« Back to Oryza nivara search


Detailed information on CNT30117608


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT001792, E-value = 0.0

Expression of CNT30117608

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (28 aa)
MWLPRMLHTLTPTNAHMYTLPPMSTSKSL

>peptide 2 (34 aa)
EASLAASPSRRRPRLRLCAAAAVRPTPVATAIVS*

>peptide 3 (66 aa)
MITIQLLDITDRMALMLRYLFVFQSIFQFMTLLMFHYSGCSVYIIHEPCVVMGVQFGSLFMILEKR*

Sequence

>CNT30117608
AGGAGGCATCGCTAGCTGCTAGCCCTAGCCGCCGCCGTCCGCGTCTGCGCCTCTGCGCCGCCGCTGCTGTGCGTCCGACGCCGGTCGCCACAGCCATCGT
CTCCTAATCTCCTTGAGGAGGAGGTTCTGAAGGCTCAGGAAAGCAAGAGGGGAAAAGGAGAAAAAAAGAGAGGCAAAGTTGGGGATTTTCTGGGATTTCA
CGAATTGATCTCGAATTTGTTTTCCTCCTCAGTTAGGGTGTAGAGGGTTCCAACGTTGGAGGAGTTGAGTCAGATTATCGAAGGAGTTAAGACAAGTACA
AGACGGACAAACTGAGTTGTTTTGTTTGGTTTTACTTGCATGATTACTATTCAATTGCTTGATATCACTGATCGTATGGCTCTGATGTTACGCTACTTAT
TCGTGTTTCAATCCATATTCCAATTCATGACGTTATTAATGTTTCATTATTCCGGATGTTCTGTTTACATTATTCATGAACCATGCGTAGTCATGGGAGT
GCAATTTGGGTCTTTATTCATGATCCTTGAGAAGCGCTGATCACGCTTGCTCGGCTTACCGGTAATGCTAAGAGGATATTCATACCTGCCCTGGAGGGAA
CTACTATCTTTTAACTTTTTTGGTTTAAAATAAAGTAAATCCAACCCTTCATATTGGTTTCTTAATGCATAAATCATGTGTATGTTTTTTACTAGTTCAA
TATTGTACTTGCTGAGTATTCTTTACTTATTCTTGTGTTTAATTTGGTTTTTAGGTACCTAATGACATTGATCGGCATGGGGCGGGAGTAGCACCTTTGG
ACTACACATTATTATTGCACACTAATGAAATTTAGTTTTAGACTATGTTTTTGCTCAGCATAAGTTTTTCATAGAACTTGTAAAGGTCATTTAAAGTTCT
GGTCCTTATTTTCACGTGGAATTTATAGAGCTAGGATGGTTTGGATTGTGTGGGTTATTTCGTTATTGAGTTATCTTACAACTGCCTGTTGTGGATGTTC
GTATTTTTAGGGGAGGCTCTGCCGAAATTTCTAATAATTTTGGGACTTAGTTTTTTAGTGTATTTTGGTGTGGCATTCTAGGTATGTGGTTACCTAGGAT
GTTACACACACTCACCCCTACGAACGCACACATGTATACTCTACCCCCTATGAGTACCTCTAAGAGTTTGGG