Detailed information on CNT30113924


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P0CH33|UBQ11_ARATH, E-value = 4e-86

BLAST vs NONCODE:
NONGMAT000502, E-value = 7e-72

Expression of CNT30113924

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (43 aa)
MKSALLLDVVVGEGSAVPPAAFRRRSRRCWFRRNPFLILDLGP*

>peptide 2 (41 aa)
NTTFIYYKTKILIPSGSYSTKLKENIFVSFWFPSNQINRKH*

>peptide 3 (81 aa)
MVSELSTSRVIEYGPVRVFTNICIPPRSLSNQMQRRLLLDVVIGEDQTLLVRRDSFLVLDLGLDVVDGVGALDLESYGLAG*

>peptide 4 (31 aa)
MVSELSTSRVIVLPVRVFTKICIPPLRRSTR*

>peptide 5 (29 aa)
MVSELSTSRVMVLPVRVLTKICIFSEEFGE

Sequence

>CNT30113924
AAAACACAACCTTTATTTATTATAAAACGAAAATACTAATTCCATCTGGTTCATATTCAACAAAATTAAAAGAAAACATATTTGTTTCATTTTGGTTCCC
ATCGAACCAAATTAACAGAAAACATTAAAAAACAAACTTCTTTAAAACTTCCCACCACGAAGACGGAGGACAAGGTGGAGGGTAGACTCCTTCTGGATAT
TGTAATCAGCAAGGGTGCGACCATCCTCCAACTGCTTCCCGGCAAAGATCAGACGCTGCTGGTCCGGTGGAATCCCCTCCTTGTCCTGGATCTTCGCCTT
CACGTTGTCGATTGTGTCCGAGCTCTCAACCTCGAGGGTGATCGTCTTGCCAGTGAGGGTTTTCACAAAATCTGCATCCCTCCACGGAGACGGAGCACCA
GATGAAGAGTGCTTCCTTCTGTATGTTGTAGTCGGCTAGGGTTCGGCCGTCCTCGAGCTGCTTTCCGGCGAAGATAAGCCTCTGCTGGTCCGGGGGAATA
CCTTCCTTGTCCTGGATCTTGGCTTTCACGTTGTCGATGGTGTCGGAGCTCTCGACCTCAAGGGTGATCGTCTTGCCGGTGAGGGTTTTCACAAAAATCT
GCATCCCTCCACTGAGACGGAGCACCAGATGAAGAGTGCTCTCCTTCTGGATGTTGTAGTCGGCGAGGGTTCGGCCGTCCCTCCAGCTGCTTTCCGGCGA
AGATCAAGACGCTGCTGGTTCCGGAGGAATCCCTTCCTTATCCTGGATCTTGGGCCTTGACGTTGTCGATGGTGTCGGAGCTCTCCACCTCCAGGGTGAT
CGAGTACGGTCCGGTTAGGGTTTTCACAAATATCTGCATACCACCGCGGAGCCTGAGTAACCAGATGCAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAATCGGC
GAGGATCAGACGCTGCTGGTCCGGCGGGATTCCTTCCTTGTCCTGGATCTTGGCCTTGACGTTGTCGATGGTGTCGGAGCTCTCGACCTCGAGAGTTATG
GTCTTGCCGGTTAGGGTTTTGACGAAGATCTGCATATTTTCAGAGGAATTCGGAGAGA