Detailed information on CNT30267815


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3051979Chenopodium quinoaAmborella trichopoda5.9420.3485.71119forward

Expression of CNT30267815

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (72 aa)
MLFPGDIGFRVAVYFSFWVFPVVFFVLRRKWRIAVAREQEIYRLLVLASEEAARAEIEAIFHTIKAESLVKV*

>peptide 2 (83 aa)
MVRAHIDYHEVFSGSWYSHRFFSDSFFHKFIFATNGITSCKSFSNKGIKFVTVCVWYEKKTCMITLFGLKRARKKDCCYPRAG*

>peptide 3 (49 aa)
MQKEPIARALKQGKASKKRARPGESYRSRPRIGSLSKIRLKRFKSLCPM*

>peptide 4 (50 aa)
MDFETRIKEAQKESTALQMLIIFQLLDVSLYTTSCIPQILNFILTNSLAG*

>peptide 5 (42 aa)
KKGNDREEVRQCSLIYGMRWFACVYSLGFFFFFFNFFFNFFF*

>peptide 6 (46 aa)
MSLVLLIWCINALSRGYRVSRCCILQFLGFSGGILRSPAKMADCGG*

>peptide 7 (39 aa)
MKSFLVVGTVIGFSPIHSFTNSFLQLMVSPAVKAFLTKA*

Sequence

>CNT30267815
AAGAAAGGGAACGACAGAGAGGAGGTGAGACAATGTTCCTTGATTTATGGCATGAGATGGTTTGCATGTGTTTATAGTTTAGGTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTAATTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTAATTTTTTATAAATTTGGGGTGGAATGTCATTCAAGGTCTGATTTAATTTGGAAGAGGTATATTTGCTCTTTC
ATTATTTTACACCGTTATTGTGATTTTTGATTTGGATTTTTGTTTATTTACTCCTAATTTTCTCTCTCTTCACTCCAAACGACATTTTTAATCTGCATGT
AAGCTTTGCAAATACCTGTAATTCATCTTCATTGTTGAAGATTATGGTGTTGACTTTATCAATTAACTGGTGGTGAAATAGTTTATGAGTTTCGGAAATC
GAGGAATAAATTGGGGGAAATTTTTATAGGGTTTTTCGAAGCTATGTTATTGTGATGTCATTAGTTTTATTAATTTGGTGCATAAATGCTCTTTCCCGGG
GATATAGGGTTTCGCGTTGCTGTATACTTCAGTTTTTGGGTTTTTCCGGTGGTATTCTTCGTTCTCCGGCGAAAATGGCGGATTGCGGTGGCTAGAGAGC
AGGAGATCTATCGATTGCTTGTTTTGGCATCAGAAGAGGCTGCTCGAGCTGAGATTGAGGCTATTTTTCACACAATTAAGGCTGAATCTCTTGTCAAAGT
TTAGCAAGATATGAGAGATACCAGGTCTCGGTTCTCAAACCGAGATTTCATTTGCTGGAACTTTTGTTGGCAGTGCTATTGCTGCTTAGTTTGCTGAGAA
ATTGATTGGCTTCATTAGCTCCCATGTTCCGTCTATCTGCAAAGTACTCCGTTCTTTATTAGTGTACTGAATTTTTGAATGTGTATTGGGAATTTGGGAT
TCCTATCCTCGAAACATGCAAAAAGAGCCAATTGCAAGGGCACTTAAACAGGGTAAGGCTAGCAAGAAGAGAGCAAGACCTGGTGAAAGTTATAGGTCTC
GGCCTAGAATAGGCAGTTTATCCAAGATTAGATTAAAGAGATTCAAGAGCTTGTGCCCAATGTAGCAAAGTCGATAACATCTTCACCGTCTAAAGTACCG
ATGAGTCAGAGAACACCATGCATTGATGGATGGTGAGGGCCCATATTGACTATCATGAAGTCTTTTCTGGTAGTTGGTACAGTCATAGGTTTTTCTCCGA
TTCATTCTTTCACAAATTCATTTTTGCAACTAATGGTATCACCAGCTGTAAAAGCTTTTCTAACAAAGGCATAAAGTTTGTGACAGTTTGTGTGTGGTAT
GAAAAGAAGACATGCATGATCACCCTTTTTGGTTTGAAAAGGGCTCGTAAAAAGGATTGCTGCTATCCTAGAGCCGGCTGATGAAATTGGATAAATAGGT
AAATGGTGATATCAATGAGGAAGAGATCACTTAAGAGGCAGGAGATATAGTTGAGAGAATTTGAAGAGAGTAATGAAACATACCAATTAATTAAACAAGA
TTCAGCTATTCAAGAGGCACATTTATGGAAGATTGAGCTTGGGAAGGCTAGAGAACGTAATGTAATATTAGAAGGTTGTGAGAGCAGAGAAGGGTGAGGA
TTACAAAAATGGATTTTGAAACCAGGATAAAAGAAGCACAGAAGGAATCAACAGCTTTGCAAATGCTCATTATATTTCAACTTTTGGATGTTTCACTATA
TACTACTTCATGTATCCCCCAAATTTTAAACTTCATCCTAACTAATTCTTTGGCCGGATGAGCTTAAGTTATGGGTCAGCTTAGAATAGCAAATAAGCTA
ATTTTGCAGTTTTTTCACAATTTTTATTAGTCCGTTTAGTTTAATCTCATTACAAGCATAGTCTCCAGTTAGAATTTAGTTTCCTATTTGATGCATTCCC
TCCATCCTTAATTTTTTGTCTCATTTCCAATATTTGGGTCAAATATTTAATACTTGACCATTAATTATCATTGATCTATAAGAGATGATATAGTAATGAG
GGA