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Detailed information on CNT30106343


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3099647Oryza longistaminataOryza rufipogon9.1823.6183.33102reverse complement
CNT30115673Oryza longistaminataOryza nivara15.6630.6982.18174forward

Expression of CNT30106343

Sequence

>CNT30106343
ACACACATTTTTGTTAAAAATGATATAAATAATGTTTCTCTGTGCCATCTTTTCTTCCAACTAAGGATGAGATATTGAAGTGAACCAATGTTATAAAAAT
GTTTATTCCAACAAACGGACTATGATTTAAGGTTTAGGACATATGGAGCAGATATATATTCATACAACCGGATAGAACAACTTCATTCAGCGTCATTTAG
TGTCATTCAGTGTGATTAGTTATTTTACTATGTATTCGATCCAATAACGCATCGGGCACTACAAGAAGCAGGTCATGAAGAAAAGGTTCATTTTATACAT
CGTAACCAAGTTAGCTTCACAGCATCAAACCTAAGTAGAGGAATATCACAACTCTAGTATATGATTGATGTGAGATGATGGGTATGAAGTATTATATTGT
TTTTCGTTATCACTTTGACTCTGATAATATGATTAACATTGAAAAAGAATGATGCTATAAGTTATAAGTGCTATGAAACAAAACACTATAAGGCTTAATA
TAAATGTGATGTCCATTTTCAGTGACAATATATGTCAAGTTTTATAAACAAGGGTAAATTTGACAAAACTATATGAATGTTGATCAAACTATCACAGAAC
TATATATGTAAAATGATGTATCACAAAACTACATACTTAGCTTCAAATTTATCATAAAACTATAGATTTAAGGCCAAAGCATCACAAAACTACAGATGTG
ATAATATTAAATTTGTCGCAAAACTACAGATTTTAGAATTCAAATCCCTATCACCATTGTTATGTTGGAGCTATAAGTGTTGTAATTTTGTGACTAAATC
GTTTCTAAATATACAGTTTTGTGATAATTTTGTCACTAAAATGTAGTTTTGTGACACTCCATCTTGAATGTGTAGTTTTTTGGTAAATTTGATTTTAAAT
TTATAGTTTTGTGATAGTTTTATTACTAAATATGTAGTTTTGTGACACTTCATGTTGAACGTGTAGTTTTGTGGTAAATTTGATGTTATATCTATAATTT
TGTGATACACCAAGTTAAATGGACAGCTTTGTGATGGTGTAGTCACGGTATATATAATTGTGTGAAATTTACTCACAAAAATATTTTATTTTTAGTTAAT
TATTATTATTC