Detailed information on CNT30143841


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P93822|ERF97_ARATH, E-value = 7e-10

BLAST vs NONCODE:
NONMTRT000136, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30268958Medicago truncatulaChenopodium quinoa6.6528.7480.75213forward
CNT3045660Medicago truncatulaPrunus dulcis2.922.284.9593forward
CNT30173048Medicago truncatulaTrifolium pratense3.3427.2388.79107forward
CNT30598582Medicago truncatulaFraxinus excelsior3.9939.0282.81128forward
CNT30607170Medicago truncatulaGossypium raimondii6.6129.3281.6212forward
CNT30654158Medicago truncatulaRosa chinensis3.8438.882.93123forward
CNT30154187Medicago truncatulaPrunus persica6.7126.1682.79215forward

Expression of CNT30143841

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MFQLLKKFKSYSLLWLQTKKVHFIFGTHMC*

>peptide 2 (36 aa)
MYFCFYNLHNIKYSHSRYYLSARRIYKQIQISGLDL*

>peptide 3 (43 aa)
PLQIIGQTPLQVVSKLIYIFASNYGNPTAGCIQLWIWIWIILM*

>peptide 4 (46 aa)
MFNLTILTLAIKLDYQNLSSQLLNYSILIESPLKSKIYGHKILSGP*

>peptide 5 (39 aa)
MDMDLDYSNVARKIILSISLESLVLIRNIVFVPKQVKRI*

>peptide 6 (41 aa)
MYPVAQPLFIGIRQLVSTTSMFMNVCVRAPIFAHLFSNYNY*

>peptide 7 (53 aa)
MCFVMNPFTFSFSSTHPQLIYLFLVSLQIHSLLVTCVVSTRSILYIFVDNLIV*

>peptide 8 (54 aa)
MFTTQEHLPVCLDSDFIWHKHVLLKISIFVWRLFRDRLPTKSNLAKHSIITTTD*

>peptide 9 (29 aa)
MQLDHKLKQHLQHYQMFLAKLFFLLLLYL*

Sequence

>CNT30143841
TCCCCTTCAAATTATTGGTCAAACCCCACTGCAGGTTGTATCGAAATTAATATATATATTTGCCTCAAATTATGGTAACCCCACTGCAGGTTGTATTCAA
TTATGGATATGGATTTGGATTATTCTAATGTAGCCAGAAAAATAATATTATCTATTAGTTTAGAGAGTTTAGTGCTAATAAGAAACATAGTTTTTGTCCC
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AATTAGAAGCCCTTAGTTCGCTATTTCTAATTCAAGTCTTCGTTTTTCTGTCTCAAGTTCAATATCAAAAATGTTAAGGTTCAAAATATTGTCTCTTAAC
TTTTTCACCATGCATGTTTTTCTTTTTTTATCTATAGCGAAGTAAAAAGCTGAAACTTACACAATTTCATCTTGAGGACTTGGATTTGAATTCTAGTAAA
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CCCTCCGACCAAAAGAAGAGATCCCATTGAAGCGGCTAGTCCTACGCATACTGTATGTACTTCTGCTTCTACAACTTGCATAATATCAAATATAGCCATT
CCAGATATTACCTCTCCGCCCGGAGAATTTATAAACAAATACAAATCTCTGGTCTTGACCTCTAAACTGAGATATACCATTAGACCAACAAGTTGATTTG
ATATTTCAGTGTTGACCTCTTGACCTTAATTTTTATTTATTATAATTAATAGGACAGTAATAAAAAAATTAAGAAACTAAACTACTGCATCAAAATTGAC
AGCAATAAGAACCGAATCTGAGACCTTGAGGAGTAGAACACTCCAAGATCCCACAATGAAAACATTAAATTGCTTAAAATTATAAATATTGAAATATGTT
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AGGTTGATATTTGAACATTAGTTCGCTACATGGTGGAAGTCTAGACTCTTCTTTCAGGCCTAAACTTCTTCAATAAGTTTTTAAATTTTGTTAAAAATAC
CAGATTATAATGAACAAAAATGTAATGAAATGACATAAACATTCCCTAAAATAACAAGCAATGAAATGATATAAGTTTTTTTGCTTAAAAAAAAAAAATA
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CTCTTCATAGGCATTAGGCAACTAGTTTCGACAACTTCAATGTTCATGAATGTATGTGTGCGTGCACCTATCTTCGCCCACTTGTTTTCAAATTATAATT
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TGAACAGAAAAATTGAGCACAGCATTATTACCTCTCATTGAGAATGCAGCTTGATCATAAGCTAAAGCAGCATCTTCAGCACTATCAAATGTTCCTAGCC
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GTGTTTAGACTCTGATTTTATTTGGCACAAACATGTTCTGTTGAAGATTTCCATTTTTGTGTGGCGGTTGTTTCGCGATCGATTACCAACTAAGTCGAAT
TTGGCGAAGCACAGTATTATTACTACAACAGATTGATTTTGTGTTGCTGGGTGCAGTCACGAGGATGACGTTCAACATTTGTTCCTCTCGTGTAGCACAT
TTGGTACTCTGTGGCAGCTAATGCGGTCGTGGAACGGTTTCGATGGTGCGGATTCTTAGGTGATTACAACTCATTTTCAGTAGTTTGTTTACTACATAGA
TAGTTTGAAATCGCGGCGGTCTTTTCTTCAGTTGATTTGGTTACTGTGTGTTTGGATTGCGTAGAATAAGCATAACAACAAGTTATTTAAGCAGAAAGAA
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TTTATAAATTTTTCGCGGTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGTGGTGGCTATAAAATCCAAGAATTTTTTTTGTAATAAAGAATCCAGGCAGATGAGCCAAAAA
TCCAG