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Detailed information on CNT30371506


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002853, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30697530Oryza glumipatulaOryza sativa47.965099.181468forward
CNT30555565Oryza glumipatulaOryza glaberrima63.7492.6898.971951forward
CNT30596786Oryza glumipatulaOryza meridionalis7.8122.2392.89239forward
CNT30110392Oryza glumipatulaOryza longistaminata19.7348.0193.05604reverse complement
CNT30104613Oryza glumipatulaOryza rufipogon47.9653.5698.911468forward
CNT30578599Oryza glumipatulaOryza barthii64.0364.4998.781960forward
CNT30117986Oryza glumipatulaOryza nivara58.1888.6599.211781forward

Expression of CNT30371506

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (74 aa)
FLFFCSPLPPVFPSLSRSLLSLALWRTRAAALIVGCVAAASAWLAGKVPPPPLLPPLPFLQSSLPLFPSLNISI*

>peptide 2 (43 aa)
MYWFVLDFTELLLSRMNYSLLPKKDKPWFPCPTFDRPFYLKKL*

>peptide 3 (33 aa)
MEPKVSKLETIKSGVIITAGSWFNTCTYGILTF*

>peptide 4 (31 aa)
FFSSVLLFLPFSPLFLALFSPWRCGAQGLRP*

>peptide 5 (48 aa)
MNADMNKPMNCITEIKITLISLVLIYAYMLNQLNLLKLVTYKQDQIFD*

>peptide 6 (84 aa)
SFLLFSSSSRFPLSFSLSSLPGAVAHKGCGPNCRVCRRRLCLAGRQGAAAAASSSSPLPSILSSPVSLSKYLYIAHLPFSPLLP*

>peptide 7 (37 aa)
MVSISTLYMHNICDAYCIRFLEYNYMHVCMQTCSGKL*

>peptide 8 (36 aa)
MWFSSSFKNPSLLFYCCSSGSKGDFARTKLLHLELG*

>peptide 9 (38 aa)
MQTQIHNLLISHAILQIKLLIIYDVFSIKSGLSFITFK*

Sequence

>CNT30371506
TTTCTTTTCTTCTGTTCTCCTCTTCCTCCCGTTTTCCCCTCTCTTTCTCGCTCTCTTCTCTCCCTGGCGCTGTGGCGCACAAGGGCTGCGGCCCTAATTG
TAGGGTGTGTCGCCGCCGCCTCTGCCTGGCTGGCCGGCAAGGTGCCGCCGCCGCCGCTTCTTCCTCCTCTCCCCTTCCTTCAATCCTCTCTTCCCCTGTT
TCCCTCTCTAAATATCTCTATATAGCTCATCTTCCCTTTTCTCCTCTACTGCCCTAGTTAGTATTATCCTCAATCTCTTCAACTTCTGCTCTATGCTAGT
GTTTATCTCTCCTTGGTGATGTCTGTGATAGCGGTGGACTAGTGATGCTGGTTGTATATAAATGATCCTAGTGGTCACTTGATTTTTTTTCTATACTCAG
GGTTGTGCTTACTGATTTCAGGGTTCTTACGTTTGACTTGGTTTGGTGAATAATGTCTATATGCTCATGATAAATGAATGCTGACATGAATAAACCTATG
AATTGCATTACTGAAATTAAAATCACACTAATATCACTGGTCCTTATATATGCATACATGTTGAATCAACTGAATCTTCTAAAATTGGTGACATACAAGC
AGGATCAGATCTTTGACTAAAGTCTTATTAATTTACATGGTTCTACACTTTGATAATCATGGCAATTTCTATCTATACATATTGAATTATTGGACTGAAG
ATCCCTAAAACTTGAATCTTGAAGTTAATAAATGATAATTTGTTTCTCTAAATAATTTACTACTAGTCTATATGTCCAGAATTTCATCTCTATATGATTT
ATTACATTAGAGTTATTGATAGATTATATTACTTACATTTGTTTTATTATGAGACTATGCTCTAAACATTTACTCTCCTTCACATAATAATCTGGTAAAG
AAACTTGCATGTTCTGTTAAGTCTTTACGATTTAGTACAACTATTATTACTTAACACTATACATGCTTAAATGTACATCCAGATTCATCCTATGATGTCT
TTTCTGAATTTTGTAGTAAAGAACTAGATACATATGCAAACCCAGATTCATAACCTACTAATTTCACATGCTATCCTTCAAATCAAACTATTAATAATTT
ATGATGTTTTCTCTATTAAATCAGGGTTGAGCTTCATTACTTTTAAATGAAATCAGATTCATAGACACAGATCCTAACCCTTCCAGGAATATGCACATGT
CAAGGTTATGCCCTGTTTGCATGACTAGAATATGAAAACTTACAAATTCTCATGCATGATCGGTTTCTTCTATACATGCTCTATTCCTAAATAATTTATA
TCATGAACACTAGTTGATTTATACAAGAATTACAGCTACACATGCTTATTCTATCAAGATTTCATATATTATAATTGATATACGTCTATATTAAGATTTA
AAGACATACATTTATCTTAAACTATAGCCTCCTAATTTTTGTCACTTATATTCATTTGGAATTTCTAAGGTTTTGGTCAGTATGGATGGTGCATATATCT
GTATGAAACTCTAGCTCTAACAAATGCTGTTACTATGAATGCAGGCTCTACTCTCCTTCCCTATTTTAATTTTTGGTTACCTCTGATGATTCTACAGTGA
TTGAAAAATATGTGGTTCAGCTCCTCCTTCAAAAATCCAAGTCTTCTCTTCTACTGCTGCTCTTCTGGATCTAAAGGTGATTTTGCTAGAACTAAGCTTC
TCCACCTTGAGCTTGGTTGATTGTTCCCCCTCTTGAACTGAACCCCCTGTTCTACTTGGAACTCAGGTAATTCTCCTCCTTGGCCCTTCCTCTACTGGTA
ATACTTGACTGCTTCCTGACATCTTTCTTGATCTGCTACTGGTGATTCTCTTCCTCCTCTTGAGACTGATCCTCTTGCTTGATTATTGCTGCTCTATCTT
GCTTCCTAACCTTGGTAACATCTTCTCCAAGAGCTGAAACCCCTGTTCATCCAAGAACAGAACACCCTGCTTCTCCTTTTACTCCTCTGACCTCCCTCTC
TCTCTCTCTTCCTGATTGTTTTTACTATGGATACTATGCAGCTATGGTTAATTGATGTATTGGTTTGTGCTGGATTTCACTGAGCTGCTCCTCTCTCGAA
TGAACTACTCCCTCCTTCCAAAAAAAGACAAACCCTGGTTTCCGTGTCCAACGTTTGACCGTCCGTTTTATTTAAAAAAATTATGAAAAAAATTAAAAAG
ATAAGTCACGCATAAAGTATTAATCATGTTTTATCATTTAACAACAATGAAAATACTAATTATAAAAATTTTCATATAAGACGGACAGTCAAACGTTGGC
ACGGAAACCCAGGGTTTATCTTTTTTTTTTTGGGATGGACGGAGTAACTCTCTAGCTAAGCTACTTGCTACTACAGCTGTTGTTGCTCTTCTTAGCTGAG
CCATACTACTCTACTACTGTTGCAACTGCTGCTAATGCTGTTCCTCGAGGTCGTCTCCCAGCCAAAGCAACATGATGGCTAGTCTACTAGCTTGGCTAAT
ATTTGTATGTAATTTGTGAGGGCATGGTGATGCAGCTGCCTGCATGTCGGTTTGGAAAAGGACTTGCTGCCACCTCATCTTTCACCTAATCAATTTGGGG
TGAAAAAAGTAATTTCCTCTTTGATGTCATTTTGGTGATTACATGGAACCTAAAGTCAGTAAATTAGAAACTATTAAGAGCGGCGTTATAATTACAGCAG
GAAGTTGGTTTAACACGTGTACTTATGGAATTCTTACATTCTAGTCCTTAAGGTTTTATAATATTTAAGATTTTACTAGAGCTCGAGGACTGATTTGTAA
TTGCTCTATGACTGAAGAGTTTTTCTGAAAAATAAATAATTATTGAATCTTTGACTGAGATGTTTCAGTTTATGATATGGTGTCTATAAGCACCTTGTAT
ATGCACAATATATGTGATGCATACTGTATAAGATTTCTAGAGTACAATTATATGCATGTATGTATGCAGACCTGTAGTGGTAAATTGTAAATAAAGAGCT
GTGGTTTCTACTGTGCACATGTGTACCTCGCTTCGTGACGACTAATCTATGCTATAATTTA