Detailed information on CNT30179114


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30720303Secale cerealeTriticum spelta7.6554.2495.04262forward

Expression of CNT30179114

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MAGVHVRVPVLLLRRPAAQKFLCVLFDWQPNGTQLRAW*

>peptide 2 (40 aa)
MQISFSTRDSMFSYASANHHCHLFCLINFLCSLYKVYQIR*

>peptide 3 (45 aa)
MNLIRYYLLETELVQGTISMNSLLIIELSSLFAGTYSYGWSWSAR*

>peptide 4 (45 aa)
MCSLTESSSTLRSDLQGTCANLEGFSTHTRFWLQLLQKLDCSAYI*

>peptide 5 (54 aa)
HYTVRRAERGGCRHLVFFSLSPEDERRAAAHPSPSSFPDLRPGTAPPPLHPVDP*

>peptide 6 (48 aa)
MLILPILTLYIFTSLYHNVVCIGPARIMYRNNQPYYFSRRLILTWSSF*

>peptide 7 (48 aa)
MSAVPPPIPLPPPSQICAPARPRLPFTLSIPSLTTIAAPTVVSMPRRP*

>peptide 8 (35 aa)
MAYLLCSYNILLKLEFFVQAIHLIFYYANQFQYKG*

>peptide 9 (36 aa)
MCVSLFFCSDGQLPRSSSASSSIGSQTAHNCEHGSV*

>peptide 10 (33 aa)
MAACGSRSLNMTLAMLLHLDRHLHVKRDARLCC*

>peptide 11 (31 aa)
MFFPLNPLGERHCKFSSFHVLWSRRIGGRAQ*

Sequence

>CNT30179114
CACTACACAGTGAGAAGGGCAGAAAGAGGTGGATGTCGACATTTGGTCTTCTTCTCCCTCTCCCCCGAAGATGAGCGCCGTGCCGCCGCCCATCCCTCTC
CCTCCTCCTTCCCAGATCTGCGCCCCGGCACGGCCCCGCCTCCCCTTCACCCTGTCGATCCCTAGCCTAACCACCATTGCGGCGCCGACCGTGGTGAGCA
TGCCGCGCCGTCCATAGTCACAGCACCGCGCCGCCGGTCCAGATCGCCGGGTTGCGACGGCTGTGTGACCTCGCATCATGGCGGGCGTCCATGTGCGTGT
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GCTGCATTTGGATCGCCATCTCCATGTCAAGCGAGATGCTCGATTATGCTGCTAGATTTGAAAATTTATAGGTATGTTGATTTTCTAGCACACACATTAA
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TCTGTGTAACCTGCCTCTGTAAACTCAGCCAGATTGAAAGAAAGAAAATAACAGGAGCGACAAGGCCCTGTGGCGATCCAATCGTCTCACAACCGTGTTC
GCGTGTATTGAAGTTCCGCCGAGGTGTGGTACCGTTGCTTGATACATGTGTGTTATAGGTTGCAAGCCGTAGCAACTGATCCAAATCTAGCCTCACGTGC
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GCATAGCAACTGCGGATGTGCTCTCTGACAGAAAGTAGTAGTACTCTCAGGAGCGACCTACAAGGGACCTGCGCCAACTTAGAAGGATTTAGTACACACA
CTCGGTTCTGGCTTCAGTTGCTTCAGAAGCTTGATTGTAGTGCTTATATTTGAGTTGTGGGTTTAAGTTATTGTATCAAAAAAGGACAAAAAAAATTCAT
TTATCCGTTGATAATCTGCCATTATATTCATGTAGATTAACATAGATGAACAGAAATTAAGACCTGCTTCTGAAACTTCTTTGATTATTTTTTTGTGCCT
AATCATGTGCCAATAATCAATGTTTCCTCAAATGTATTTTCTTCTTACTATTTCTTTTTTGTTGCATTGTTAATCTAAACGTAGTAGATTCAGCTTATAT
CTGAACTACTTGACGATGACTTAGCTGAGAACATCAGTATCATACTTGCACCAACAAGTTGTTACCTATAATCTCACTCTTTTTATTTCCCTCTCTTCCT
ACTAATTTCTACAATATTTGTTTTGCCTACCTATAATCTCAGTTTATATTCTCTTCTACAGTTCATTACAGTCGCTTCATAAACTAAGGTGCAGCTCTGT
CTCGGATACAAATATGATGCATGTTAATACTACCCATCTTAACTCTTTATATATTTACTTCTTTATATCATAATGTTGTCTGCATTGGTCCAGCAAGGAT
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TACTTATACTTTCTCAAATATTACGTGACCTGAGCATCATGCTAGATACAAAAATTAGGTTAATGTTTAGCTATCACGACCTCATGCATTAACTTACAAA
AATTAGGTTAATGTTTAGCTATCAATCGCAATGGCAAGGACATTATTTAGTTCTATGTTACTAGCAAGCCAAGTGTACTAATTTTGTCTAACATAATTCG
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ACCTTCTGTGTTCATACAATATTCTGCTTAAATTAGAATTTTTCGTGCAAGCAATACATTTAATATTTTACTATGCAAATCAGTTTCAGTACAAGGGATA
GTATGTTTTCCTATGCATCTGCCAACCACCACTGCCATCTATTTTGTCTAATTAATTTTCTTTGTTCTCTCTACAAGGTTTACCAAATCAGATGATAAGG
TAAAAGAACTCTTCTTGTATTTCATAGTCGGCACTCAAGTTTCGACTCGTAGACTAGTCTGTCGACTAGTTGCTCGGCTCGTAATCAGTGGAGAGAACAC
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TGCAAGGAACTATATCAATGAACTCTTTACTTATCATTGAATTATCTTCTTTGTTTGCAGGAACATATTCTTACGGGTGGTCATGGTCTGCTCGTTGATG
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CAATCAGAGGTGTAAATACTTAGCCTTACTAGAATAGCAGATATTATCCTGACCAACAACTTAGGTGTTCTGCTAGCTGTACGAAACATTAGCTATGTTT
ACTTCTTTAATTCTGGCTTGAAATTGACCATGAGTCTGTAATTGAACAAGAATCTGATGTGTACATTGAATTTTGGCAGCAATTTTTAATTTTTAATTAT
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