Detailed information on CNT30327413


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P10978|POLX_TOBAC, E-value = 1e-130

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30327413

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (41 aa)
MCAISFAIMGDCLPKSLKCGANRVTTDLALCIPNLAIACSM*

>peptide 2 (64 aa)
MSRKRYHPTKSSGFYFRKSSNQPLYSRFTKETRIESEISQQSEIYILPLISSRTELSREPTSNS*

>peptide 3 (64 aa)
MLYVAFLTQEQSPIHPFSPNLHTQYFSCNTHILHLELFTKLRFQTIYLHPALQSNKHVIHIQKR*

>peptide 4 (74 aa)
MYLGWALGPLHMSTLLFIILHLVHHLINLKFWTNTRRTQRTSPERSETPNQDKPGQTSYAALPRLPTYPPLGSS*

>peptide 5 (65 aa)
MVRRLTSCVRRHKMNSCDSDSGIHHLLSVSSRVREPIGNFGCLQIPPPKCYSLVSFIDEPEILWI*

>peptide 6 (54 aa)
MSFSDMIERHLAIFMTHGPFYTFRSSTNFSLYILVFQHVPSTVLPSSFNLTSMF*

>peptide 7 (49 aa)
MWFEKLAYVDGEGEGRFHYEENTDYLYNPQARLKKEALIFTQKKLTSLL*

>peptide 8 (46 aa)
MNSITIGRRVTPACRESDITRQKALAFIFAKAQTNLYIPVSQRKQE*

>peptide 9 (40 aa)
MPHYTYTRTFSLFYMLVGSFLTPLGFACPRLGNCSFFAVF*

>peptide 10 (54 aa)
MVVLTIRVAGPTIKADSSADMDLILKLLDTRVTRPVNKTGASMTFAYIGFMVNS*

>peptide 11 (30 aa)
MKVLGCIYRFQEPYIRIRTVDPLLPLVEAT*

>peptide 12 (31 aa)
MAMYSVSIVESVTIACNIDRPLTGAPCILNT*

>peptide 13 (33 aa)
MHKHTFLFEPRTYLPIQDMNIYIIHNIDIIILG*

>peptide 14 (34 aa)
MSSTYKKDRYNHLREASECKHNNHNDFEKIHASA*

>peptide 15 (36 aa)
MKNIYLVIEHNNSSIGFSCNYNYNFFSFCKTNLWSN*

>peptide 16 (39 aa)
MPQTRELFFLRSILSIARSRLSGSDHRSFHSVLHFTCFR*

Sequence

>CNT30327413
GAAATAAGGGTCCATCCTGACTTGAAGCCGTGTTCCTGGGACGGTTTACGGGAAACCAACTTATATACATGAAATATTCTTCTCTAATTCAAATATCATC
TAAATAATAATAATGTGCTTGTGTGTCTTACAGGAAACCAACTTGTTTGATATTGATTATTAGCATTTTTTTATCCTCTTTAATTTAGTTTTCATTTTTT
CTTTATCTATGCCACATTACACGTACACGCGCACATTTTCTTTATTTTACATGCTTGTTGGGAGTTTTCTGACTCCCCTGGGGTTTGCATGCCCCAGACT
AGGGAACTGTTCTTTCTTCGCAGTATTCTGAGTATTGCGAGGAGCAGGCTCAGCGGTAGTGATCACCGTTCATTCCATTCAGTTCTCCATTTCACTTGTT
TTAGGTAGTTATTTGATTGAGACTTTCCTGTAATCTCTTGTAGAACTTCAGTCTATGAATGTTTTCTTTCTTCCATTTTGGATAGTTGTGGACTCGTCAT
AGACCTCTGAAATTTTTAGATATTTCTTTATCTAGCAGTTTTCTTTTATCCCGATTACATGGTCTATGGTATAGTTTTGGTTTTATATTGATATACAGGA
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CATACTAGTATTTCAGCACGTGCCAAGCACAGTCTTACCGTCATCTTTCAATCTTACCTCCATGTTTTGATCTATTATTTACCAATAGACTATCCAAATG
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AAATAATATGTGTAATATTCAATCTAAGAACATCCACAACATGCATTGAATAGTTCATGTTTTGGACATGTTAAACAAAAAAGTACCCAAAATCATGACA
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ACATGCTTTCAGTATATTGAACATTATAAATAATAAATTCTATATCAACTGCTGCAAATTTTGAATTAGAGTGGTCTACTATTAGCAACTCAAAACTATG
AAACATTACCACATAATAAATTGCAAATTTTGAATTAGAGTGGTCTACTATTAGCAACTCAAAACTATGAAACATTACCACATAATAAATGCACACAGAT
ATAAACATAACAGCACACTGTTTGTTGCATGAAAAATATATATTTGGTAATAGAACATAATAATAGTTCTATAGGGTTTAGTTGCAACTACAATTATAAT
TTTTTTTCTTTTTGTAAAACTAACTTGTGGTCAAATTAGGACATTTGTAAATAATATCTTATACAAACATTGCATTAAGGTTCATAGATTTTTCTTATTT
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TGATTAAAAATATTATTTGAAAAATGAAATAGCTTGAGACAAATTCATCAATATAAAAACTAAATTGGAAATGAATTCGATTACTATTGGGCGCAGAGTC
ACGCCCGCATGTCGCGAAAGCGATATCACCCGACAAAAAGCTCTGGCTTTTATTTTCGCAAAAGCTCAAACCAACCTCTATATTCCCGTTTCACAAAGGA
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TAACACCCACAAAACAGTAAAGACACGAGATTTATGTGGTTCGAAAAACTTGCCTACGTCGACGGGGAAGGGGAGGGGAGATTCCACTATGAGGAGAACA
CCGACTACTTGTACAATCCACAAGCTCGTCTCAAAAAAGAAGCTTTGATTTTTACCCAAAAGAAATTGACCTCTCTCTTGTAAAATCCCTCAAAGCTGTC
TCTTTTTCTCTCCTCAAGATCTTTGATCTCAGATCTAACCCTCCTGAAAACTCCTCAAATAACTGCCAACTACGCTGCCAACTACGCTCTATTTTTTTTT
GTTGAACCTAGGAACGTCGAAACAGATCTATTTATTAGGAGAGAAATAGCAGATCTCACTGTCTCGGGTGTGGCCCCCACTGTCGAGACGTGTGGCCACG
AGATACATGTATTACTATACATGTATCTCGGGTGGGCCCTGGGCCCGCTGCACATGTCTACTCTACTTTTCATAATTCTTCACCTCGTACATCATTTGAT
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GCTTTACCGCGGCTACCTACGTACCCTCCACTAGGATCAAGCTAACCGTAGTTCAAGATTTGTTCTCCATATAGTCTCCACCTTACCCCATCACCGCCCC
AAAGGGCCATGCCCTCTTGAGTAAATCAACACGGGCTGATTTGAAGCAAGTCCAAGCAATGGTTAAACTTACTACATGTGACCATCTTGGTTAACATGTC
TGCGGGATTCTCATTCGTGTGCACATTCATGTGAGAAATATCACCTTCCTCTATGACATCCTACACGAAATGATATCTGACATTTATATGCTTGGTACGA
GCATGATGGACTTGATTTTTTGCCAAGTGAATCGCATTCTGACTGTCACACCATAAGTTCACGTTCTCTTGCTCAATCCCCAAATCGTCTAGAAGACCCC
ACAACTACAATGCTTCCTTCACTCCCTCTGCCATGGCCATGTACTCGGTCTCTATAGTGGAAAGTGTCACTATAGCCTGTAACATCGATCGCCCACTAAC
TGGAGCCCCATGTATCCTGAATACATAACCAGTAGTAGATCGTCGTCTATCTAGATCGCCCGCATAATCTGAATCAACAAACCCATCAATCTGACATGTA
TCTCTACAAAGCACAGACCCGTATCAACGGTACCCTTTAAGTACTTTAGGATCCACTTTACTGCTTCCTAATGTGCCTTTCCCGGATTCGCCATGAATCT
GCTGACCGCACTGACCGCCTGTGAAATATCTGGGCGTGTACACACTATTGCATAAATCAAGCTACCAACTGCACTACAATAAGGTACACGCTCCATGTGT
GCCATCTCTTTCGCTATAATGGGAGATTGTTTACCTAAAAGCCTAAAGTGTGGAGCTAATAGAGTCACCACCGACTTAGCACTTTGCATCCCGAACCTCG
CGATCGCATGCTCTATGTAGCCTTTCTGACTCAAGAACAATCGCCGATTCACCCGTTCTCTCCTAATCTCCATACCCAGTATTTTTCTTGCAACACCCAT
ATCCTTCATCTCGAACTCTTTACCAAGTTGAGATTTCAGACTATCTATCTCCATCCCGCTCTTCAAAGCAATAAGCATGTCATCCACATACAAAAAAGAT
AGATATAATCACCTCCGCGAAGCTTCCGAATGTAAACACAACAATCATAATGACTTCGAAAAAATCCATGCCTCAGCATGAAGGAGTCAAATCGCTTGTA
CCACTGTCAAGGAGATTGTTTTAATCCATAGAGTGACTTCCTCAAGTAACACACATGATTCTCCTTGTCCTCAACCTTGTAGCCCTCAGGTTGATGCATA
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TAGAAGTGTGTTTCATCACAGGAGAAAATATCTCATTGTAATTCACACCCTCTCTTTGTGCAAACCCTTTAGCCACTAGCCTCGCCTTGTACCTTGTACC
ACCAAGCTCTGAAGGATCTTCCTTTCTCTTATACACCCACTTATAACTAATAGCTTTTCTTCCTACAGGCAATGGGACCACCTTCCTGTTAGTTCTCATG
TTATGAGACTACATCTCTGTTTGGGGAGAAAATTGGTTTCTTCATTGAGGTACTCATTACAACTTCAGTCATTACAATAAAAATACAAAAAGATAGTCTT
TTTATAAGACTTTTACACAATAAAAATATAATTCTCGTCAAACAGCACAGAGATCATTTATCGGTCTTCTGCTTATGTGGGATCTTGGCCTGTGACGAGG
ACGTTGATATCCGTGAACCACCAAACAATCAGATCAAATTCGGAACTTCGTCGATTCGTGAAGGAATCAAGAAGCCAAAGCGCTTATCTCGGCAATAGCG
AGATAATTACTCTTCTTAAGATCACCATAATGGGGTAATCTTAAGGGACGAACTGGGCTGCAGATCTGACGAACTCCTCTTCTTTATGCCAAAGAATCCA
CTGAAGTCTCCTCCTCCTCTCTGAAATTTGTGGCTCTTCAGTCCTCAATCCGGCAGGGCTTCGCCAACGCTCGAGAATTCTATATCTCCAAAAATGAAGG
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CAGTTGGGGTAAATCCAGGCAGTTAACGATCGGAAAAAACAACCAAAATCAGTATTTTTTATATTGGAGACACTTCTAATGTATTGGAGACACTTCTAAT
GTATTGGAGACACTTCTGATGTATTGGAAACACTTCTGAGTATCTTGGAGATACTTCTGATGTATTGGAGACACTTCTGAGTCACCACGAGGTGTCTCAG
TTTGGCTTTTTTCGGTTTTGGTTCGCCAAGTTTGTTTCTACCGTAAATTCGTTGTTCAGACTCGGAATTACGTGGTTCAATATGTGTTGGAAAGCCGATG
AGGAGATCTACAAGCTCACATAATTGAATTTATGGAGTAAATGGGACGCGAGTGATGCTCCACCTTTCATAAATGATGCGGGGCTCCTGATCAGGTCTTA
TTCCCGTTATTTTGAAGTTTCGTTGCTTCGTATGGTTCGTCGACTCACTTCATGTGTTCGTCGTCATAAAATGAACTCATGTGACTCGGATAGCGGCATT
CATCATCTTCTCTCTGTCTCGAGCCGTGTGCGGGAACCTATAGGTAATTTTGGATGCCTACAGATACCCCCTCCAAAGTGTTACAGTCTCGTTTCTTTTA
TAGATGAGCCTGAAATACTTTGGATATGATCGGTCCAACCTTCAGTTAAAAGGACCTGTTATTAGCTTTGATTCTTGACTCTTTTGATTTTTAATCTATT
TGATATTTTGACGAATAGCTGAAGTTCTCCCGGCGCTGTGTTTATTGTCTGACCGTCGTTAAAATCTTGAATCAAAACCGATGAGTTGATTTTGGCTCGT
ATCGTCAAGTTGACTTTGAACTGACTATCTCTATCATGATATATTGATTCGCATTGACTTTTATCATAACGCGTTGACTGGTGTTGACCTAGGGTTGCGC
GTTGACCAGCGTTAACCTAGGGTTTCGAATCACCCGATGTTGACTTTTTTATCGTAACGCGTTGACTGACATTGATCTAGCGTTACGCGCTGACCGGCGT
TAACCTAGGGTTTCGAATCTACCGGTATTGACTTTTTTATCACAACGCATTGACTTGCGTTGACCTAGGATTATGCGTTGACCGGTGTTGACCTAGGGTT
TCGGATCGCCCAACGTTAACATAGTTTATACTCGTACGTTTGCTGGAGTATACACAGTTTAAGCTCTTAAGGTATTAGAGCATGGTAGTCCTAACAATTA
GGGTTGCAGGACCAACTATCAAAGCTGATTCATCTGCAGATATGGATCTTATCCTGAAGTTGTTGGATACTCGAGTCACAAGACCAGTTAATAAAACTGG
TGCGTCAATGACTTTTGCATATATAGGATTTATGGTAAACTCTTAGCTATCAACGGATTTGATGAGCCTTTACCTACTACCGTTTGAGTCGGGCTAACAT
GCAGATTGTTTAAATCCATTCTGCATGTAACGTTATGCTAAAAGAGTTAACTCCTTTAGTGCTACGATATTGAATACATAGACTTCATCTTTCTTACGGG
AA