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Detailed information on CNT3021193


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3039248Citrullus lanatusCucumis melo10.9938.5188.95181forward

Expression of CNT3021193

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (83 aa)
MPLYSLNYINAICWGRSHPYLTSFCYFSILENHTPQPTIEVREPSYLSTMLVIPFLLICPKSNSYRCETYVTHTILVANSFFY*

>peptide 2 (54 aa)
MEEDALVSLEEELHIAMAYILVWRRAIVLLVLVSKFKLCSFVLFAIIFIHHTTI*

Sequence

>CNT3021193
CGATTTCATGAAACAGCTTGGATTCTACTATTCCACTAAGCCGTTGGATCTAACTTCTGATTAGGGTTCGGCGAGAGGTTCCCCTGCAATGCCCTAATTT
AGACCATCCCTGTATTTAAATGGCAATGCCAAAGTTCCATTAGCGCCGTCCTACAATCCAGTGGCGGAAGCGTTAAGCGTTTGTGCTTAAATACTAGAAT
CAAGGTTTGCAGCTCATGGGGTCTTAAGCCATTATTTCTTGCTTTAATCCAAGGGCTGTCAAGTGTTCCTGATGCTTATTGTGGGTCATAGTGTACTTTT
GGAAAGGAAAGTTTATACCCAATTCTTCTTATTTAAACACTATATCATATAGAGAGTGATTGCCACAAATTTGATATCTCCCGACTAAACATTAATAACG
GTCTTTTGAAAGTTAGTAGCCTTTTAAGTTGTTCTGTTTTAATATTCAATGTGCAAATGGCTGGTTATGTTATGGTAATATTTTTATAGACAGAAGTTTG
TCAATAATTTTGCACGAGTACTGTGGTAATATTTTTATGGTAATGTTATTGAATGTCCAGAGTCTAGTATAATCGTGCACATATAGAAGATGGTATCCGC
CTTGCAGCTCAAACAATAGCATATTTCTGCTGCCTGTAATGCCACTATACTCTCTAAATTATATTAATGCCATTTGTTGGGGAAGATCTCACCCATATTT
AACAAGTTTCTGTTACTTCAGCATCTTGGAGAACCACACCCCACAGCCAACTATTGAGGTGAGAGAGCCAAGCTACTTAAGTACCATGTTGGTCATTCCA
TTCTTATTGATTTGTCCCAAATCTAACTCTTACCGATGTGAGACATATGTAACCCATACTATCTTGGTTGCTAATAGTTTCTTCTATTAGGAGGCAGAGT
AGTTTATGGGAGGAAATTTGACCAGAACACCTAGTATTTTAGTTTGAAGGCGTCAAAAGTTTACATGTAGGGATTGGTATAATGGTTAATTTTCTCTAAT
GGGAACTCATGCTAAAGTTGTACTTTGCTTTGTTGGTTTCTTTTATGATTAATTAAGAGTGACAGGAAAGCTGAACCACAACTAAAAGAACTTATCATTG
TTGTTGAATATTCTGTTTTTCCCTCTAGTGCCAAAGATTTCAAAAGAAAGATTTCTGAAAGGATGACTTTTGCCATTAGGTTGATGACCATTGAAAGGGC
CACATGTTAGAGGGTTCCAGCATTAAGAATGGCTGAGGGATAGATGACCATATGACTGTCACCATCTTGGGATAAAGGACACATGGAGGAGGATGCCTTA
GTTTCATTAGAGGAAGAACTTCACATTGCCATGGCATATATCCTTGTGTGGAGGAGGGCTATTGTCCTATTGGTCTTGGTCTCTAAGTTCAAATTATGTT
CTTTCGTACTATTTGCCATTATTTTTATACACCATACTACAATCTGAAGTTGCCTTTTCATTCTGTTTGTTAAACTGTCAGTAGCTTAGGCTATTTTCTA
ATAGTCGGCAAGCAATGGGGGATGAACTCTAAAACTTTTGTTGACAATTCTTTTTCACGGTTCATTGATATTTATATAATCTAATGATATAACATGAATT
GGATTGATGTATAGTATTCATGTTAAATCAAAATGAGCTTAACTAAA