« Back to Citrullus lanatus search


Detailed information on CNT3021200


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LHK3|OST4A_ARATH, E-value = 8e-17

BLAST vs NONCODE:
NONCSAT001797, E-value = 8e-93

Expression of CNT3021200

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (73 aa)
NRNEVFSKSTASRRILSLDLLFAFVFLSQLIRSEAQMIDDQELGFLANFLGIFIFALVIAYHYVTADPKYEGN*

>peptide 2 (30 aa)
RIETRFFPSLLHLEEFCRWIFFLPSCFSLN*

Sequence

>CNT3021200
AGAATAGAAACGAGGTTTTTTCCAAGTCTACTGCATCTCGAAGAATTTTGTCGTTGGATCTTCTTTTTGCCTTCGTGTTTCTCTCTCAATTAATCAGATC
GGAAGCGCAGATGATTGACGATCAGGAGTTAGGTTTTCTTGCCAATTTTCTCGGCATTTTTATCTTTGCTTTAGTGATTGCTTACCATTACGTTACGGCT
GATCCGAAATATGAAGGCAATTGAGATCTCGTTGATTCAGATGCCTAGATTGATCGGTAAAATGCACTACTGTTAGATGTATACCGTTTTTGATCTGTAT
GTTAGGTTTTCCTTTTCTTCTGTGAGAATTTTCTCCCGGCAACAATCAATGTAAGCAACCTTTCACTATGAAATCGTAACTTATTCTCATTATTTTTCTT
GGCTCTTTGATTTATCTCATATTAGTTACGCATTTGATTGAATTTCTTCATACGGCCTTGAGTTCCTTCAAATTTGTGTTCAAGTTGAATGCATAGAATC
CGCAATTTGTAATTTCCCTTTACAAAACTTTTCTTTATACTGGCTATACTCTGTTCCATTAGGATGTTTAACACAAACTCTTTTTTTTAAATGATATAAG
ATCCCAAGAATTCATGTTAAGCTTCTCTGAGGAAATTTCTACTCTACAATAGCATCCATGGCGGTATGCTGCAATTTAGATCCTGTCATATTATGATTTG
TTTGAAAAAAATAAAAACTGATGTAGCTATAGCATTATAATTGTTGGATGATTATTATTATTTTTACCATCCAGCTTAATATTTGTTTGGTAATAATCTT
CTTTTTAGTTTGGTAATAATCTTGTTTTTAGTTTTCTATTTTTAAAATAGGACGTGGACTATCTTTGAA