Detailed information on CNT30117812


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30555414Oryza nivaraOryza glaberrima55.2937.7898.042038reverse complement
CNT30371298Oryza nivaraOryza glumipatula55.2636.3398.182037forward
CNT30109435Oryza nivaraOryza longistaminata83.859.795.953089forward
CNT30104296Oryza nivaraOryza rufipogon24.8244.7999.13915reverse complement
CNT30578161Oryza nivaraOryza barthii55.2636.7698.432037reverse complement

Expression of CNT30117812

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (64 aa)
MQARSSPQTLIAVNCAIDGFLPLLARVISSFPFPPPPRVGWAGKSVGKGSIGFNLTWFAALLLI*

>peptide 2 (51 aa)
MMLFGGNLSAWYFAVKSNPAMVHGSVNLVRTFKHGHSSHRILMLTCLLPES*

>peptide 3 (42 aa)
MLFIGIDSTFEIDVNLLNFVANHPQYFSKYIIRTFSLCTLKI*

>peptide 4 (39 aa)
MYHLINTVSFILFMMNMYSVCMLISFFRVVLVYFNIFML*

>peptide 5 (44 aa)
PVSVSDCDQNSRAPTDSVSSSVPLLFVPFLYKCKPVPPLRLSSL*

>peptide 6 (43 aa)
MVGSVQYSLALCLFVWCVVFNVLFKHPKDVGNCNYQMIRTSMS*

>peptide 7 (74 aa)
PYPSPTATRIVGRPPTRFPPRCLSSSFPSSINASPFLPSDSHRCELRDRWLPSSSRAGYFFLPLSPSAAGGLGW*

>peptide 8 (36 aa)
MSYISLTFHFFLLIINSSFAYFPSTFCYKGYIISMF*

>peptide 9 (37 aa)
MYFINLYITMICTENKLMALFSPDLILHIECTTSFRN*

Sequence

>CNT30117812
CCCGTATCCGTCTCCGACTGCGACCAGAATAGTCGGGCGCCCACCGACTCGGTTTCCTCCTCGGTGCCTCTCCTCTTCGTTCCCTTCCTCTATAAATGCA
AGCCCGTTCCTCCCCTCAGACTCTCATCGCTGTGAATTGCGCGATCGATGGCTTCCTTCCTCTTCTCGCGCGGGTTATTTCTTCCTTCCCCTTTCCCCCT
CCGCCGCGGGTGGGCTGGGCTGGTAAGTCGGTAGGTAAGGGATCCATCGGTTTCAATCTCACCTGGTTCGCTGCCCTTTTGTTGATTTGATCATCAGGTG
GTGCTTTGATCGGTTCGGTCCGGTTTCTAGTTTCGGTGACTGCTTGATCCGTTCGGTTTTGGGGGTCTAGTTTCGGCGATTCGTCTCCTGCTGTTGCGTT
AGTTCTCTCAACGGCCCTTCTTTCGATTGGTTTATGGCTAATCGTGATTTGTTGTTCTGGCAATACTGATTGCGAGGTCGGTTGGTTTGCTTCACTTTCT
GTTCGGTGAGATGGATTGTCAGCTTAATTAAGCTGTACCGTGGATATTTTGGGTATGATAGATAAAATGAAGTTTGTGCTCTGAAATGGTCAATGGTTAG
GATTGCTCACTGGCCTAAGATTATTGTTGATTATTGTTCTGTTCCTTTCAAGTTTGTGCATTTGTGATGCTTGGTAGTTCGAGACAATTCGGCAGCTTAC
AAATTATATACAATTTTTCATTCAGATCTGGTATTTTTATGATATAAGGTCAAGTCATATCAGAACATTTAAACATGATCGTGGTGGCTTTCTTAGGTTT
GCTCAGAGCTTTCAAATCACCTCTGTTAATTTGTTAAATTCCAGCAAGAAAGAGTGCTAAAGTTTGAGTTAAACTAGGGTGTTGGAAGATTCTTCAGTAT
TGTTCTTCTGTGTCAGTTCTTAGTTAAAGTTTAACTTCTGGATTTCTTTCACGAGGATTTAAGGAGCTCTTTTTGACTGCCTTCCCTGTGGATTACTTTA
TCGTAGTACAGGAACTACAGATTACTTGCTGCTTGACCTGTTCAGTTTGAGTTGGTTTGCTTCCATTAGAAGCGATTGTCCGACCATTTAATCTGCATTA
TGAACATTTTTGGCATATTGAAACCAGAGAAACTGAAGCCTGTGGTATGAATTGGTCATGGCTAGGATTAGACATTGGTGTATAAGATGGTTTCTCCATT
CCATTCAAGACTGGTGCTACTTCTTTTGTCATCAAAACTAACAAGTGAATGATGTTATTTGGAGGAAATTTATCTGCTTGGTACTTTGCTGTTAAGTCAA
ATCCTGCTATGGTTCATGGATCAGTCAATCTTGTCAGAACATTTAAACATGGTCATAGTTCTCACAGAATTTTGATGTTAACTTGTTTACTTCCGGAAAG
CTAATTTATCAGTTAAGATGGAGATGGTTATGTAGTAGCTAAAAGGCCCATCCTAAAGTTTCTATGGTAGATGATTCTTTTGGCAGTTACTTCCTTTGAA
CAATATACAAGGTTATGAAGGTGATGCTGGAATCTTTTGACTAATGGTGAAAATAATTTGAAGATTTGTTTCAAGAAAATTGATGGAACTGAATTTGCTT
TCCTGCTCTGAGAAGTAAATTCGATGGTTGAGTGTAAAGTGTGCCATTATAAAACCATCTATTAAATGTTCTTGTGAGTAGAAATCTATGCTTTATGAAC
TGTGGAAGAGTTATCAGTAGCACTATCTGATCTCTAATTAGTTGGCCCAACTTGTTTCTCTAGTAGTATCTTTAACATCTGGGCATGTAATGTTCTATAA
CTAGCTAGATGGTGGGTTCAGTCCAGTATAGTTTGGCCCTTTGTCTGTTCGTTTGGTGCGTTGTCTTCAATGTGCTCTTTAAGCATCCTAAAGATGTTGG
AAATTGTAATTATCAAATGATTCGGACTTCCATGTCCTGATTTGGTCTGTAAGGTTGTTGTAATATGATAATTTATTTTGACAATTATGTATTTTATTAA
CTTATATATTACCATGATCTGTACGGAAAATAAGTTGATGGCATTGTTTTCTCCTGATTTAATTTTGCATATTGAATGTACCACCTCATTCAGGAACTAG
GATATTTCAAGTAAATGGCAGGGTCCACTGTTTTGAAAGTTGCTCATCTTCTAACTAAGTTTGTAGATAACTGAAGTTTACAGTCTCAACATTGTTTGTC
TAGGCTAAGATAAAAATGTGGATGTTTTCTAAATATTATGCTTTTTATAGGAATTGATAGCACTTTTGAAATTGACGTAAATCTCTTGAACTTTGTTGCT
AATCACCCACAATATTTTTCGAAATATATCATACGTACATTTTCACTATGTACACTAAAAATATAATTCTGCTAACTTGTCTGTAGATTATCTCCCCTGA
CATTAATTATCTTTTATATTTTCTTCTTACAGTTCGTCTGGCACATGCCTTTTTTTAGTGCCCCCACTTTAAGATTTACCGAGAAAGGACTTTAATTAAG
GCTAGTATCTCATTCATTGTCGCTTACCAAAGAGATTGTTTGAATGTTGTGTATGTTGTGTAGATAGTTCCATACTCAGAGCAACTAATATATACTATCT
TTTTTTGCCTGTATGGATGTGCTATATAATGGGTGCCCTCCTCTTCGTATAATATTACGCAGTTCATAAAAATGTCTCACTTGATTAACACTATCATTTA
TTTGTTTGACTGTTTGTATGTTGTGTATGTAGTGCCATACTAACAGAGCTACTAATATATACTATCTTTTTGCCTGTATGGATGAGCTATAATGGGTGCC
CTCTTCGTATAATATTATGACATTTATTCAAAATGTATCACTTGATTAACACAGTTTCATTTATTTTATTTATGATGAATATGTACTCAGTATGCATGCT
TATTAGTTTTTTCAGGGTAGTGCTTGTTTATTTCAATATCTTCATGCTTTGAAGATAAATTAATTAGTTCAACCTAACCTTGTTTTGTGTAGAATTCTTC
ATGTGTGGAACTTCCATTTCATTTTAGTATGGTCCTTGCATGTTCTCGTTAGATGGCTAGCACTCTTTTCTTTATTTGATTTGAATTTTGTCGTTAGGTT
TGTTTTGTTGCATCATTTTTCTTTTGTGAAATGAGCTAGGGCAATCATAAGCTGTTATTTGCCTTCGATTGAAGTGTCATAGGTCGCCGTTTTATTTGTC
TTGGGTAGTGGTTCATTCTTGTTTGTACGTTCAGAATTTTAGTTTCAAGAACATTGTTCACCATTCTATTATTATGTCATTTAAGGTGAATTTTCTAAAG
CGAACTTGAAGAATACTAATCCTTTATAGTTCAGCTAAACAGCAATATGGTGGTTTTATTTATGCATCAAACTTTGTGTGCATGGTTTCAATTTTTTTTT
AATCTGAACCAGTCTTAATCGCTCCATATTATCTGGTGGTTTTAAATCTATTTTTATTTAATGCTTAAGTGCTTTTAGTTATTTTTTTATTTTATTGTCT
AAAACTTGATGCTCTCTGTGAGCTAAATATATCCTATGTCCTATATATCCTTAACATTTCATTTCTTCTTGCTAATTATTAATTCCAGCTTTGCTTATTT
TCCATCTACATTTTGTTACAAAGGCTATATAATATCAATGTTCTAGGTTGCTTTCCTAATGTTTGTTCGTTTGATGTCAAAATATG