Detailed information on CNT30144042


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P06353|H33_HORVU, E-value = 5e-15

BLAST vs NONCODE:
NONMTRT000713, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30196405Medicago truncatulaPisum sativum3.8132.4384.5284reverse complement

Expression of CNT30144042

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (49 aa)
MHNAFHLLPLQHPLMTDSYTKILVSFNAGDCTKKCKKSEKAKKPLYTRN*

>peptide 2 (41 aa)
MISGFPELLSITTIMTSYILKLKFQRFVREITKDFKTDLRF*

>peptide 3 (61 aa)
MQGIAQRNARNRKKQKNPYILGTKLLVRKRDELVWFFGYKFFLVLVLFFSLQIYFPKKAII*

>peptide 4 (58 aa)
MELLDNLCLVVLMNYAFGLYLSAQLMLNRFTLYLHNLNEELLYRQGYLHHSILSAFFE*

>peptide 5 (29 aa)
MSWYGFLVISSFWFWFCSLAYRSISQRKQ*

>peptide 6 (28 aa)
MNKNVNRYLKLFKLLIHDSNLIIKVHGYA

>peptide 7 (33 aa)
MLCFVSILRPVQLVQAKSISKVLMVFFSRMLSM*

>peptide 8 (31 aa)
MCSVNFEDNEPSSFFDWQTSETSFQPLISQD*

Sequence

>CNT30144042
TTTGTGTTTACAATTGCATTTACATGCATGTAATGTGTCTATATAAGTCAGTATGGGTTTTGTATGGTCTGGTAATTATTAGGTGAGGAGGGATTTAAGG
CTTCTGCAGTTGGCGAACTTGGAGGAGCTTGTAAAATCATGCTTCTCTGTTATCTAAGAGGATAGACCAAAACAGAAGATTCATCTTTTAGAGAGATAGG
TTTATGTTATTTATTTTTTTAATTTTTTTTTTTTGGAGTTTTCCTAATTATATGTGCGGAGGTTTAATTTAGATATTAAACAAAGATAACTGAGGAGGTG
ACATAATTGTGTGTATAAAACATGTAGAGTGTCTTTTTCTGTTCACATTTCATGCATAATGCATTTCATCTCTTACCACTGCAACACCCCTTAATGACCG
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GAAAGCAATAATTTGAACAATTCTTTAGGGTCTGTTTAGTTTTTTATTTTTTATTTGAGAGGAGGTGAGGAGAAGGGAGGAAAGTCAAATCCCTCCTAAT
CTAATTTTATCTCTCCTCCAATCCTCAAATTTTTTCGATCTCGACTTAGCGAAGTTTAAGTATATTTTCTTTATTTTGTCTTTTGTTTCATTAGCTTCTA
CCATGGAATTGTTAGACAACTTATGTTTGGTGGTTTTGATGAACTATGCGTTTGGACTTTATCTCAGTGCACAACTTATGTTAAACAGATTTACTTTGTA
CTTGCATAATCTTAATGAAGAGTTACTTTATCGGCAAGGTTATTTGCACCACAGTATATTAAGTGCATTTTTTGAATGATCTCCGGCTTTCCTGAATTGT
TATCTATCACCACAATTATGACGAGCTATATTTTGAAACTTAAGTTCCAAAGATTTGTTAGAGAAATCACGAAGGATTTCAAAACAGATCTCCGATTTTA
GAGTAGTACTGTTTCTGCTCTTCAAGAAGCCAGTGTAGCTTATCTTGTTGGTTTTTTTTAAGATAATAATATATGTTGTATTCATGTGAACTGCTAAGAT
ATTTATCAGTTATTACTGTTCCTAAGGTTATCAGTTATGCAGGTTAAGCTATTAGTCTATTGTGACAATGCTATTAGTCTATTATTGTATACTAGGAACT
AAGCCTTTTGATTGATTATATATCTAATTGAACAAGTAATTATTATATATGCTTACATAGTTAATACCTTTTAAAATGGAGACTACCTGACTTTAATATC
TTTTTTTTTTTCTATATAATTTTGCTTCTATTTAAGCTTATAGGGTGATGGCTATCTAGCTTGTGAAGTTTGTGTTTCGGCCTACATATTGTTTTTGTTT
TCTTACTGTAGTATTATTTGGTATAAAGTTTCATGTTGTATTGTTTTCCGATTTGATAAAGTTTCGAAAGTTGGAGAGGTTCTGGTTTGATTAACTCACA
CACGAGCTGCTGCTTTAAGTGAAACTGGACAGTTTCCACCAAAACTATTGAAGGAGGTCGTATGAGAAGAAATTATGTGCTCTGTTAATTTCGAAGACAA
TGAACCTTCAAGTTTTTTTGATTGGCAGACATCTGAAACATCTTTTCAACCTTTGATTTCTCAAGATTAAGGGTTTTCCTCTATATGATTTTCCTGCATA
TTATGATATTAAACACTTTTGTTTGATTTAGCTTATCTAACTTTTGTGTTGCTATTTTTGGGTTCAGCAACTTCATAAATGATGCAGCCAAGAAAGGTAG
TGATTCCAAACTTCTGAATGCGCCAAAGGATCCGAATATTCCTCATATAGATGCGGATATTGAAGATCCTCAACTATACATCTTCTATGGCTTTTAGAGG
TCTCTATTTGTAGCTGCATGCTCTGTTTTGTTTCAATCCTCCGACCGGTACAGCTTGTTCAGGCGAAGAGTATTAGTAAAGTTTTAATGGTTTTCTTTAG
CAGAATGCTTTCGATGTAATGAACAAAAATGTAAATAGATATTTGAAGTTATTTAAATTGCTAATACATGATTCTAATCTTATCATAAAAGTCCATGGTT
ATGCTCC