Detailed information on CNT30263765


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30235516Brassica rapaBrassica oleracea8.2565.1487.77327forward
CNT3077644Brassica rapaBrassica juncea26.8796.2199.811065forward
CNT30726873Brassica rapaLupinus angustifolius1.7422.1288.4169reverse complement

Expression of CNT30263765

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (46 aa)
MNQPSVFPWFQVAEDDRLIIRTFQCLYLHLSSHCYVFCFLRRCGFQ*

>peptide 2 (43 aa)
MMMKDMRQSQTKLGHQYVITCIQSFGNDIICKLLLNIFQNFRR*

>peptide 3 (64 aa)
MKSSPNNNDLFIIFIIRQFPYKIMVSSSIMLLRWWLPVTRLLCFWEAGNVRKVECSCGLTCSSL*

>peptide 4 (49 aa)
MFFVFFEGVGFNRKPVLPIYNIDRIQSDVLGFGETWGESWRIFSLMSII*

>peptide 5 (94 aa)
MVVTGYPTSLFLGGRQRQESGVLMWIDMLLLVKRYAYSFSVAYLFLFLTTHPTLLDEVLHVSSSLQSALLQGSIFAHRLNMFFERGFYLRPKWL*

>peptide 6 (35 aa)
ESKKNSRSNFSLTNRRHDITEIKNRWENQWLDLDG*

>peptide 7 (37 aa)
MITENRVYMLYDDERHEAKSNKTWAPVCNNMYPIIRQ*

>peptide 8 (39 aa)
MLQQKRGRSRNHARLSCLSYPYEEFSAFSEVLFALSSSAI

>peptide 9 (43 aa)
MFVLINLHTTDAYVRLDAYFSVPALMVKLATTHTLALPVLQSQ*

>peptide 10 (34 aa)
MRVFGGTGELRELVRCVGQRARSTCIRGRTSCFG*

Sequence

>CNT30263765
GGAAAGTAAAAAAAATTCTCGATCCAATTTTTCTTTGACGAATCGACGACACGATATTACAGAGATAAAGAACCGATGGGAGAATCAGTGGTTAGATCTT
GATGGATAGGGCGTTGGTGAAGATCGAAATTGTTGCTTGGTGAATGTTTCTCATGAATCGGAATCACGGTTGAATAAGATTGATCAGTGATTTGCTTGGT
CACTTAAGATCTCCGAGCAAAAACAACTTCCAACTTCTTAGATGGATGATAACAGAGAACAGAGTCTATATGTTGTATGATGATGAAAGACATGAGGCAA
AGTCAAACAAAACTTGGGCACCAGTATGTAATAACATGTATCCAATCATTCGGCAATGATATAATCTGTAAGTTACTATTAAACATTTTTCAGAATTTTA
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TTCTGCAACGTAGAACTTTTCCTAAAGTTCATTTTTCGTGTTAGAAATAATATATCAAATAATTTTAACAACAAAGATCATATGTTTGTTTCTGAGGCTT
CACATCCTCACCAAAAACTCACATTTCAATCAAAGTAAGAATCCTTCCCTTACTTTCAATGTAAGTCCTTTTGCATGTTGCATGAATTTTTTGCCCCTAA
AACATGTTACATATAAATTTAAAATCAGTAGCTAATCCCATCCTTTGTAAATAAGACATAATCGAGTAATAAATACAGGGAAAAACGCTTACAGTCTCAT
CAGCCAAGACGAATTCCATGGTCTCCACGGATTGAATGTAGTGCTTCCAAGCGTGTAGAACATTTACATGAACCAACCAAGTGTTTTTCCATGGTTTCAA
GTCGCCGAAGACGACCGATTGATCATTAGGACCTTTCAATGTTTGTATTTGCATCTTAGTAGCCATTGTTATGTTTTTTGTTTTCTTCGAAGGTGTGGGT
TTCAATAGAAAACCGGTGCTGCCTATTTATAATATTGATCGGATTCAAAGCGATGTGTTAGGTTTTGGAGAAACTTGGGGAGAAAGTTGGAGGATATTTT
CTTTAATGTCTATAATTTAAGATTAGTTTTGGAAAATTCAGTTACCATGTTAAATAGTTAAAATATTTTTCTGCGTGTTCCTCAAGTTGGGGGATTTCTT
TTTTTATTTGATTTGATTCCGTAAATCTCTGAGTACGAAATATGATTTTTCGCTACTGCATGGGCCTAAGAAAACGTAAATGTAAGTAGAAAATAGGTTG
GGCTTTTTTTGTCAATCGAATAACACTGAAAATAATTTAAATAGGGAATGAAATGTTTTGTAATTAATAGGAAATTTCAGGGGCAGATTCGTAAGAAGTA
TTCTGCTTTAATAGTATAGATTAGGGTTTTCTAAATTTAAGAATTTATTATAAATAGGCATTGAAGCCTAAAGTTGTATTCAGACTGATAATTAGTAAAC
TGGCTGTTTTGCTTTATACCTTGTTCGATTTGATTAAATTCATCAACCAGAAAGTTGGTCTCAAGAAACTATCGAAAGAAACTTTTGATTGATCTAATAA
CAGGTCTCTAAGAACCCTAAAGGTTACTTGATCGACCGTTCAACCTATTTGTCCGCTGCATGTAACCCCAATTTTCGGTTGTCTGATGCCCCCTCTCCAT
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TCTCGCTCGGCGCCTAAAGCGCACTATGCTCCGTTTTAACAAATGAGAGTTTTCGGTGGAACCGGTGAACTACGCGAGCTGGTTAGATGTGTGGGACAGA
GGGCTCGTAGTACCTGCATCAGAGGAAGAACAAGCTGCTTCGGATGAGAATGCTCCGAAGAAAGCACGTTTGGAAGAGTCCAATACTAGGACTTAAACAA
CCATGTCTTCTCTTTATCAAATAATGCATTAGCATCTCTCACTTTTCTTTTAATCTATTTCTTTTTTTTTTAAACTCAGTGTGGTAGTTGTTGTTTCGAT
TAGTGATAAAACATCTTTTCAATTTTGTTTAAATCTATTCCTCTTTTTTTATTCTAAAAAACTCAGCGTGGTGGCTGTGGTTCCAATTAGTAATGAAAAT
CATTTACAAAATAAAACATTTACATCACGTGTATCTGTAAAGTCAGTAATGCACTCTTGCATATAATGTGAGAACTTATTAAACCCCTAGTCTATCTATA
TCTCTTATATAATAAAGTAGATTATGCTCTCTCCTTAAGCTGTCCACATCAGCAAGGAGTGAGGGGCTTTTTTAGACACGTGTACAGCTTCCCCAAAAGC
TAATCTATATCATTTCGGTTTCTCTTTCGTTTGCGAAAACTCAACTCATCAAAATTGGCCCATTAAAATCGTTCAAAACGATGAAAATTAAATCCTTAAT
AATGGTCCGTTAAAATACTGCAAATAGACTCCACAAAACAAGCATGTAACAGGCCATTTAAGGCCCATCTCTACTTGCAAAGTTTCCGTCTTCTCTGTGT
CCTCTTTTGCAGTGCCGATGAGGATTCCTCTGTGGTAACTGGTAAGTAACTGCATCGCATTGAATCATTTCATTAAGCGCTTACATTAACTTCCTCAAGC
CACCTATCCCACTACGTCAAGTTCATAACCCCTCCACACCATCGATTTGATAATCCCTAATTCCTGATACTATAAATAAGTCATGAAATCCTCCCCTAAT
AACAATGATTTATTTATCATATTCATTATTAGACAGTTTCCTTACAAAATAATGGTGTCCTCTTCGATCATGCTCCTCAGATGGTGGTTACCGGTTACCC
GACTTCTCTGTTTTTGGGAGGCAGGCAACGTCAGGAAAGTGGAGTGCTCATGTGGATTGACATGCTCCTCCTTGTGAAAAGGTACGCCTATTCATTTTCG
GTCGCATATCTCTTCCTATTCTTAACTACTCACCCTACTTTACTTGACGAGGTTCTGCATGTTTCTTCCTCTTTACAGTCGGCACTTCTCCAAGGTTCCA
TCTTTGCACATCGTCTAAACATGTTCTTTGAAAGAGGATTTTATTTACGACCTAAGTGGCTTTGATGTAACGAGGGGCAACAACTACTTTAAGTTCAAAG
ATTCACCTGTAGCTATTCCATTCATCAACAACACTAAGTTTGTTGAACTCACTGTGGGACCACCTCCAATACCACTTGAGCTCTTTAGGTTCCATAGTTA
CGAGCAGCTACAGGCTCTGGAAAACACAAACACTGAGTTTCTCGGCCTGTTTCTGATTTTGTATTCAGTAAGTTCATTTCCGGTTAACATAACCACATTT
ATCTTATTTTCTCTTGCAGACATCATATGGGAAGTCAGTCTCATCAAGAAAACCTGCAATGACCCTGCTCACTCCTCAGACAATTCAACGCATTATGGCA
AACATTTGTATTGATGGGTACATCTCCTGTCTCAGAACTAATTAGTTGTTTTTAAATTATTTCTATTGCCTTTACGTAGTACCAATTTGCTACGAATTAG
CTATTACCAAATTATTTTATTGCTTTTCCATATTATTATGTTTGTGTTAATAAACTTACATACCACGGATGCATACGTTCGTCTAGATGCTTACTTTTCA
GTCCCTGCTCTGATGGTGAAGCTAGCTACAACACACACACTAGCATTACCTGTGTTGCAGTCCCAATGAACCAAACGGCTCCATCAACTGAAACCACAAC
AACTGCATAAGTCACTGTTGGCGATAGCTCAGCAACGGAACAACATGTTGCAGCAGAAGAGAGGGCGCTCAAGAAACCACGCAAGGCTTAGCTGCTTAAG
TTACCCATATGAAGAGTTCTCTGCATTTTCTGAAGTTTTATTTGCATTGTCTTCTTCAGCCATC