Detailed information on CNT30253313


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30184327Avena sativaSecale cereale1.3327.794.9259forward
CNT30587177Avena sativaMusa acuminata1.4920.1289.3966forward
CNT30459409Avena sativaSaccharum spontaneum1.6520.6295.8973forward
CNT30716144Avena sativaMalus domestica golden1.420.3987.162forward
CNT30583813Avena sativaEchinochloa crusgalli1.492089.3966forward

Expression of CNT30253313

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (47 aa)
MVVFFTAESIKDYHTCDFLASCAVAASSLLPPFARAISKIGTFVSFL*

>peptide 2 (89 aa)
MHVQYSRNSDNITCLVCSLYNKASCFENVECHGNVQLVPDRLRSVEVCYISRFLIKHTLLGILQFCILEKEYLPQFRNTCFVVLVFLLL*

>peptide 3 (73 aa)
MVGHWPFSYAELLKWGFMMKMRATVAADEFMKATAYRAYDQVPTAKGHAPQSSPKACRVPELSGLLIAITVRL*

>peptide 4 (29 aa)
GRTQPAAIGPGWCLELTEDSSNCRRRHQA*

>peptide 5 (30 aa)
MLYFFISVCITPVVLILRRSYCSPTGLFGM*

>peptide 6 (42 aa)
MSPCYNPVLLTWVKVEQLILFSEESHCQFPFQNSYYSVCYSL*

>peptide 7 (33 aa)
MMGLDCMHLKVWLFLLVVIVLCFGYLLAVQQIS*

>peptide 8 (35 aa)
MGAETSIPRLLAMKGLQPLNAVTSTSILVSSMYLC*

>peptide 9 (37 aa)
MRTFALNNNKTGHHVTAHLSASTLHLVLSSIHLNNPN*

>peptide 10 (36 aa)
MVVSNIVITIHHCFFSCRYLYQIRLICEGSWCSTLH*

>peptide 11 (36 aa)
MTFLVLMLRRLISSRFSKPWRPVTPRPESSSPINCL*

>peptide 12 (44 aa)
DAPSRPPLALDGAWSSRRIRVIAGGGTKHEVVTALLARKPQVRH*

>peptide 13 (38 aa)
MLNQNGMAFTCHCQVFCVSITCKIKMHTTNFATQIIPF*

>peptide 14 (30 aa)
MEQTLTTDHLVSADSASQITLFIYISTYTL*

>peptide 15 (30 aa)
MIKCQLPKDMPLNLRQKPVVFQSCLGFLLQ*

>peptide 16 (31 aa)
MHYSSGFDPEKELLFSNWPFWHVVLRAGKSC*

>peptide 17 (47 aa)
MAFPFGGYCVVFWVSFGCATDQLSQILAHFFFRIFMLQNTIMKQVDP*

Sequence

>CNT30253313
CGGACGCACCCAGCCGGCCGCCATTGGCCCTGGATGGTGCCTGGAGCTCACGGAGGATTCGAGTAATTGCAGGCGGCGGCACCAAGCATGAGGTAGTAAC
TGCATTACTTGCCAGGAAGCCGCAAGTAAGACACTGAAGCTGCATCACTTGTGGGAAAGACGCAAGTAAGACACCGGAACATGTTATATTTCTTCATCTC
AGTATGCATTACTCCAGTGGTTTTGATCCTGAGAAGGAGCTATTGTTCTCCAACTGGCCTTTTTGGCATGTAGTATTGAGAGCTGGGAAATCTTGTTAAG
TTAATTTTCATTGGGAGACATATTCGGTGCTGTAATACACCTTGGTGGAGCCTATCTTTCTTATCATATTTGTCCATGTTCGTAGATCTCGACTTGCCAG
CACCAACTTGAAGTATTAACCAGCATGACTATTGCTTTATAACAAGAACTAGACAAATCAATGACGATTATATTCGTTTATGAACTACATAACAGCTTCA
GTGTCATATGGGAGCAGAGACAAGCATTCCTAGGCTCCTAGCTATGAAGGGACTGCAACCTCTGAATGCAGTTACGAGCACTTCGATACTTGTTTCATCC
ATGTACCTCTGTTAAGTGATTTTACAGGTACCCCAGTGTCTCAAAAAGTTTTGAGCACTACAACAACTTAAGCACCTCTGTTAACCGCAACCACCATTAT
GTGAACCAATGAGGTATCATCTCGAACTTACCAACCCACAGAACCTTCCAAGCAAGCTCCTTACTTTCGTGTAGGACAATAATGATCTACAGGTGACAAC
ATCGTGTGACCCTGAGAACACGATCATGTTCTCAGGGCTGTTTGTTAGGTTGGACATGCAGGGTGACGGAATCAACAGATGTTAAATCAAAATGGTATGG
CATTCACTTGTCATTGCCAGGTATTTTGTGTTTCAATAACATGTAAGATTAAGATGCACACGACAAACTTTGCAACGCAAATTATACCCTTTTAACCATG
TATAACCGTAGCTAAACTTCAGTCAGCAAGAGAGGGTTGACTATGGGTCTGGTAGACAGGTCACTTGGCAGCCAGCACAGAAGGTGTACTCACTAATTAT
GTGTAATAACAAAGTAACAAACCCTGCTACTTCCTCCCACCTCTTATTGCTAGAGCGTCTAAAATACTATTTCAGCACTAATTAACCTTTGGGCTAATGA
TGTTACAGCCAGTATCATTACAACAACCATTAAGATGCATGTTCAATACAGTAGAAACTCTGATAACATAACATGTCTGGTTTGTAGTCTGTACAATAAA
GCATCTTGTTTTGAAAATGTGGAATGCCATGGCAATGTCCAGCTCGTACCAGATCGTCTTAGGTCAGTTGAAGTCTGCTACATTTCAAGGTTCTTGATTA
AGCATACACTTCTTGGAATATTGCAATTTTGTATTCTAGAAAAAGAATATTTACCCCAATTCAGGAACACCTGCTTTGTTGTGCTCGTGTTCCTTTTGTT
GTGATTGACTCGGTTCAGAATCAGCAGGAATATTTGCAGCTTGTAAAAAGCTGTAGGGAGTGCTAGAGCTTTTACTTGTCGCTTGACACCTCTGAAGCTG
AAATTTTTAAGCTGTTAGTTTCACTTGTTTCTAATAATGTGGCATTGTTTGGTACAAGCTTCTGAGAAAATGTCGTTCATTAAACCTTTCTACACAGTTC
CATTTTTTGTTGTGACATGACGTTCAAACTTCGACATAGTTCCATGTTTTCCTGTTGGATTAGACTTCCCTGTTGCACAGTTAGTTTAAAATTGGATTGT
TAGTAGTTAGTGCAAAGTACACGCTTTCTACTGTACTGATTTCATTGAAATATCTAAGGGCATTGGTTATAGACTGTAGTGACAAACCTTCCTGTGTAAC
TCTTCAATTTCACTTGTCATAATGTGGTCCTGTTTGGTAGATGTTTGCTGCATCATTAGATTGAAGCAAACAGGGGAACACTAAATTACAGATAATGAAG
AACACTTGTAATGACCTTCCTTGTTTTGATGCTGCGTAGACTCATTTCAAGCCGATTTTCTAAACCTTGGAGGCCTGTCACACCTAGGCCAGAAAGCTCC
TCTCCCATTAACTGCCTATAACAATGCAAACAATTTTGTCACAGTAATTCGTGAATACACTTGAGAACATTCCCTAACTAAATGTCACCATGCTACAACC
CTGTTCTGCTGACATGGGTTAAAGTAGAACAGCTCATCTTGTTTTCTGAAGAGAGTCACTGTCAGTTTCCATTTCAGAACAGTTATTACTCTGTGTGTTA
TAGTTTATAGTTTTTTTTCTTTGTCCTGACTGGTGAAGTATTCTCTTCTGTTTGGGCAGTTCTTGCAGAGTTTTCCGTGTGACTTCTAAAATTATGTATA
AAATCTCCTTCTGCACTGATGGTGGTTTTTTTCACTGCAGAATCAATAAAAGATTATCATACCTGTGACTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGCTGCCTCAA
GCTTGCTGCCTCCCTTTGCCAGAGCTATCAGCAAAATAGGAACATTTGTCAGTTTCCTTTAACTATAAATTTTATATCATAAACTTAATGTACAAATAAA
CGGCACAATATGTTAATGATAGTATATAAATACCCAGTAACTGATATGTAGTTGTCATGGCATTAGGCCAGTTTGATCTACTTGCAGTACATACAAGTCT
AGCCTTCTCATTTGAGTTATGGAGCAGACATTGACCACTGATCACCTTGTTAGTGCAGATTCAGCCTCTCAAATTACATTATTCATTTACATAAGTACAT
ATACTCTTTAGTATTTCAGGGTTTCAGATTCCCATAATTTGCTGAAAACAATATTGGTACTGTAATAGTTGCAGAAAACCTCTACGCAGATGAGAACCTT
TGCCCTGAACAACAACAAAACAGGACATCATGTGACTGCACACTTGTCAGCTTCCACCCTGCATCTTGTCCTCTCTTCCATCCATTTGAATAATCCTAAT
TAATTCAGGGGCGCTACTATGCATACATGTGGTCCCGCTAAGTCTCTGCACGCTTCCTTTGAAACAAAGGCTATAATTTCCATCTTGGCTCCTAAATAGC
TCAAGGTAAAAAAGGAATTGTATCTCCAGCAAGTTAAGGCGATGATGGGCCTGGATTGCATGCACCTGAAGGTATGGCTTTTCCTTTTGGTGGTTATTGT
GTTGTGTTTTGGGTATCTTTTGGCTGTGCAACAGATCAGCTGAGTCAGATATTGGCTCACTTTTTTTTTCGTATTTTCATGTTGCAAAATACGATCATGA
AACAAGTGGATCCATGATTCTGCCCTTCTCTTACATATAGCAAACTGGTCACTAAACAATGGCCGTATAGGGTAATGTTTTAGAATGCACAAAACTTATC
AATTTATTCAAACAGCTCTCCTGGTCCTGATTTCGTAACATAAGCACATAATCATCATATGCAAGCTTTTGCTGGTGGATGGTTGTTTCAAACATAGTAA
TCACTATTCATCATTGTTTCTTCAGTTGCCGATATTTGTACCAGATCCGATTAATTTGCGAAGGATCCTGGTGTTCTACACTTCACTAGTTTGCTGTCTG
CTCATACTACTGATGGTATCATTTGAATTCTTAGAAGCATTCTATTGTACGACGTAAAGGAATATCTGGTGTCTACTCTAAACTTCTAAGCTGGCACAAC
AGGATCTGTTAGAGTAGCAAGGTGCAGTGCAATCAGTCTAGTTCTTCAACAAGGGGTGCTGTGTCAAACACACTGGCCCAGATTTTGACCCTGTTTCCAA
ACAAGATGGTGGGTCATTGGCCGTTCTCATATGCTGAGCTGCTGAAGTGGGGCTTCATGATGAAGATGCGTGCAACGGTGGCAGCGGATGAGTTTATGAA
GGCTACAGCCTACAGGGCATATGATCAAGTGCCAACTGCCAAAGGACATGCCCCTCAATCTTCGCCAAAAGCCTGTCGTGTTCCAGAGCTGTCTGGGCTT
CTTATTGCAATAACAGTTCGGCTGTAGTATTTCTGCAAGAGAATTCTTGAGAAACCATATGATGGACCAGCAAATGAGCAAAGTGCCCTCTATTGCTTTG
CCAGATACTAGTAAACAATGGGTTTGTGATGTCTGAAGGTCATCATCTCCAATATGGCTTTTGTCTTTTGGGGCTTCCAAGTACTAACTAGGCCATGTAG
AGTGGAGAAACAACAATGACTACTATGCATTGTAGCAGCAAAAATCCCAGTGCTGCCTTAAAGTGGTAGTTCATCCATTGTTTGCAGCTTGAAAAAATGT
CTATGCTATGACTATCAAGTTCTTGTATTCCATCCATCCTTCCCAAATTAATTGACTGAGCTTTGTCTAGATATGGGACAGAGGAGTACAATATTTGTAA
AAAAAAAGTCTTGTAAAGTACAAAATATTATT