Detailed information on CNT30270085


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30201416Chenopodium quinoaPisum sativum2.721.0787.363reverse complement

Expression of CNT30270085

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (32 aa)
MNNIFNINSFKNYYVYENEDMCVLKRVLEPYV*

>peptide 2 (33 aa)
MSDLLGSFPGVRMSEDKMRRKDSCWSERTIVGP*

>peptide 3 (35 aa)
MEVAGDKEKRKKGRGRTGGRKTELGCSGIRENALG*

>peptide 4 (52 aa)
MIGSTQYTHLTDSDYLLLWLYLATHYITTIILLMIALKEFDILLISTKCISF*

>peptide 5 (29 aa)
VAFKVIHSSFSAYIDGGGCSLPLAGGMIW*

>peptide 6 (55 aa)
MLESSGFQVQRGRCRSQVGVYVIPLIIALKEFDILLISTRCIFFLGSSYVKILNS*

Sequence

>CNT30270085
GTGGCATTCAAGGTCATACATAGTTCCTTCTCCGCATACATAGATGGAGGAGGCTGCTCCTTACCCTTGGCTGGAGGAATGATATGGTGAAGGACCTTGG
TGAGACTTTGCATGAACCTTAAATAGCTCCGTCCAAGTAGAGTATTTAACATTTTCAGTTTCAAGGGTAATGGTAACATGATTCTTGATATTAGGAACGA
TAAGAGCTGGATTGAGGGATTATTTCGAATCCCCCATGGAAGTTGCTGGTGATAAGGAGAAGAGAAAGAAAGGTAGAGGAAGAACAGGTGGACGGAAAAC
AGAGCTAGGGTGCAGCGGAATCAGAGAGAATGCCCTAGGCTAACTGATACCATGAAAGATTTGGGGAATATTTTCCTTAACGATTATCACTAATCAACCG
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AAAAAAAAAAAGGACAGAGGGAGTAGTGATTAATTTAAACCTTGTAACCAAAAAAATGATGGTGGGAGATGTCTTGTATTCCAATGATGGAACATGATCG
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TTTAAAGGAGTTTGATATACTACTCATATCAACAAAGTGCATCTCCTTTTAGGAAGACCATATGCTAAGATACTCCATAGTTAAGTGTGCTTAGTTGAGA
GCAATCATGGGATGGGTGACTTCTTGGAAAGTTCCCCGGGGTGCGCATGAGTGAGGACAAAATTACGCCGGAAGGAATCGTGTTGGTATGTGAGGACAAT
TGTTGGCCCTTGATGCACATTTCGTGACAATAGGCCCCTCCCTAAGGGGACAGTTGTTGGCCCTTAATGCACATTTCGTGACAATAGTTCCCATTAGGCG
TAATGCTGGAGTCCTCAGGCTTCCAGGTGCAACGAGGGCGTTGTCGTTCTCAAGTGGGGGTGTATGTAATACCTCTCATTATTGCTTTAAAGGAGTTTGA
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AGCGACCTCTTGGGAAGTTTTCCCGGGGTGCGCATGAGTGAGGACAAAATGCGCCGGAAGGACTCGTGTTGGTCTGAGAGGACAATTGTTGGCCCTTGAT
GCACATTTCGTGACAACAAGCCCCTCCCTAATTTGTTTGGGGTCGGGGTGTTACAACAACATACTGCTGGTAATTAATCTAGGTTAACCCTTAGCGCATA
GCTGCTATTTGTTAGCTAGCAAATATATAGGATGGAAAAATGTACCAATATATGCATAATAGGTGACATGTGCTAAGTATTTTGGGGGAAAATATTAAAC
ATATAGGATGGTAAAAAGTATCACTACATGCATAATAGTACACAAAAAGTATTATTAAAATAACTTTTACTTTAATGGTACATTATACATGCATAATGGT
ACATTACGATATATTATAATGTACCACTATAGAGTTAGGTTTTTTCCAAAAGTTTGTTAGATTTACATTTTTGCCCTCCTATATGCTTTGTAAATGTATA
ACAGCTATGCGCCGAGAGTGAGTCATTAATCTATAGTCATTGATTGTACAGAAAAGACAATGAGGGTTCTTTCATAGAAATACTCCCCCTCCCCAAAATA
AAGATCAAGAGAAAATTAAATCAAAATCATTCATATCACAAGCCAAGTTAATGAGTTTAGACGTTTAATGGAAAGCTATAATAAATAGATGGAAAGAATA
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AGGTCTATACACACGCAACTGACTTTATATTGAACATAGTAACCATTATTTTTAACATAGTAACCTTATTTTTAACCTAGTAACCTTTATTAAAACTACT
ACAACGTTTAATAATATTGTGAACTTGAAATACG