Detailed information on CNT30319320


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|O65278|ULP1B_ARATH, E-value = 9e-06

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30238074Asparagus officinalisBrassica oleracea3.2629.3985.7177forward

Expression of CNT30319320

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (39 aa)
MSSKNAPSRINRSIIIFEIFSLRISYGELLWFSGDGEGR*

>peptide 2 (40 aa)
MRLQGSTGQLSYSKFFLLESVMGNFYGFQVMEKVVKKISD*

>peptide 3 (64 aa)
EKKNLKLGFLLGTWKSLLSPKGSKRNQTNSSPLLIAPSSSNPRALKAYLSLPRKRPLQSSQLIS*

>peptide 4 (32 aa)
MDLEDDSFHFIFFASLANGLINFIFYFCCHLD*

>peptide 5 (34 aa)
MGQPLFSFLHFTHSKVFLMITILISYLNLHYVVL*

>peptide 6 (36 aa)
MFVFEARYSYKRLVCIILFAEVKYASRENSSIKIHD*

>peptide 7 (38 aa)
MDLILFSLYNVFILMYHLLACLRQTLAYCGFVFSLDFF*

>peptide 8 (29 aa)
MYDTLPKLLLYICQLLKYINILLLVFCLR*

Sequence

>CNT30319320
GGAAAAAAAAAATCTAAAATTAGGGTTTTTGTTGGGTACCTGGAAGAGCCTGCTCAGCCCTAAAGGATCTAAAAGAAATCAAACTAATTCTTCACCTCTT
CTCATAGCACCGTCGAGCTCCAATCCTCGAGCCCTAAAAGCCTATCTCTCTCTTCCCCGCAAAAGACCTCTCCAGAGTTCTCAGCTCATCAGCTGAGGTA
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GCACACCACAAACAGTAAAAAAATAGGCTTTTGACTCCAAAGACCTCGAAGACAAAGACGACAAGGGGTCATTAATGCAGTAAGATGAGAATTATTGTTC
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GAATCAGTTATGGGGAACTTCTATGGTTTTCAGGTGATGGAGAAGGTCGTTAAGAAGATCTCGGACTAGGAAATTTCCTCGCCTAAATAATTCAATACCC
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AAAAATACATGATTGATTGTCACTATTACCCTAAATTAGACATTTATTGTGAAAAAGAAAGAAAATTTCCCAAATAAACCTTTATTACCCTAAATTACTC
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GTCCTGAGTCAAAAAATTAAGATTGCAAATGTTTGTGAGGTATGGATTTGATCCTTTTTAGCTTATATAACGTTTTCATATTAATGTATCATTTACTTGC
ATGTTTGAGGCAAACTCTTGCATATTGTGGTTTTGTTTTTAGTTTAGATTTTTTTTAAAAAAAGCCATTTTGTTGTTTTTTATGAACTTTTACTTAATTA
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CTGGCTCATACTGATACAAAGATTAATTAGTAAACAGTTTGTGGCTCAATCTCAGCAAAAGCAAAATCAACAGACCCAGACTCAACTGGGGGCATTAAGT
AAGCAGCCAAGAGCTCAGAGACCAACACAGCAATAAGAGGGACTCTCTTCAAGTTCTTCACAAGATCTTTTAGTAGTTAGTGTTAATAATTTTGCTTCTT
CCATTCTTTAATATGAATGTATGATACCTTACCAAAGCTTTTGCTATATATTTGTCAATTATTAAAATATATTAACATTTTACTTTTGGTATTCTGTTTA
AGATAAGGCTGATTAATGGAATCATTGATAGCTTATGGCAATGAAATCATATTTTGTATATTGCTACTGATGACAACATGTGCAAATTTCTAGGAGACAA
TAAGCTAATGTTGTATTGTACATTAGCTTTATCATAACTTTAAATCTTCTAGATTATATTTTTATTTTCTCTTGGCTCGATAAATTTAATAATGCATAAT
TCATTCTATTAATCCCCTTTCTTTCTTAGATCCTGTGATCGAAGTAGTCATATTCCTAAATGAATTGAAGGAATCGTCTTATTTGGGTGTACGGATGACA
CACTCAACACTCTTAAACCCTATGTAGTAGTAAACAAATTTGAAGAATTAATTCGGAAGAG