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Detailed information on CNT30270425


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30559435Chenopodium quinoaActinidia chinensis5.1820.690.7976forward

Expression of CNT30270425

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (57 aa)
MKNICGFITMILNKILGFFFSLIYKIFFNNFTVEKADQLAAIQVIFNFNFDWLRLYY*

>peptide 2 (44 aa)
FEMSCYPLLTINTPPSNSLYINTSTSMPSLHHNNPFHCFQSTQH*

>peptide 3 (46 aa)
IRNVMLPTTHYQHPSFQLPLYKHINQHAFSSPQQSISLFPIYSTLN*

>peptide 4 (35 aa)
MGLFVPVKCLLFFFGWSNFTFIFRKIHVFSSSTKL*

>peptide 5 (43 aa)
MVLFLHLFLCLKLCVLTLCLSPPPAYSFFYLPFSRLYLFLLCK*

>peptide 6 (33 aa)
MLEAMRAYSLSVSPARLLVFLSSFFSSLPVFAL*

Sequence

>CNT30270425
ATTCGAAATGTCATGCTACCCACTACTCACTATCAACACCCCTCCTTCCAACTCCCTCTATATAAACACATCAACCAGCATGCCTTCTCTTCACCACAAC
AATCCATTTCACTGTTTCCAATCTACTCAACACTAAATTAGGGCAATCTTTCTTCTATTAAATGCCCTAATTACCTAATTAGGGCATCCTTTCGGCGTAA
ATAACCAAACAAATGAATGGTAAGAGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTTCTTTTCTTGCATCTTTTCTTATGCTTGAAGCTATGCGTGCT
TACTCTCTGTCTGTCTCCCCCGCCCGCCTACTCGTTTTTCTATCTTCCTTTTTCTCGTCTTTACCTGTTTTTGCTCTGTAAATGAAAAATATTTGTGGTT
TTATTACCATGATATTGAATAAAATTTTAGGGTTTTTTTTTAGTTTAATTTACAAAATATTTTTTAATAATTTTACTGTAGAGAAGGCTGATCAGTTGGC
TGCAATCCAGGTAATATTTAATTTTAATTTTGATTGGTTAAGGTTGTACTATTAATTATTATATTTTGGAAATTAATTATTGGTGTTAGCTACTAAAAGT
TATTGTATTTTCAGCATAATATTGCAATTAATTTCATATGATTGTGCTTGATCTAATGATTAAAGAGCAAATGGAGATGGATCAAGTGATAATTAATCAA
GCGTGAAAATAGGGAAGCAAATCGAGCAGCAAATTAACGATTGCGATGTTATAGCTAGTCAAGGGTTTGCAATGGACTCAAGAACATGGACCATTAGCAA
CAACTTGTATGCCGTGAGGTTTTGTTTCCCAGAAAGTGTGTAGTCTTTTAAGTTGGACTAGGAGCATGCTTTAGCTTCTAATTAATGTTATTATGACCAA
ATTAAGGATTTTAATTATTTTTAGGGGCATAAAGAGCTACTAAATGTGACCAAATTAGAAATTCAAAATTCACGAATTATTTTTATAATTCTTATTGTTT
GGGTTGATTGAGATTTTCTGTGTAAGATATGTTCATGATTTCAGATTTAATTTTTAATATTTATGTAATTAGTTAGTTAATCTTTCTTCTAAATTTTACT
TTCCTTTTTTTGATGGGACTTTTTGTTCCTGTTAAATGTCTACTTTTTTTTTTTGGATGGTCAAACTTTACCTTTATCTTTAGGAAAATACATGTATTCT
CCTCATCTACAAAATTATAAAATAAAATTAAAATTAAAAGAAAGATAATATAAGATATTAAGAATAACCTACTCTCTCATTTACCCAAAAGAAGTATAAA
TATATTAAAAAAAAACCCTAATAAATACGGAAGAAATTAAAATGTTGGTTGTTTTAGGGAAGTTCAAAACCCTAGATGTAGTTGACTGATAAAAAGCTGA
TTAGGTATGAATGATTCGGTCAAAGAAAGAAGAGATGTAAGCTTAAGTTAATTGTACTCATCTAGAT