Detailed information on CNT30152240


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3021423Prunus persicaCitrullus lanatus1.4662.7590.62128forward

Expression of CNT30152240

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (37 aa)
MSDIWQVMGTNDQNALLNQIQRISSSTSIENVAESSL*

>peptide 2 (39 aa)
MLLPVICHSKLCQHHPLYEYHQNTSLNAGTLVLLPTFVH*

>peptide 3 (40 aa)
MNSNYTGKYTLRMNRHKFHDLINSTLYMNSDICININHFE*

>peptide 4 (71 aa)
MWHRFHNPNIISDPHILFFFPRFQNFTRPSLMSICTFGVFKYYLRQSRSCFADFTELLFEKHLENLANFCG*

>peptide 5 (63 aa)
MRVCCLLPPASFPDCLPYLAINITIFVSFLSFYNSMFIRDFISLERTSKERIHVVILTLRVIF*

>peptide 6 (66 aa)
MQSKRNLIRKGCWLMLRTSTSCDTVYIILLLNISHCLKLLNTLASRSLSRVKRSHNHVNNQIKSFD*

>peptide 7 (44 aa)
MLDSIFTDSIVPPYCTFMETNMLFLRVIKCTEHITRSDSLKMYK*

>peptide 8 (62 aa)
MDLLCSMMSFYSIQIKARSSLILIVQLHQDLKILDDDINMRAGSFPSTVFVNKCSDLKILDM*

>peptide 9 (30 aa)
MPEVWISCGASFVASALGGALISCMEGGVPL

>peptide 10 (30 aa)
MSSLLNISTEYELTRFNKVLFSSLSFSTSC*

>peptide 11 (32 aa)
MQNPHVFLISEHPMCLRSKTISDHPFRKRDYP*

>peptide 12 (31 aa)
MNISPKLPPVKQAYSNITNKIFQGYSSPFLE*

>peptide 13 (36 aa)
MRVYRPHDCLYFYLKVWSRISVHTSTFTLSHIYFII*

>peptide 14 (35 aa)
MFLVETRNVGFHIYRFNCAPLLHIYGDQYVIFKGH*

>peptide 15 (38 aa)
MMNARFWRHEFCWEQHLNQDGLGEKKRKSFLGRFQGKF*

>peptide 16 (33 aa)
MKISWGDIHQEEHLEVCYTDCCTLLPSISFLPH*

>peptide 17 (32 aa)
MYKGNMLFLKLMDEQFNEMSEVPQNMDNYVRA*

>peptide 18 (34 aa)
MMLVCQTLEGSQMVMSEQPIFWPINRRHHQRRKS*

>peptide 19 (33 aa)
MIWLQHIKTLEEFKKYLSLLEDRALCQRDFCLY*

Sequence

>CNT30152240
ATTGACGGCATATAAGGAATTGACGGATATCAGGAATTGACGGAAATAAAGGCGTACACTTAGGTGATAGTTTTAAATTGATTTCAATGATTTTATGAGA
TTTTTATTGACCATGAATATGATTGGCATGTATGTATATAAATATATGAATGCATTAATTTCAATACGAATATAATGAAGAGGATAATTTAGTTTTGCAT
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TGACAAGTATAAATTTTGGGGAAAGAACAAATTACAGAGGAGACTCTGTCGAATTTTCGGTAGGAGTCAAACCTAAAATGAAGTTAAGTTTTGAAAAGAC
GGGCAATTAGGTCATTTGTGCCTGACACCCGCCAGGTGTCGGACACGCACAAGGTCAGGCTCAGATTTCAAACTGAAATTTGGGTCGGGTCCTGTCAGCA
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GGTACCGGGCCCACATCTGTTACTCGGGTTCCCAAGTATGCTCCTCTAGAACTTCACTCACCAATCGCATCTCAATATCCTCGAGCAAATATCCACATCA
TGCTTCTACCAGTAATATGTCATTCTAAGCTTTGCCAACATCATCCCCTATATGAATATCACCAAAATACGTCCTTAAATGCCGGGACTCTAGTACTTCT
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AACCACATGCATTCATATCTATATCTATAAAGCCCATCACGCTCATAATCAAACATTAAGTTTCCTTGGAAGCAATGAAATCAACTTTAATCTACCACCT
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AACTGTCAAGCTTGCTGACTAAACTGAAGTCAACGAATAAAATCCGGAGGCAACATATTCATATTTGGGTACCTAAGGTGGCTTAAGAAAATATGAAATT
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GGAATTGAATTGCATAAATCATTTATAAAACAAAAAGTCCACTCACTAACTTTACCATCTCGATTAGTCAACTCTCTTTGTCGGCTTTACCGACTCGAAC
ATTTCCCTTGTGATAAAACCTCAACAAATTTTTCAACCCTTCCTGATACCTTTGTACTCAGCCACCAACAAGGCAAAAGAACCTAAACAAACACCAAAAA
ATTCAATAAAACAAGGATGCACACGTGGTGCTGAGTCTACAAGAATATAACCTAATGCTCTGATACCAAGTTGACAGGACTCGACCTAAATTTCACTTTG
GAATCTGAGCTGAACCCTGTGCATGTCCGACATCTGGCAGGTGATGGGCACAAATGACCAAAATGCCCTTCTAAACCAAATCCAAAGAATTTCAAGCTCG
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ATTCTGAGGGTATTCTAGTCCTTTTCTTGAATAAAATAATAATTAAGAATTAATTAAGGATTGGGTTGTTACATTTAAAGTATTGTGCGGGTTTATCGTA
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TCCCAGATTCCAAAACTTCACGCGGCCTTCATTAATGTCTATCTGCACTTTCGGCGTCTTCAAGTATTATCTTCGTCAAAGCCGATCTTGCTTTGCGGAT
TTCACGGAGCTACTTTTTGAAAAGCACCTCGAGAACCTCGCGAATTTCTGTGGTTAATTTGAAATTCATTGGATCTACCTATTCCCCTCATTTATGTATA
AATGTGTTACTAACGAAATTTTCTTTGCAGAATACATCTAGTTTTCTCCATATCTAGTTATGCAAAATCCACATGTTTTTCTTATCAGTGAGCACCCGAT
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GATTTTAGAGTAGCTACTCAAATCATCATTGGGTTGTGTTGATTGGAATCACGTTCTATTATTAAATGTTGACAATATCATTGGCCAAAATGGAAAGAGG
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TTATGGAGACCAATATGTTATTTTTAAGGGTCATTAAATGCACGGAGCATATCACCAGAAGTGATTCCCTAAAGATGTATAAATAGCAAGATTGAAGCTA
TATAATGTGTCATAAGGTTTAAATCGCTTAAACAAAATCCTTGAAAGGATTGCAATTGCATGAAGCATGTCCCTGAATGACATGTGCCTGAAGCACAAAA
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GCATTGAGAAATTCTCCAAGAGAGATATATCAGTGAGCCGCATATATTGTAAATACTAAAGTTATAGCCCTATTATTTTACATAGTGGAAAAGTTACTGC
TGCTGCTCTCTGAGGACGTAGGCATGGCCGAACCTCATTAAATATTGTGTCTCATCTACTTTACGTGCAGCACAATATTCTTCTAGCATATTTCAGTTAT
TTTATAACAGAAGCTCCCTATTTCTTACTCCCACGAATATTAGTCCACCCCTTTTCTCCTCTTCACTCTTCTGTGTTCTTTTTCCAGTTCTCACTTCCCA
CACACTCTCTCTCTCCTATTGTTTTTTCTTCTCCAATTCCTCTCTTGGCCAACTACCACTATAAGAAAGACAGATATTTGTGGCCAGCCAATTGGTCACA
AAAAAGTACCAGCACGGCCGTATTCTACTTGCATGTGTTAAGCATATAGCTAGCGTTCCTTCTTTGTCTTTCTTTCAATCAAAATAAGAGAACAAAGAAA
CCACTCAAAAATGAAAGTTAGAAAAAGAAGTTTCCGTAAGAACTAGCGCTAGACTTCTTCCCCCCTTTCTACTTTTCCTCTCTCCCTTTGTTTGTGCTTC
TACCCGGGCTTTTCATTCTGTTTTATAGGGCGGGCTCTTTTTATTAAAGGTGTAAGCTCCTTAATGCCCGAAGTATGGATAAGTTGCGGAGCCAGTTTCG
TTGCTTCGGCGCTAGGTGGGGCTCTTATCTCTTGCATGGAGGGGGGAGTACCTCTT