Detailed information on CNT30371012


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONOSAT000968, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30694161Oryza glumipatulaOryza sativa26.2794.4592.38800forward
CNT30554953Oryza glumipatulaOryza glaberrima36.1289.3698.361100forward
CNT30596243Oryza glumipatulaOryza meridionalis17.0893.6990.96520reverse complement
CNT30103630Oryza glumipatulaOryza rufipogon15.99100.2191.79487reverse complement
CNT30576894Oryza glumipatulaOryza barthii26.0496.9491.8793forward
CNT30115482Oryza glumipatulaOryza nivara16.5883.8993.47505reverse complement

Expression of CNT30371012

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (74 aa)
MVGCEHMVLKVVLMTIKDRFVSYCGEKSVGVAGESMPLVIFIEGVIMMQEWCTVMSCVVRGVLSQFLSEVPWWY*

>peptide 2 (42 aa)
MMDLYIKLLVCVPRLIPGRGFYAQISSKITSEFPGVTEIYLP*

>peptide 3 (43 aa)
MFFVISLTPLTIIIDAITGNNLLSSWFGVRSVQPGMVVQDGWA*

>peptide 4 (65 aa)
MLLLQMSLYYAILWYPCALAYLLCGLRSMSYAHLAIINQPQLKKKDPEGEDVWLIPQLSCLWEWS*

>peptide 5 (73 aa)
QRAAKRAAAGGAPCGRLMPHGLMPCRCPLSRFSSARSRGHGGEPRPCAAHGRQARGRLETMARTPPSAAMAAA*

>peptide 6 (50 aa)
MKLSLLLALALIWKSLLFASPLLIQVSLDLCLILILFKAASPSTLLLRME*

>peptide 7 (45 aa)
MPKCSIMVFRLDNSWAVGCKKKATSSAKREVLNLKGPPLSGDKIP*

>peptide 8 (49 aa)
MSPGGVNLFLCYGHFALITLFLDTTGNKLISLNLIYWFGSVKCYIYIIA*

>peptide 9 (51 aa)
MVHCDELCCARGTVTVPFRGTVVVLRRMVTCRGAVSCGYSGTPLARVKLFE*

>peptide 10 (57 aa)
TRSEEGCGRRRPVRQADAARSDAVPVPTVPVLLRAQPGPRRRASTLRGPREAGARPA*

>peptide 11 (49 aa)
MYCQLTESNAFEMSSLSNKVGVFLLCSLLTGFCTYMKLSCIALFLMKAL*

>peptide 12 (35 aa)
MKLRGSIANKNSNGERGSPCLKPLSTLNCLAWASI*

>peptide 13 (32 aa)
MQSLDRVLHIHEVVMYSSLPYESTLISGNHLL*

>peptide 14 (40 aa)
MLILYLNSLFISTVYLFSNVTGWCEPIPLLWPLCIDYSIP*

>peptide 15 (37 aa)
MSWSCVLWVQWYTSGQSKTIRIAVPAVMDELSNVFRD*

Sequence

>CNT30371012
CAACGCGCAGCGAAGAGGGCTGCGGCCGGCGGCGCCCCGTGCGGCAGGCTGATGCCGCACGGTCTGATGCCGTGCCGGTGCCCACTGTCCCGGTTCTCCT
CCGCGCGCAGCCGGGGCCACGGCGGCGAGCCTCGACCTTGCGCGGCCCACGGGAGGCAGGCGCGAGGCCGGCTTGAGACGATGGCGAGGACGCCACCGAG
CGCGGCGATGGCAGCGGCATAACATAATGCCGCTTGTCGTTTTCGTCGTTGCGAAGGTTCGTGAGTGCGTCGGAAGTGTTCAAGAAGATTAATTGAAGAC
CGATTATTGCAAGACAAGTCACACAGATCCCAAACAAAATCCTTTGAGCATGTTGATCCTATATTTAAATTCTCTATTTATTTCAACTGTGTATTTATTT
TCGAATGTCACCGGGTGGTGTGAACCTATTCCTTTGTTATGGCCACTTTGCATTGATTACTCTATTCCTTGATACCACGGGTAATAAATTGATTAGCTTG
AACCTTATATATTGGTTTGGTTCAGTTAAATGCTATATATATATAATTGCTTAGCCATGCTTAGAAACATTAGCTCATTAATGGGATGAATCATACTACA
TTATTATTTATGATTATATTTAATGGTATCTCACGATGGTTAATCGTGTTATGATAATTAATTGATAATTAAAACTTGTCAATGGTGGGTTGTGAGCACA
TGGTTTTGAAGGTCGTGCTCATGACAATTAAGGACCGGTTCGTGAGCTACTGCGGCGAGAAGTCCGTGGGGGTCGCTGGGGAGTCCATGCCTCTGGTTAT
ATTTATAGAGGGGGTGATTATGATGCAGGAATGGTGCACTGTGATGAGTTGTGTTGTGCGAGGGGTACTGTCACAGTTCCTTTCCGAGGTACCGTGGTGG
TATTGAGGCGCATGGTGACATGTCGTGGAGCTGTGTCTTGTGGGTACAGTGGTACACCTCTGGCCAGAGTAAAACTATTCGAATAGCCGTGCCCGCGGTC
ATGGACGAGTTGAGCAATGTTTTTCGTGATTAGTCTCACACCTCTCACAATAATTATTGATGCTATAACTGGTAATAATTTACTTAGCTCCTGGTTTGGA
GTTAGATCTGTACAGCCGGGTATGGTTGTTCAGGATGGTTGGGCCTGAGCAGCATGGGTGTGTTGTTCAGTGTTGAATAACATTGATTAATTACTCTACT
GTTTTTCAATTCTCAAATGTTTGTTAAATGCTGCTTTTGCAAATGAGCCTATATTATGCCATTCTTTGGTATCCTTGTGCACTTGCATATTTGCTGTGTG
GCTTGCGGAGTATGTCATATGCTCACCTTGCAATAATCAATCAACCTCAGTTGAAGAAAAAGGATCCAGAAGGAGAAGACGTTTGGCTTATACCCCAGTT
GAGCTGCCTGTGGGAGTGGAGCTGAAGCCATCGCTAAACCGTTATTCGGCTGCTGTTTTTCTTTTGGTTTGTAAGTATGTAACGTTATTATAATGATGGA
TTTGTATATTAAATTGTTAGTTTGTGTACCTCGGCTGATTCCTGGACGAGGATTCTATGCACAAATTAGTTCGAAAATTACTAGTGAATTTCCGGGCGTG
ACAGAAATCTACCTTCCATAGTTTTCTAAGGTGAAGAGGTAGGCCCAAGTAACTGGTTGGGAAGCCTTGAACAGCTCCCAGGAAATCCAGCAACAACTGT
TGCACATCAATGTTTTCACAAGCAATTGAGAGAATTTGAGTTTTGTGCGCATTGTTCTTGAGACCAGTTGCTATGCCAAAGTGTTCCATAATGGTTTTTA
GATTGGATAATTCCTGGGCTGTTGGGTGCAAGAAGAAAGCTACATCATCTGCAAAGAGAGAGGTTCTAAACCTCAAAGGTCCACCATTGAGTGGGGATAA
GATTCCGTGATGCTCAGCTTGTTTTATAATGAAGTTAAGGGGCTCCATTGCTAATAAAAATAGTAATGGTGAGAGAGGATCTCCCTGTCTTAAACCCCTT
AGCACGTTGAATTGCTTGGCCTGGGCATCCATTTAGGATGATCTTAGAGGTTGAAGTTAAAGAGTGAAGACATCCAGTTTCTCCATCTTAGCCCAAAGCC
AAAAGTTGTTAGCACCTCTGTTATGTATTGCCAACTTACAGAGTCGAATGCCTTTGAGATGTCAAGTTTGAGCAACAAGGTGGGTGTTTTCCTTCTATGC
AGTCTCTTGACCGGGTTTTGCACATACATGAAGTTGTCATGTATAGCTCTCTTCCTTATGAAAGCACTCTGATTAGTGGAAACCATCTCTTGTAATATTG
GTGCTAGTCTATTTGCCAAGATTTTTTATATTATTTTAGCAAAACTATGAATTAGATTTATGGGCCTGTAATGATCTGCCGATGAGGCATCGCCCTTCTT
TGGCAACAGACCGATGTGAGCACTATTTAATTCCTCAAGCTAGTTTTGATTTAGGTCGGTAAAGAATTTTATTGCATTGAACAGGTCCAGCTTGATGCGA
TCCCAACATCTTTTGTAAAAGGCGCCAATGAAACCATCAGGCCAGGGGCTTTTTTAGATGGCATCGATTTTAAAGCCTGCTCTACCTCTTCCATTGTAAT
GTCATCTTCTTGATCCTGCAAGTCAAAACTGTTCACTCCCAGGTTTTGCCAGTTGAGTGAGAAAACTCTGTTATGCACCGTTCCAAGCCTTTTGTAGAAG
TATGAGAATATTTTTTCCTCTTTTTCCTGGTTTGAGGTGGCAATTCCATTTTCAGTTTGCAAGGATTAGATGAAATTGTCCCTTCTTCTTGCACTGGCTT
TGATATGGAAAAGCTTATTGTTTGCGTCCCCTCTCCTAATCCAAGTTAGTCTCGATCTTTGCCTAATTTTGATTCTGTTTAAGGCCGCTAGTCCCAGCAC
TTTGCTTTTGAGAATGGAATAAAAAGTTCTCTCGTCTGTGGATAGGTTTCTACTTTCCTGGGCCAAGTCTAGTTGGAAGATGACTTCATTTGCAATTGCA
AGTTGAAGTTTAATGTCACCAACCTGCTTTGACTCCCATCTTTTT