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Detailed information on CNT30213268


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P93431|RCA_ORYSJ, E-value = 4e-136

BLAST vs NONCODE:
NONTCAT000366, E-value = 1e-34

Expression of CNT30213268

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MDCPGKVSTSLTMSSSATLSVRKIPIHTPIRSSLVGAQ*

>peptide 2 (87 aa)
MKKIKGETKFTFSTNKQNLQNDNKNPWKKTQYLTFLMKNLKKPKIYRCSFHHHIKCSRHLHFLFLFVRCIYLQVSYILILCLIKHLR*

>peptide 3 (32 aa)
MSGVPPLSSQASFQWFQHQLLRSTSSLRHRTL*

>peptide 4 (32 aa)
MVILRSLTYRCLFMVWFWSWWSHWKQLRYPLG*

>peptide 5 (91 aa)
MRGAYSVEKSLPVTIIGTRGFSSLVALTIWLLTVYCVVPPILPAPASRSLMKRQHIFPFLMISAASRYRCLMSFAGSPAFPLSNSPALIMIG

>peptide 6 (65 aa)
MVLELVVSLEAASLSPGIEVRLAYILPFPDPINSFTIDEIMLCLFMVCVHCVKNGTRFGNGVKMH*

Sequence

>CNT30213268
CTAACAAGGGATTCTTAGTTTCTTACCGATGAAAAAGCTATTTTAAAGCTAAACTCTCAGTGTTTCTTTGAGAGTTGATACATTAATATCTTTTCAACTA
ATTATGTGTCTAACCAAACATTATATAGATAACTTTTAATCTATTTCTAGCCATTAAGAAAATGATATTAGACGAGCTATAGGGATCCGTTTGTTAGTGC
GATTTGCATACATTTATGTCTATTATTGTTGATAATGCGAGTAGCAATCGCACTCAAGGGTTTGATAGGCAAAACGGGGTAATCCTTGCATTCTAAAAGG
GGTGTTTATTTAGTTGCATATTGGACTCGATTAGCTACACCAATTCTGTTTTGAAGGGATGTTTATTAAGTGAGTATGAGAATTTGAAGGATACGCCGTT
GACGATGATGATGGGGTTTAATAAGTATTATGGTAATATTACGTAGTTTAACTTATCGGTGTTTATTCATGGTATGGTTTTGGAGCTGGTGGTCTCACTG
GAAGCAGCTTCGCTATCCCCTGGGATAGAGGTAAGGCTTGCTTACATCCTACCCTTCCCAGACCCTATCAATAGCTTCACTATAGATGAGATTATGTTGT
GTTTATTCATGGTATGTGTGCATTGTGTTAAGAATGGGACAAGGTTTGGCAATGGTGTAAAGATGCATTAAATCGAAACCGAAGAAACTGAAGAACACCT
TACTAAATGTGATTACATTTGAGAGCCCACATGAATGAAGAAAATAAAAGGTGAAACCAAATTCACTTTTTCTACCAACAAACAAAATTTACAAAATGAC
AATAAAAATCCATGGAAAAAAACACAATATTTGACATTCTTAATGAAAAACCTTAAAAAGCCTAAGATATATAGATGCAGCTTCCATCATCATATCAAGT
GTTCCAGACATCTGCATTTTCTATTCCTTTTTGTCCGCTGCATATATTTACAAGTTAGTTATATTCTTATATTATGTTTGATCAAACATTTGAGGTAATT
AAGAGTAAGTTTGTGGGCTAACCAAAAAATTTGCCGGTTTCCATGGCATCCTTGTTAGCGTCTCCAAGAGCCGCGGAGTCCAGATAGGTTTCGGCCAATT
GGACTCTCTTCACGTTCTCTTGTTCCTGAACAAGCATAAATCCATACTCTAGGAGCTTCTCTATTGTCATCTTTGGTTGCTCGAATGTCGGGGGTCCCTC
CCTTGAGTTCACAAGCTTCTTTCCAATGGTTTCAACACCAACTTCTCCGATCCACTTCCTCACTTCGTCATCGTACACTCTAGCCCTCAACGCGCCAAAG
AAATCTAATTAAAACCACCAAACACATTGTAACAAATGTTCCGTCAGTTTGTTGGTGATTTTAGTGTCATCGTAATCATTTCAGTATGACGTATAATTTA
CTTAATACCGAAGGGAAATATTACCGATGGATTGTCCTGGGAAAGTATCTACTAGCTTGACAATGTCTTCGTCGGCCACATTGTCAGTACGGAAAATACC
GATACACACACCAATACGGTCCTCTCTAGTGGGAGCCCAGTAGAACTTTTCCATACGTCCGTCACGGATGAGAGGAGCATACAGCGTCGAAAAATCGTTA
CCAGTGACGATAATTGGGACACGTGGGTTCTCCTCCTTGGTAGCGTTGACCATCTGGTTGTTGACTGTGTATTGTGTTGTTCCACCCATTCTACCTGCAC
CAGCATCAAGATCGTTGATGAAGAGGCAGCACATTTTCCCCTTCTTGATGATATCGGCTGCTTCACGGTACCGTTGTCTGATGAGCTTTGCGGGCTCTCC
AGCGTTTCCACTTTCCAATTCTCCGGCGCTCATCATGATAGGT