« Back to Oryza nivara search


Detailed information on CNT30116290


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONOSAT001148, E-value = 7e-66

Expression of CNT30116290

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (76 aa)
KKSSDCRSKADWTPCQLLLFTAQSRRFLADSTKFLFGKACCEDCLAGLHTLRHGYQYWGLHTNIVNKIIPNVLVNS*

>peptide 2 (44 aa)
KKVQIVEAKLTGHHANCYCLLHNQGDFWLILLNFCLVKHAVRIV*

>peptide 3 (45 aa)
MDTNIGGSTPTSLTRSFQMCWSIHNRSAGLEFVSRYIHGIVFQYE*

>peptide 4 (34 aa)
MLPLTFLIIHSCFLENCIYLCKIATRCTEDSISF*

Sequence

>CNT30116290
AAAAAAAAGTTCAGATTGTCGAAGCAAAGCTGACTGGACACCATGCCAATTGCTATTGTTTACTGCACAATCAAGGAGATTTTTGGCTGATTCTACTAAA
TTTCTGTTTGGTAAAGCATGCTGTGAGGATTGTTTAGCTGGCTTACACACATTAAGACATGGATACCAATATTGGGGGCTCCACACCAACATCGTTAACA
AGATCATTCCAAATGTGCTGGTCAATTCATAATCGATCAGCAGGCCTGGAATTTGTCTCAAGGTATATACATGGAATAGTGTTCCAATATGAGTAGTGAC
TAAAGCAGATTAATTTGAATTGTGAACTCTTTTACCAAGTGAACAGAGACTCTGTCAAATAATCAGGTCAGTACTAAAATCCTATTGATCACTATAAAAT
TACAATCTCATTTGATGTTGCCTTTTTCCTGGTGATCATAGGAGTGACCCCTTTTTTCATGCTTCAAAGGTATATGGTTTTGTATAAAATTCCATTTCTC
AGTATAGAAGTTAAAACTCTCATTTTTGTCTGAACTAATAAACTATTGTTCTTCTCCAAGATTTGTTCACTAAGGCTCCGTTCGTTCTGGGGACATAGGG
GAGATTTGAGTCTCGTTTTCCGCGCGCACGCTTTTTAAACTACTAAACGGTGTGTTTTTTGCAAAAAAATTTCTATAGCAAAGTTGCTTTAAAAAATCAT
ATTAATCCATTTTTGAAATTTAAAATAGTTAATACTTAATTAATCATGAGCTAATGGCTCACCTTGTTTTGCGTATCTTCCCAATCTCCTCAATCCCCTT
CTCCTCAAACACACCCTAAGTTGCAATTGATAGCACATTTTTACATTTTCTTGGCGCGTCCATTTGTGCCTCCACAGTTGCCTCATATGCTACCACTGAC
ATTTCTTATTATTCATTCCTGTTTCTTAGAGAATTGTATTTATCTGTGCAAAATTGCAACTCGATGTACTGAGGATTCTATAAGCTTTTAAAGATTACCG
TGAACACATAGTGTACTGTCCAGAGAATTACTCAGATTCATTTATGTCTAATGGATTGGATTCCAT