
TGCTATTCGAAAAATTAAACGGAATTTAAATTTTAAATCTAGGTATGTACTCCCTGATGTAAAATTTGAAATGGCTCATGTTGTATTTTGAAAATTGTAA
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GTGTATATTTCAAAATATATGTTTCTTCTTTTTTTGTCATATCCATTCGTTAGTTCTCTCATCACCATCATTCCCAAAGTTTTTTAATCTAATAAGATGT
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GTCATGTGGAATTGCGTGACGCTATCAGCTATCGATGCGGGGACTAACCGCGCTAAACCAACGTCGCTGATCTTGCTCACGTAGTTTTTGTCTAAGAGTA
TATTGGCTGGTTTTAGGTCGCGGTGAACTAAAGGTTCTGGCTTAGCTTGATGAAGGAATGAGAGTGCGGTAGCAATCTCCGCCGCTATTTCAAAACGTTT
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GCACCAAGGAGAAGAACCATGTGAGGATGCCTTATGGAACATAGAACCTCAACCTATAAAATAAGAACAAAAATATGTATGATTTACGCAAAAGCATAAA
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CTGTAGCGAACATCGTTATGTGCCAAAGCACTCACTGCGCGGTCTTTGTCCTTTTCTTCACTTACAGCTTTCATCTCTGCTTGCTTCCTTCTTTGTCCTT
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CCATCACTCCAAACCCACCATCAGATTCATCAGAAAACGAACTTTGTAACGTGGGATTTCTTTGGAAGGCAGCTTGATTAAAGCCGTTGTTGAAATCCAT
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GAGATCTTGCTCGCTATCGGATAAAGATTGGATTAAAAAGCCAGAGGATGGAACACGAGGCGGGGCAAGCGTATTGGTGATAGGTCTTTGAGCTGGTCGG
GAAGACTGAACTTTCCCTCCTTTAGAAATGACATACACCGAACAAAAATCAGGCGTCGATTTCATTATGCTAGATTGCACCTCATGTGGTTTACTAAACA
TAAAAGACCTAGCGAAGGTGTTCTTCGTGGATGCTCCCAATACAAGATTGTTAAC