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Detailed information on CNT30199476


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P47905|RS27A_LUPAL, E-value = 3e-43

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30374078Pisum sativumArabidopsis thaliana16.5543.2386.04265forward
CNT30276117Pisum sativumChenopodium quinoa10.3122.4287.88165forward
CNT30725948Pisum sativumLupinus angustifolius18.7436.6388.33300forward

Expression of CNT30199476

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MEIGDARVCDGGRRNERWWSGRMDLIGGEEG*

>peptide 2 (40 aa)
MVSEDSTSRVMVFPVRVLAKICIWIRFCAGRDGNWGRKGL*

>peptide 3 (45 aa)
MLVLNLLQLGVGLLLTLLGSTTETENKVECGFLLDVVVSKSAAVF*

Sequence

>CNT30199476
CCCAGAATGAGCGACCTTGTAAAACTGAAGAACAACTAGCTTCACCTTCCTATGCTTGTGCTTAATCTTCTTCAGCTTGGTGTAGGTCTTCTTCTTACGC
TTCTCGGCTCCACCACGGAGACGGAGAACAAGGTGGAGTGTGGATTCCTTCTAGATGTTGTAGTCAGTAAGAGTGCGGCCGTCTTCTAGCTGTTTGCCGG
CGAAGATCAGTCGTTGTTGGTCCGGTGGGATTCCTTCCTTATCTTGGATCTTTGCTTTGACATTGTTGATGGTGTCGGAAGACTCGACCTCGAGGGTGAT
GGTTTTCCCCGTCAGGGTTTTGGCGAAGATCTGCATCTGGATTAGGTTTTGCGCCGGAAGAGATGGAAATTGGGGACGCAAGGGTTTGTGACGGCGGACG
AAGAAACGAAAGGTGGTGGTCCGGTAGAATGGATTTGATCGGAGGTGAAGAAGGGTGATATTGTTGAGTTGTGGTGGTGGAGGGTGAGTGGTCGATTTGT
TAGAAGGAGAAGAAGATGAAGCTGCCGGCGATGATGCCTCCCGTCTCTAGATAAGCCTCCTTCTTCTATTTCGTTTTTTAGGGTTTTGATAAAAAAAAGA
GCTTTGCTGCGTTTATGTTGTTCTTGATTTTGGGTTTTGAAAAATAGCTTTTGCTGCGTTTATGGTTGTTCTTGCTGTTGTGTTTAGAGTTTCTTTTTGA
AAAAATCTCTTACTGTTGATCTGTTCTTTAGGCTTTTTGAGAAAAAGTTGTTTTTTCTGTTGTTGTGGTTTTGGCTTTTTGAGAAGAAATCTCTTACTGT
GTTGTGTCTCTTTGGAGTTAACAGAGAAAAAAAACTTTGAAAATTTCTTCTAGATTTTATAAAACGTGTTTCTGTTAATTAGTTTTGTGGTTTATATACA
TGAATGTTGGTTTCTGTGAGATAACTTGTTGGATCCTATTTCCAGATTTTGTGGGATGATTTACCTATGGATTTAAAGTTGTTTATTTGGATACTGCAGT
GTGTTTCTGAGCTCTTCCTTTGATTGATTCATTGCGTAACATATTAATCTACTCTTTCTATTAATTATTTTCCAGATTTTTAAGTGCTTATTTGATAAGC
TGTTTTTAATTTTGAATTGGTTTTGCAGGTGAAGTGATGTTGATGCTAATTGATTGAAAAAAGGGGGGTTGTTATTCAACAGGTTTTGGAAAAGTTCTGA
AGAGTTGGTTTTGAATTGGGAACTTCCAAAAGAGCTTTTGGATGAGTCGGTGAAATTTGCTTCAAACTGCTGTGTTTACCTCTTATTTTAATTTTATTTT
ATAAAATTATTTCTGATGTAACAAAGACTTTTTGGATTATGAACTTAGGGATTGCTTGTAACATGTACAAACTTAATTTGGAATTTCTCTTTTTGGACAA
TTATGTAATTGTTTGCGATTATTAGGAATTTTTGGATTAGTTAGGATATATTAACGGTAAGAAAAATTGGGTTAGACGTGTAACACTTTGGATCATTTGC
AAAATTTACATAATTTTAATTTATTTATTTTTTTGTTATTTATGTGGATACTTTTGGGTTATTATGTAACATTTGGATTAAATTGGAATATCACTTGGAG
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