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Detailed information on CNT30160449


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P0CH33|UBQ11_ARATH, E-value = 5e-143

BLAST vs NONCODE:
NONMEST001181, E-value = 2e-140

Expression of CNT30160449

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (40 aa)
MVSELSTSKVIVLPVRVLTKICIPPRRRRTKWSVDSFWIL*

>peptide 2 (31 aa)
MVSELSTSRVIVFPVRVFTKICIPPLRRRTK*

>peptide 3 (61 aa)
MTNSETPTETEHKMQGGLLLNVVISKGPSILKLLPSKNQPLLVWWDPLLILDLSLNIVNGI*

Sequence

>CNT30160449
CCAAGGATATATACTAAGCGCCATAATATGTATTTATTTAATATAAGTTCTTAGAACTGATATACATGATCTAAAGAACGCCCATATCAGCATCTAAGAA
ACACAGCGCAAAAAGCATAAAAACTAAAAAACTTAAAATAGAGTTTTTACAACTTATTTAAGACATTAAATATTGGCCAGCGGCCAGACCACACCACACA
AACAACCACATATCCAACATAATGGAAACAAACCAGATTCAAATAAGCACATGACCAATTCAGAAACCCCCACGGAGACGGAGCACAAGATGCAGGGTGG
ACTCCTTCTGAATGTTGTAATCAGCAAGGGTCCTTCCATCCTCAAGCTGCTTCCCAGCAAAAATCAACCTCTGCTGGTCTGGTGGGATCCCCTCCTTATC
CTGGATCTTAGCCTTAACATTGTCAATGGTATCTGAACTCTCAACCTCCAAGGTGATTGTCTTACCAGTGAGGGTCTTGACAAAAATCTGCATACCACCA
CGGAGACGAAGGACCAAGTGGAGTGTGGATTCCTTCTGGATATTATAGTCTGCAAGTGTCCTCCCATCTTCAAGCTGCTTACCAGCAAAAATGAGCCTCT
GCTGATCTGGTGGGATACCCTCTTTGTCTTGGATTTTGGCTTTCACATTGTCAATTGTGTCAGAACTCTCAACCTCCAAGGTAATGGTTTTTCCAGTAAG
GGTTTTCACAAAGATCTGCATACCACCCCTGAGTCGAAGGACCAAGTGAAGGGTGGACTCCTTCTGGATGTTATAGTCAGCAAGTGTGCGTCCATCCTCA
AGTTGTTTGCCAGCGAAGATAAGCCTCTGCTGGTCTGGTGGGATTCCTTCCTTATCCTGAATTTTGGCTTTGACATTGTCAATGGTTGTTTGCCGGCAAA
GATAAGCCTTTGCTGGTCTGGGGGAATCCCTTCCTTGTCCTGAATTTTGGCTTTGACATTGTCAATGGTGTCGGAGCTTTCCACCTCAAGGGTGATTGTC
TTTCCAGTGAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATACCACCCCTTAGACGGAGGACCAAGTGAAGGGTTGACTCTTTCTGGATGTTATAATCTGCAAGTGTAC
GCCCATCCTCGAGTTGTTTACCAGCAAAGATAAGCCTTTGCTGGTCTGGCGGGATCCCTTCCTTGTCCTGAATTTTGGCCTTGACATTGTCAATGGTGTC
AGAGCTTTCCAC