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Detailed information on CNT3019347


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q3BAI2|YCX91_PHAAO, E-value = 9e-06

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30300699Cyanidioschyzon merolaeTriticum aestivum4.4222.4587.6121forward
CNT30222123Cyanidioschyzon merolaeHordeum vulgare4.7930.2583.97131forward
CNT30384972Cyanidioschyzon merolaeTriticum turgidum5.2323.186.01143forward
CNT30508923Cyanidioschyzon merolaeSolanum lycopersicum3.831.1484.62104reverse complement
CNT30441143Cyanidioschyzon merolaeAegilops tauschii5.2320.4986.01143reverse complement
CNT30257620Cyanidioschyzon merolaeAvena sativa5.2341.9486.01143forward
CNT30213164Cyanidioschyzon merolaeHelianthus annuus4.7943.0986.26131reverse complement
CNT30626675Cyanidioschyzon merolaeDaucus carota5.321.1186.21145forward
CNT30682403Cyanidioschyzon merolaeTriticum urartu2.1222.0589.6658forward
CNT30557548Cyanidioschyzon merolaePanicum hallii2.0123.589.0955reverse complement

Expression of CNT3019347

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MDAASKPTLSYRAILTAFHFYMLFKNLSMRSGLLPSQH*

Sequence

>CNT3019347
AAAAATTTTTATATTTTATAAATTAACATTATCATCTTCATCAATTTATAATCATATATGATAATCTTCGTATCTATCGGCCTGTTTCTTACAAAACATT
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