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Detailed information on CNT30116796


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q10HD0|CB23_ORYSJ, E-value = 2e-128

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30116796

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (88 aa)
MVRWLAPSRSCRCAHLPGTKLVAYAQALLATGSATWSKRFSMGPLPVTMAWTKKPNMENMARRPFLSSFTLSSAKVSGPSPSGPPPTR*

>peptide 2 (35 aa)
SWLRCRSYNNDTSLIRSSLGCGLRLTLNLDPKKQR*

>peptide 3 (65 aa)
MHCCNCNCRVGAWLLQVYTWYVGWHHLDRVVVLTCRGRSWWRMPRRCWRRGRRRGRRGSRWGPCR*

Sequence

>CNT30116796
TAGCTGGCTTCGTTGTAGATCCTATAATAACGATACATCATTAATTCGATCATCCCTTGGATGCGGCCTGCGGCTTACATTAAATCTCGATCCAAAGAAG
CAAAGATGATGACAGACAGAAATTAATTAAGCTAGAAATCTCCTCGATCGATCACACACACACACACACAATTAAGGTACATACATACATGCACTGCTGC
AACTGCAACTGCAGGGTCGGTGCGTGGCTACTACAAGTGTACACATGGTACGTTGGTTGGCACCATCTCGATCGTGTCGTTGTGCTCACTTGCCGGGGAC
GAAGTTGGTGGCGTATGCCCAGGCGTTGTTGGCGACGGGGTCGGCGACGTGGTCGAAGAGGTTCTCGATGGGGCCCTTGCCGGTGACGATGGCCTGGACG
AAGAAGCCGAACATGGAGAACATGGCGAGGCGGCCGTTCTTGAGCTCCTTCACCTTGAGCTCGGCGAAGGTGTCAGGGCCCTCGCCGAGCGGGCCGCCGC
CGACGCGGTAGCCCTCGACGAATCCCATGAGCACCACCTGGACCGCCCAGATGGCGAGGATGCTCTGCGCGTGCACCAGGTTGGGGTTCCCCAGGTAGTC
GAGCCCCCCCTCGGAGAAGATCTGCGCGCCGGCCTTGAACCACACCGCCTCCCCGAACTTCACCCCGTTCTTGGACAGGATCTCCGGGAAGACGCAGCCC
AGCGCCCCCAGCATTGCCCACCGCGAGTGGATCACCTCCAGCTCCCTGTTCCTCGCGAACGTCTCCGGGTCGGCCGATAGCCCCGCCGTGTCCCACCCGT
AGTCTCCCGGGAACTCTCCGGTCAGGAAGCTGGTGGTCTGGTGCAGCGCCGACGCGGCCATCGTTCTAACGAGGGCGATGCGGCGGCGGTTGGGTTGGTT
TTTTGTGGTGTGTGGTGGAGATGGG