Detailed information on CNT3017991


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P16037|RR2_MAIZE, E-value = 1e-155

BLAST vs NONCODE:
NONZMAT000296, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30521912Zea maysSetaria italica6.2690.794.87312reverse complement
CNT30179912Zea maysSecale cereale16.9549.5692.07845forward
CNT30401480Zea maysTriticum turgidum5.840.0893.77289reverse complement
CNT30576494Zea maysOryza barthii3.1520.2193.63157forward

Expression of CNT3017991

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MNWAKLKKERLFQKLVNSMMTFHGFTYIGCG*

>peptide 2 (40 aa)
MAPRMPILARIVRKCNSVFKQLFRVPRAPCTACWKTRCRT*

>peptide 3 (37 aa)
MLLNPLLFFWYQQLRSFFPDLLHQKLNHKLLIKNELF*

>peptide 4 (36 aa)
MFQYLLVIFFHTSFFFLFSCYHYGIHFFLKIKKEPK*

>peptide 5 (35 aa)
MAISISFFYVMSLSSILSFLFVFLYTQTYIRLDEY*

>peptide 6 (66 aa)
MSTFTLCRDVRGHFGIPFLNTMTKMNSRFYHLFQIDVPISSCHFFPHFLFFSFFVLPLRNSFLFED*

>peptide 7 (52 aa)
MNLSIHLALPLLFFFFVMYYGYFHIFFLCNEPILYPLFSVCISIYPNLYKTR*

>peptide 8 (73 aa)
MSVLYQINSTLAISRLKHFETNTNVVVERVPLFARTSSSLALTVLMVSHYWSIENQSKFTNESRNAMVLPYDF*

>peptide 9 (57 aa)
MTGIGTTKGTKETRTTTTNSSANIFPKSRKLSDNGFVKSSRMLIGKRIGVGLIYFSK*

>peptide 10 (49 aa)
MKVDYLAIKFTIFMISSRTKHESFDSFGSPAPFFLFCYVLWLFPYLFFM*

>peptide 11 (47 aa)
MSGNLVIYLIPPRYLCKVDNFLFKIAASLFGRWWNFPIFSSALKSLN*

Sequence

>CNT3017991
TTTAATTTTTTTTTTTGGAAGCAAGGGAAAAATAATGCCTAAATTCTAAACAAAAGTAGAAGTTCAAAACCTAATAAATTGAATTATCTCTTCCATTCTA
TGGCCCCGAGAATGCCAATATTAGCACGAATCGTACGGAAATGTAACTCGGTATTCAAACAACTATTCAGAGTTCCTAGAGCTCCTTGTACAGCTTGTTG
GAAAACCCGTTGTCGGACCTGATTCATCGCCCTTTGTTTTTCAAAATAAAGGGTTTCGTTTTTAGACTTTTCTAATTGTTCCAAACTAATAGAAGTAGCA
TTAATCAAATTTTCTTTTTCTCGTTCTATTTCAGAGTATCCATTCATTCGATACTCATCTGCTTCCAGTTCGACTTTCTGTAATCGAATACGAGCTTTTT
CGAGTTGTTCAAGGGTCCCTTTACGCAATTCTTCCGAATTTCGAATAGTACTTAAAATCCTCTGTTTTCGATTATCTAATAAATCTTTTAATGAAAGTAG
ATTATCTTGCTATTAAGTTTACAATTTTTATGATCTCTTCCCGAACCAAACATGAATCTTTCGATTCATTTGGCTCTCCCGCTCCTTTTTTTCTTTTTTG
TTATGTATTATGGCTATTTCCATATCTTTTTTTTATGTAATGAGCCTATCCTCTATCCTCTCTTTTCTGTTTGTATTTCTATATACCCAAACTTATATAA
GACTAGATGAATATTAAGAGGACTCTTCCAACTAGATAAAAATCTATCATGGTCAGCAAAGTTGTTTCTTTATTTGTGTTTGCTCTGTTAGTTAATAATT
TCAATTTCATTAAGAAAAACTAACTAAATAAATGGAAAATAAAAATTGATAGAATTCCTTTTATTTTTTCTTCAAATCCAAAAAATTTCTCTTTTTTTAT
ACATAGGTCGTCGATTTGGCATTGGAAAAAGGGCTGCGTGCCCTTCTAGTAAATAGTTCAAACTATTTTATCGATATGAGTGTTCTATATCAGATAAATT
CTACACTAGCTATTTCCCGTTTAAAGCATTTCGAGACTAATACTAATGTAGTTGTAGAAAGAGTACCCCTTTTTGCCCGGACTTCAAGCAGTTTAGCTTT
AACCGTGTTAATGGTCTCACATTATTGGTCTATAGAGAATCAAAGTAAATTTACCAATGAATCGCGAAATGCTATGGTTCTTCCATATGATTTCTGAAGT
TATTCAGAAGTAATTCGTCGAGATCGTGCACCTTTTCTTATTTATCAAAAAAAATACTAAAAATATTCTAAAGTGCAGCCGGATAGATCCAATCTATTCT
TGAAATAGACAACTCGCACACACTCCCTTTCCAAAAAAAATCAATACACCAACCACTACAGTTAGATTTATTAGATTTGTTGCTAAAATATCGGTATTAA
GCCCGAAACTCCCAGCGAATGGCCAGTGAGCTAAAAAAACAAAAGAATGGGTTACATTTTTCATATGCTCTCCTCTTATAGATAGGACGAACAAAGAAGA
AAGTTTTTCGATTACTTACTTCGCTCGTCCTTTTTTGATCGGTTTTTTTAATGCAAATAGATTCAATCTAATAATTTCTTTTAGATTAAGTCTTAGGTCT
CGTTTGACCTGTGAAAGATCTCCTTTGTTGAAATGTTCCCAAAATTCCTAAAATAAAAGGAAAAATACTTTCCACTGTCCTAAACTAAGGACGGGAAGGA
AGAGGGCGAGCATATCCTCTAAATTGATCATGCTCAAATCAGCCCTTCTTGGGGTTCCTAGGGTATTGTCTGTCCCGATAAATACAAAATTTCCGGAATA
ATATAAAAAAGAAATAATATAATAAATAGGAGTAAAGTAAAGTATTGATATACTTAGAATTACATAAGCAAATGCCAATGTACTAAAAAAAGAAAAAAGT
ATCTAATCTAAAGGACTCATTTTCTTTTTTAGGATTAAACAAAAGGGTTCGCAAATAAAAGCGCTAGTGCCACAACCAGTCCATAAATTGTTAAAGCTTC
CATAAAAGCTAGACTAAGCAATAAAGTACCTCTTATTTTACCTTCTGCTTCTGGCTGTCTCGCAATACCTTCTACAGCTTGTCCTGCAGCAGTACCTTGA
CCAACTCCGGGCCCAATAGAAGCAAGCCCTACGGCCAATCCAGCAGCAATAACGGAAGCAGCAGCAATTAGTGGATTCATGATGAGTTCCTCGTGTCAAA
AAAAAAGAAATGGTTAAGGATACAATCAACCAAGAAATTATTACTTCCAACTTCTAAGCTCTATCGGGTAGAAGTAACTAATAAGTACAAATAAATGATA
ATCGAAATCGTTCGAATTACTTCGAGATCTCGTTTTTAGTTTCTAATCATTAGAGGTTTGTGTAAATCCATATGATTCTCATTATTCTATTTCTCTTTCT
TTTCAACCAATCACTCTTTTATTCCATCCTTTTTTTTACTCTTCGATATCTTTGAGTTCCCATTTTTTCCCCTTCATCTAACATAATAAAAGACGAAATA
CAGGAAGAACCCCTATTGAAATCGAACTAATCCAAATCCAATAGGAATCAAATCAAGATATACAATTGATAACAATATGCTGCATAGAACTAGATATGGA
ATCCAGTTCCATATAGAAGGGAATTCTATATATCGGATTAGATAATGAATCTAACTTAGGAATAAAAAAAATCCCATATACATTTGTTTCTTCTATTTTG
TTTGCCTATTTTCTCATTTTCTATTGAATCCGATTCTAAAATCATTCTTTAGAAAGCCACACAAAAGATGACTGTCTTATAGGCATTAAAGATATAGATC
TAACCTGACTTGGCCCCCTGAATGCATATATACTTTACCTCTTCCATAATATAGTCTATTCTCTCTCCTACAACTCTAGGTTGTATATTCATACGCCTTT
CGAACTATTTAGTTTTCCAACTAAGAGGATTATCCGGAATCATGCATGAATTGGGCTAAGCTAAAAAAAGAAAGACTATTTCAAAAACTAGTTAATTCAA
TGATGACCTTCCATGGATTCACCTATATAGGCTGCGGCTAACGTTGCAAAAATAAGAGCTTGAATACCGCTTGTAAATAATCCAAGAAACATGACCGGTA
TAGGGACTACTAAGGGGACTAAAGAAACAAGAACAACAACGACTAATTCATCCGCCAATATATTTCCGAAAAGTCGAAAACTAAGTGATAATGGTTTTGT
GAAATCTTCTAGGATGTTAATAGGTAAAAGGATTGGGGTTGGTTTAATATATTTTTCGAAATAACTCAATCCTTTTTTGCTAAGACCCGCATAAAAATAT
GCCGCTGATGTTAGTAAAGCTAAAGCAACAGTAGTATTTATATCATTCGTGGGCGCTGCTAATTCCCCATGGGGTAACTCTATAATTTTCCAAGGTAAAA
GAGCACCTGACCAATTCGAAACAAAAATAAAAAGGAACATAGTTCCAATAAAGGGAACCCAGGGACCATATTCTTCTCCAATCTGAGTTTTGCTCAAGTC
TCGAATAAACTCAAGGACATATTCGAAGAAATTCTGACCATCGGTCGGGATGGTTTGTGGATTCCGAACAGCTATGATAACTGAACCTAGCAAAATAGTA
ATTACGACCCAAGAAGTGATGAGTACTTGGGCATGAATTTGGAAACCTCCTATTTGCCAATAGAAGTGTTGCCCTACTTCTACACCCGATATATCATATA
ACCCCTTGAGTGTTTTAATGGAACATGGTGTAATATTCATATTGTCCTCTGATAAAAATTGAACTTCAAAAAAGGAATTCTTTTGATTCAAGCATCTCTT
TCTCAACTCAGCAACTTGAAGTATTAATCTTATATTTAATATACCAAGAAATCACATCAGATCATAATATATATCAATACCCTCTAATATATATCAATAT
TTCCCTTCTTTTATCTATGCAAAACAAAAAAGAATAGTAATTAATCCTATAAATCTACGCAGTTGCTCAAGAATTCACTATTCTTCTTAATCAACGATTT
CTTATATAGAGAGAACGGCCCTCAGAAATTGCAAATACTAATTTGTTAAGAATTAATCGAATTGAAGTCATAGTGTCATCGTTGGCAGGAATCGATATAT
TCGCAAGATCTGGGTCACAATTTGTATCGACTAAAGAAATAGTAGGAATCCCCAAAATGGCACATTCCTGAAGAGCTATATACTCTTTTTGCTGATCAAG
GACGATCACAATGTCAGGCAACCTCGTCATATATTTGATCCCGCCGAGATATCTTTGCAAGGTAGATAATTTTCTCTTTAAGATTGCCGCATCTCTTTTT
GGGAGATGGTGGAATTTTCCCATTTTTTCTTCTGCTCTTAAGTCTCTAAATTGAGAAAGTCTAGTTTTGGTAATCGACCAATTCGTTAACATACCGCTGA
ACCACTTTTTATTAACATAATGACAACGAGACCTTATTGCAGCTGATGCTACTAAATCCGCTGCTCTTTTTTTGGTACCAACAATTAAGAAGCTTTTTCC
CTGACTTGCTGCATCAAAAACTAAATCACAAGCTTCTGATAAAAAACGAGCTGTTCTAGCAAGATTTGTAATATGAGTACCTTTACGCTTTGCCGAGATG
TAAGGGGCCATTTTGGGATTCCATTTCTTAATACCATGACCAAAATGAACTCCCGCTTCTATCATCTCTTTCAAATTGATGTTCCAATATCTTCTTGTCA
TTTTTTTCCACACTTCCTTTTTTTTTCTTTTTTCGTGTTACCATTACGGAATTCATTTCTTTTTGAAGATTAAGAAAGAGCCGAAATAGCTTGAAATAAA
TAATAATTGTTCCAATGGAACCTTCTTGACCATTGATACACGGTATAAACATAGCCTTAATGAATTAACTGACTTCTTTTACTTATTAAAATACAATTTA
AATTTAAGTACAAAATCGAAAATCAGACCTGTTAGCATTCTAAGGTCAAAAGTATAGTTTAAATTAAAGTAAAAAAAATTGCTTT