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Detailed information on CNT30167505


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30270405Pistacia veraChenopodium quinoa5.6421.488.4295forward
CNT30526301Pistacia veraPhaseolus vulgaris7.0722.587.39119forward
CNT30559435Pistacia veraActinidia chinensis5.5225.288.1793forward

Expression of CNT30167505

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
LHTTNQCSIPIEQQLAIKKRATWGLHGLN*

>peptide 2 (34 aa)
MHALMNWVPRRTLVVAGKGVVAGKGNGSSRLNIN*

>peptide 3 (33 aa)
MLEALRAHPLSVTPSPSPSLSLFLYLFLFYFFA*

>peptide 4 (62 aa)
MVLSCMFGSCLKLCVLTLYLSPHHRLHLFLSFYIYFYFIFLHEFTVSSVSESAATAFLSKSL*

>peptide 5 (42 aa)
MFIFQYRNLKYAIPCLWRRVKLMFSKRLNPNNLFIQLERLYS*

>peptide 6 (41 aa)
SSHNKPMFHSNRATISNQKESHLGASWVKLSRRVSGGDRRE*

Sequence

>CNT30167505
TCTTCACACAACAAACCAATGTTCCATTCCAATAGAGCAACAATTAGCAATCAAAAAGAGAGCCACCTGGGGGCTTCATGGGTTAAATTAAGTCGAAGGG
TAAGTGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTACTTTCTTGCATGTTTGGTTCATGCTTGAAGCTCTGCGTGCTCACCCTCTATCTGTCACCCCA
TCACCGTCTCCATCTCTTTCTCTCTTTCTATATTTATTTTTATTTTATTTTTTTGCATGAATTTACAGTAAGTTCTGTCAGTGAGAGTGCTGCCACCGCA
TTTTTAAGCAAGAGTTTATAGTAAAAATAATAATTATGAAAATCTTTGCAAATTTAGAAGGTATTAGCATCCTATATAGGTAGGTTCTTGCTTTCAGTAT
ATATTTGTAAATTAATTGTTTATTTTTGAACTTTCAGTAGTAGTCAGGAGTTGTTACTGTCGAAGCTTTGGTGTCTTGCAAATTGAGCACAAACACAGTT
TTTATTCGTTTTGTGTGGGAAAAGGTAGTAGCCATCATCCTGTCAGGAGTCTCTCAAACTGATAATAACTGAATCTTGGTCTTCTACTTAATAAATTCTA
TATTAATTTAGCTCAAGCCATGTCTGTAAACAGTACTAACCGAGTCCAATATTGATCTCTTGTACATATGAAAGCTTCTGATTTGCTTAATAACCCTCTT
CTCTTCATTAATTGCATGCCCTAGCTTCCAATATGTTTATTTTTCAGTACAGAAATTTGAAATACGCAATACCTTGTCTTTGGAGGAGAGTAAAATTAAT
GTTTTCAAAAAGGTTAAATCCAAATAACCTGTTTATTCAGTTGGAGAGATTGTATTCTTGATCTGGCGGCGCGGTTCTGAATGAATGTAAAGATGGATTG
ATCTTCAAGTTAAGTTTGGTTATATTAGCCATAAATGGTGCTTTTGTTGTTTTAATTTAATATTAATTTGAGTTTAATATTCCTTATCTTAAGTTAATGT
GGTGGATCTGATTCTGAAATAATGCAGTGGAGTGGAGTTCCGGTATTATGTAGAGGAATTTTATCTGGCATGAAGTAGTGTTGAGTGACAGGGACCTTAA
TGTTGTATATATGAACGGCCGTAATTTCAATTCACAGTTGTTAATACTCCTGTTTGTGTATGCTATTCAAACCTATAATCCCCACAAGAATCTTTAATTA
TATTTAACTAAGATCGATCTTACTTATAGTAAAGTCTTTAATTTCTTACCCTAGCTTTCTATCTTTTCATTTTTCTCTTCCCTTTCTTGCCCTAAATAAT
GATTTTATTATTTGCTGAATTGATCTTTGGGAAAACTTGAAATTAAGACTATATTTAAGTTAGATTTGAACTTTAAACTTGTTTCCACAGTATGGTTAAT
TAATCTGAAGACGAAAAGTGCAGATATGCTGCTCTCTTCCATCAAACAGTCAAAGTTATGCATGCCCTAATGAACTGGGTTCCAAGAAGAACTTTGGTAG
TGGCCGGAAAAGGAGTAGTGGCCGGAAAAGGAAATGGTTCCAGCAGACTCAATATTAATTGAACATGAACCCTCATGTTTTAAAGAGATCCAACTCCATG
TTTGAATGTTATATACAAGATCTTATAACAAAAGAGACGGTGTAATATTTATTTATGGGAATGACTGAGTTCTTGGTGTAATAT