Detailed information on CNT30116966


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q6ENG7|ATPB_ORYNI, E-value = 2e-116

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30116966

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (34 aa)
MGAWFGNTPIWPLLVDKIISFTSQSQIIRLGVST*

>peptide 2 (38 aa)
MKDFPIFLDFLKIFLNLTMNRLIYLDIYRYNVHYGVDL*

>peptide 3 (56 aa)
MSLLSRFSPFNFFFSSFPLNSSLLDSCLKESKKMNRTKNTQKRAYRPETITKSSSQ*

>peptide 4 (45 aa)
MPVKNCFNLSPKQTRSISLKINTQPYGYMKGANSFIPHPIRGNKT*

>peptide 5 (31 aa)
MSLPSSASFPKMMISLLTILAKPLHRTAVNH*

>peptide 6 (46 aa)
MLRDSVLIIQILFVFWMQFQLVFGYKSRKCIFFLNMLLREKGVNPF*

>peptide 7 (42 aa)
MKQRRFLTVSGWYFDRGPFLYFLFCSELNKEFGEENIFPHLS*

>peptide 8 (83 aa)
MCKCCSRSRVGQIVRRYINRLDRSYRSLFSRSNSFLQRTHFCTKSRLITHKRKGLRWIPRYPETRKGVASDEMLQGIENKHRFG

>peptide 9 (73 aa)
MGHVGFSISIYHRTLRVPEPSFFASFRKRKTLNQEQYKFYCPPFTRKLVIKLHYSLFKMHQSESLENIQVPYF*

>peptide 10 (58 aa)
MQNYASRLCTHNPNSICFLDAISISLWVQIAKMHILPQYAIERKRSKSFLRTKVFIGI*

Sequence

>CNT30116966
GGTCAAAATGGGTAGAATCCATATCAGTCCATAGACTTCTTTTAATAATTCCAAGTTCGAAAAAGAATTGATAGCTTCTACCTGTACCCTGTCTATTATC
ATTTCAACGATCAACTTCTCCCATAATGATATCTATACTACCTAATATCGTCATGATATCAGCCAATTTCATTTTTTTGACTAGCTGAGGAAGAATTTGA
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GCAGTTTCATAATGTTCGTTGCCAACGATCCGAGGTTGTAACATAGTTGAGGTTGAATCTAAAGGATCTACTGCAGGATAAATCCCTTTGGAAGCTAATC
CTCTGGAAAGTACGGTAGTAGCATCCAAATGTGCAAATGTTGTAGCAGGAGCAGGGTCGGTCAAATCGTCCGCAGGTACATAAACCGCTTGGATCGAAGT
TATAGATCCCTTTTTAGTAGAAGTAATTCTTTCTTGCAAAGAACCCATTTTTGTACTAAGAGTAGGTTGATAACCCACAAGAGGAAAGGCTTGCGGTGGA
TACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTTCAGGGAATTGAAAATAAGCATAGATTCGGAG