« Back to Medicago truncatula search


Detailed information on CNT30144535


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9SU35|ERLL1_ARATH, E-value = 9e-21

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30144535

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (74 aa)
MYESTKHINTCTQLQSINGTCLLCWWWWIRYKWWWRTRCFTRWCWWCHNWRCWCWWSYNRWWLHIRWCYRHNWR*

>peptide 2 (87 aa)
MWWENNWWLRNIRWCYRYNWWFRNIGWSHNRWFRDIWWWFHNWGFWYVRWMYYWRFNNWWFWNIRWMWFWNMWWVYCWGFGMMRWFW*

>peptide 3 (31 aa)
MHPTSKHQWNMFVVLVVVDKVQVVVEDKVFH*

Sequence

>CNT30144535
CTTCAAAATATAAATGTACTAGCTTTGTGCATATATGATTAAGAAGCTGGGCACTTAAACCCTTCTGGTGGAGTTTTGCCACAATCAATGAGAACCTGAA
GAGCAAGGGGGATAACAAGATTGATATTAAGAAGTTTAAGTCTAATAGTGGTGCAAAGACATATAGCAGCATCCAAATCAACAAGTCCTTGAAGCAATGG
ACAACATGTTTGTTTAGCACTTCCACCTATACCAATATGTATGAGTCCACCAAGCACATCAACACATGCACCCAACTTCAAAGCATCAATGGAACATGTT
TGTTGTGCTGGTGGTGGTGGATAAGGTACAAGTGGTGGTGGAGGACAAGGTGTTTCACTAGGTGGTGTTGGTGGTGTCACAATTGGAGGTGTTGGTGTTG
GTGGAGTTACAATAGGTGGTGGTTGCACATAAGGTGGTGTTACAGGCACAACTGGAGGTAGAGGAACATGTGGTGGAAAAACAATTGGTGGTTTCACAAT
TGGAGGTGTTGGTACATAAGGTGGTGGTGATGGTACAACTGGAGGTAGAGGAACATGTGGTGGGAAAACAATTGGTGGCTTAGGAACATAAGGTGGTGTT
ACAGGTACAACTGGTGGTTTAGGAACATAGGGTGGTCTCACAACAGGTGGTTTAGGGACATATGGTGGTGGTTTCACAACTGGGGGTTTTGGTACGTAAG
GTGGATGTACTATTGGAGGTTTAACAATTGGTGGTTTTGGAACATAAGGTGGATGTGGTTTTGGAACATGTGGTGGGTGTACTGCTGGGGGTTTGGGATG
ATGAGGTGGTTTTGGTGATGGTTTAGGAGGATATCTTGGTGGTTTATGAACTGGTGGTTTAGGAGTAGGAGAATGCTTTGGTGGTTTGTGAACTGGTGGC
TTAACAATAGGAGGGTGGTGTGAAGGTGGTTTAGGGCTTGGGTAAGGACAATAAGGGCAAGCAAGAACATTGAGTAAGGTACTCAAGTTCAAGAGAAGGA
TCAAAACATTGGCTATAGCATAGTTAGCCATGTTTTAAAGAAAGTAGTGTAGTTTACTATGAAGTCATACACTTAAGAGAATTGAG