Detailed information on CNT30264716


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P84989|PSBO_POPEU, E-value = 7e-18

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30264716

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (83 aa)
MCNFYKREKHRKHQKMFSLSSNTINRRCFDIDNMIITQVDHTTPLGSSHPLVPWHPSQYPRAEDSQTLQSLLLSQVCSWSLSE*

>peptide 2 (36 aa)
MILTHACRIYCKSILETFLVTECKDLYYTLLRIRPL*

>peptide 3 (51 aa)
MSRDLRPSTDTICFVYKLNSVLFSIHNPMHIKYRVRSIRSKLIRLNYLQKL*

>peptide 4 (51 aa)
MMHVFVAILICLYYCLILRFVVLVYWWWIIRKMELNILQNKMILDIEHVIR*

>peptide 5 (29 aa)
MCCPTLMQLSVFFHVTGSKTKHRHNMFCL*

>peptide 6 (31 aa)
MQRRCHILWIHHGPLGPRRTSHGTKGLRICQ*

>peptide 7 (70 aa)
MSLVFWKSGGAFLLTLSALTVKEVGSKQNFLPAYFPGLKEKVSEPPSMVGHWLAVPVPFTSMYVLLCISS*

Sequence

>CNT30264716
CTGATGTGTATGTTTCCTACGTCCCAATAGTCACTTTATTTGAATGATAAACTAATGGTTTGCAGATCTACTGGATACTGATCTGATCTCCCACGGTGGT
GACAGTCATATGCAAGGCCAACAATAGTTATTACATGAGGTGAAATTGGACAACAATACAGTTTTGCTTACGTAGTTCCATTTTTCAGCATGATGCATGT
TTTTGTCGCGATTTTAATTTGTCTTTATTACTGCCTTATTCTTAGGTTTGTAGTTTTAGTGTATTGGTGGTGGATTATCCGTAAGATGGAACTTAACATT
CTTCAAAACAAAATGATCTTGGATATAGAACATGTGATTAGATGATATTAACACACGCTTGTAGAATCTACTGTAAGAGTATCTTGGAAACTTTTTTGGT
TACTGAATGCAAAGACTTGTACTATACTTTGCTACGAATCCGACCTCTCTAGCTAGGATTTAAAATATAATTATGTCCCCGAGAAAATTAATCAAATCTT
ATTAATTATATACTAACTCCAGAGGTTTTAAACTTAAGAGAGAATCTGTCTGTGACCTGCATTGTTATGTGCTGTCCCACGCTAATGCAATTGTCTGTGT
TCTTTCATGTCACGGGATCTAAGACCAAGCACAGACACAATATGTTTTGTTTATAAGTTAAACAGTGTTTTGTTTAGTATTCACAACCCCATGCACATTA
AATACAGGGTAAGGTCCATAAGGAGCAAGCTGATTAGACTAAATTACTTACAGAAATTATGAAAATACTATTTCCACTTGCTACTCGCCAGTCTATTCTA
ACTAATTTCATTTAAATATACCACAAGCCTACCGTACAAACCAGCTAATTCAATCATTTGTATATTCACTAATTATCAACGTTATTTTATTGTTAACTTC
TAGTTTTAAGTTAACTAAATTGGAAACGAACCGAATATTTAATCCAAATTATTTACAAAAAGCCAGTTTGCAAACATCTTAGTTCATTGTAGCCACCGGT
TAATTAGGCTAAACATGTACATAGCTCATAAGCTCATAGCTCAAAGTTGATAGTTTGAAACCACACATTTTGTTATAAGGAGGAATGTGCAATTTTTATA
AGAGAGAAAAACATAGAAAGCATCAAAAGATGTTCTCATTATCATCGAATACAATTAACAGAAGATGTTTTGATATAGATAACATGATCATCACTCAAGT
TGACCATACCACACCCCTTGGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCCAAGTCAGTATCCGAGGGCTGAAGACTCTCAAACACTCCAATCACTTCTC
CTGTCTCAGGTTTGCTCTTGGTCACTTTCAGAGTGATCTCACCCACCGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTTTCCTTCGAAAGCTCCTCTTCGTCTCCTCT
GCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGGCCCTTTGGGTCCAAGAAGGACGAGCCACGGTACGAAGGGACTAAGAAT
TTGCCAGTGAAGCTGTCTGGTTTGCCTGAGGGTGTAGGTGAGACGGGTCATGAGCTTGGTGTTCTGGAAGTCAGGAGGTGCGTTCTTGCTAACACTCTCA
GCCTTGACGGTGAAGGAAGTAGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCGGCGTACTTTCCCGGTTTGAAGGAGAAAGTCTCAGAGCCACCGTCAATGGTTGGGC
ACTGGTTGGCAGTTCCAGTTCCCTTCACTTCCATGTATGTCTTGCTTTGTATCTCATCGTAAGTCAGTCTCTTCGGAGCTCCTTCTGCACTTGCTCCC