Detailed information on CNT30105215


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT004803, E-value = 3e-132

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30690859Oryza longistaminataOryza sativa59.76100.0697.251711forward
CNT30596990Oryza longistaminataOryza meridionalis16.5938.2195.16475forward
CNT30100381Oryza longistaminataOryza rufipogon9.0837.1498.46260forward
CNT30578529Oryza longistaminataOryza barthii10.7227.7187.62307forward

Expression of CNT30105215

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MLRLKYLCLAYLTYESFLIPGLYAHDALQIDKQQLFCY*

>peptide 2 (29 aa)
MCCTGVVLLPFLPMCNGFGALVIPVVWSY*

>peptide 3 (30 aa)
MICLILLHLSPSSLVKLEVTMSLGTDMQLP*

>peptide 4 (30 aa)
MHTVISSVQLYACMYVDLQWYIVNKKLCDLY

>peptide 5 (31 aa)
MENLVKYDMFDTFALESLKFSKIGGYYEFRD*

>peptide 6 (80 aa)
PPNPPSSSSLFFSFFLSPSRSLPAPPLHLRPPAAPCLRQPPRSHRRPESIPWLPTNLTPKLNLTPNLLNPRCSRRPTPAR*

>peptide 7 (36 aa)
MHAVKIHPMMAXXXXDFKELYTDIILNSNALVDHQR*

>peptide 8 (35 aa)
MPCFHLIFLDLSTQQSYLQLYSDFGDDISWPTESS*

>peptide 9 (32 aa)
MQPAANSGEIRTQESFPDLHYCCDPYSSLLPL*

>peptide 10 (56 aa)
HLTHLLPLLSFSRSSCLLHALSQRRRSTSGRPLLPASGSRPAVTAGQNRFRGSPQI*

>peptide 11 (41 aa)
MMYYDLSAGFGFPQKARMLKLNSTKMYMQSHTLTHTSICSD*

>peptide 12 (32 aa)
MIKSLYSYIYICLHIEITEFLKLIAHQLDLLL*

>peptide 13 (32 aa)
MALFISNEDRCIPITSNHTRACTDQSRCHVFI*

Sequence

>CNT30105215
CCCACCTAACCCACCTTCTTCCTCTTCTCTCTTTTTCTCGTTCTTCTTGTCTCCTTCACGCTCTCTCCCAGCGCCGCCGCTCCACCTCAGGCCGCCCGCT
GCTCCCTGCCTCCGGCAGCCGCCCCGCAGTCACCGCCGGCCAGAATCGATTCCGTGGCTCCCCACAAATCTAACCCCCAAGCTAAACCTAACTCCCAACC
TCCTCAACCCTAGATGCAGCCGGCGGCCAACTCCGGCGAGATAAGGACTCAAGAAAGTTTTCCTGACCTCCACTACTGCTGCGACCCCTACTCCTCTCTT
CTACCTCTCTAATCCCTAATGTGTTGTACTGGTGTGGTGCTTCTTCCTTTCCTGCCAATGTGTAATGGTTTTGGTGCACTAGTGATACCTGTTGTTTGGT
CCTATTAGCCACTAAATGATCAATTCTGTTAGTGTTATCTAAAGAATGATCTCTGCTAACTTTGATTTCTGGGACAAGCTCTGAGTTATCTAGATGATGC
ATATATGATATGAATGGATGAATGAATGTTCACAATAATAATCACCTAAATTGCAATACTGAAATTGAATCACACTAACATGATTAAGTCCTTATATAGT
TATATATATATATGCTTGCATATTGAAATAACTGAATTTCTGAAATTAATAGCACATCAGCTAGATTTGCTTCTATAATAAATCTTATTGAATGATGCTG
TAACCTACATGATTCTATACTTTACTGTTTCCTGTATAACTACAATCGCATATACTTAAACTGAAGATATATTTGTACACACTAATAGATGTCATTCTTT
TCTCTAAATATGCTCTGCTCTTCCAACTGACCTACAATTGATACCTATTATTCTGCTAATGGATCCTATATCCTCTATTTAGTTTCTAAACTGAGAATAG
ATCATTGCCTACCCATTTATGCTCTGCCTATTTAACTTGAAATACTAGCACAATATTGATCTTATCTTAAGCACTTGAGGTTAAATAGAACAGTGATTAT
TTCTAACTATGCATGCAGTCAAAATTCATCCTATGATGGCTNNNNNNNNNNTTGATTTTAAAGAACTATATACAGATATAATCCTTAACTCAAATGCACT
TGTAGATCATCAGAGATAATTCTTGCTGTTAACTATGTAATGAGATAGCTGATCTATACTTGAATTATCTTTTTTTTAAGAATCCACTAAATTTAAGATG
ATACTATATTGTCCAATTACTTATAAAAACTATGTCTTGAGTGCATATGATGTACTATGATTTAAGTGCAGGTTTTGGTTTTCCTCAAAAAGCTAGAATG
CTTAAGCTTAATTCCACAAAGATGTATATGCAGTCACACACTCTTACACATACTAGTATATGCTCAGATTAAAATACTTATGCCTTGCCTATCTCACTTA
TGAGTCTTTCTTGATCCCAGGTCTATATGCACATGATGCTCTCCAAATAGATAAACAGCAATTGTTCTGTTATTAAATCATGAATGGCCTTGTTTATATC
TAATGAAGACAGATGCATACCTATAACTTCTAATCATACTAGAGCATGCACAGATCAAAGTAGATGCCATGTTTTCATTTAATTTTTCTTGATTTATCTA
CTCAACAATCTTACCTTCAACTGTATTCTGATTTTGGTGATGATATTTCCTGGCCTACTGAATCCTCTTGAGCTTCCCTCAATTAATCTTCCTTTTTGTT
AATTAATTTATTTGCTAGTCCTAATTCTTGGCATCCTGCTGGAACTGCTACAGGTTGCTACTCCTCCTAGAGTTTGTTTGGCACCTTTTTGAGATGAAAT
CCCTTGCTTCCTCCTGAGCTTGAGCTGAAACCCCTTGCTCCACTTGTAAATCAGGTACTTGTCCTCTTGTCTCTTGTTTTCCAGGTACCTCTTGACTGCT
TCTTGCTATCTTTCTCGATCTGGTACCGGTGATTCTCTTCCTCCTCTTGAAGCTCATTCTCTTGCTTGATTTTTGCTCCATCTTGCTTATTGACCTGAGT
TTCTTGTTTCTTCTAAATCTCAAGCAAGCACTGCTTCACCTCCTACTCCCTTGTCTTTCTCCCTCTCTCTGGTTGCTTGACCACAGATGCTATAGTTGAG
CTGTGGTGTGGTTGCGGTATAGAACTTTTAGTTGGTTATTTCTCTTTCTCCCAATCTCCACTGATTTCCAGCCGTGGTTGCTTGCTGTTGCTGGGATCTT
ATTACTACTATGGCTGCTGTACTACTGCTCTGCTAGCTCGCTCTCCCTGGCTACTCTCTGATTGCCTTCCCTTGGATAGTACAATGTGATCTTGTAAGTT
GTATTCTCTCCGGATGAACTACTAGCTACTGCTGCTGCTCATTGCAGCCAAAAATGGTAGTACTACTGCTCACCTTGGTCTCTACGACAGTATAGCTTGG
TTTGAGAGAAATTTCACACTGAGATGGTTAATTTGGTGGAGCTGAACTAGTGACTCACCTGCTGGTTGTTTGGTGGCTTCATGCATGTTAGACACCTAAC
CATAGCATGCTCGGTGGAATGATGGATAGAATTTACTAATTTTTAGTTTAAATGGAAAATCTGGTAAAGTATGATATGTTTGATACTTTTGCACTTGAGT
CCCTCAAGTTTAGTAAAATTGGAGGTTACTATGAGTTTAGGGACTGATATGCAATTGCCCTAGAACTCAAGAGTTTTTCTGAAAGATAATTGATTATTAA
ATCTTTGACGAGATGGTTCAGTTTATGGTATTATATCTATAAGCACTATGTATATGCACAATATATGGGATGCATACTGTAATTTCTAGTGTACAATTAT
ATGCATGTATGTATGTAGACCTGCAGTGGTATATTGTGAATAAAAAACTGTGTGATCTCTACT