Detailed information on CNT30105188


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30694625Oryza longistaminataOryza sativa6.7934.3993.85130forward

Expression of CNT30105188

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (69 aa)
MKHVLSCALVQARTLSGSKLNRTAPEITNVLIIAKITKRLEDTETRSALTATNSARTTISRTQLCIALL*

>peptide 2 (45 aa)
ATGEVVVRAGSRCPFPHTKANFFSYDLILRGHRIFFYNYILILIS*

>peptide 3 (54 aa)
MLPVTKYIIIGFFVLPFASRCCFLLKCLHIRQINHEFKMQLLYGYSIVSCPQKL*

>peptide 4 (45 aa)
MCVNQERIIDCARTSEFRFPLTDNISLVPVLINSLSRRILLLLLL*

>peptide 5 (30 aa)
MSRLGTTAANGVFIFLGVKFLKYTDTHLKY*

Sequence

>CNT30105188
TTGCGACGGGAGAGGTGGTCGTTCGTGCCGGGTCGCGGTGTCCGTTTCCGCACACCAAAGCCAACTTTTTCTCGTATGATTTGATTTTGCGAGGGCATCG
TATTTTCTTTTATAATTATATACTTATACTTATCAGCTAAAATTTAAATTTGTGATTTTAGATTTAGAGCTGATTTTGAGGTATTTTTATCAAAAATTAT
TTTTTAAACATTATTTTTAGATCGCTAAGAGCATATATGTAAATATTTTATTTACAAATTATTTTTTTTTTACAAATACGCCGCATCGCTTACTCCGGCA
GTTGAGATGGGAAAAATGGAAAAAGGCGGGTGACGTCGTCTTCCTCCAACCGCCAACGGCGAGCTGCAACTGGAGAGGTGGGGGTAGATTTAACGTGCGG
CGCCAGATTTGTCCGGGCGGTTTCGCCGGTTTCGTAAGAAATTACTTCTACTTCTACATGAAACTGCTGCTATAGGTAACACATATTGGATTCTTGATCT
GGAATTAGCAAGTGGGCTTCCTTTTTTGTGCAAGCTGACCAAAGTGATGCTCAGTCACGAGCTGATGGTGGTGGTACCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTG
GTTGGGGTCACCTGAAAGCGATGCTGAACCTAACCATCATAAAATGTCTCGCCTTGGAACGACTGCTGCTAATGGTGTGTTTATTTTTCTAGGTGTAAAG
TTTTTAAAATATACGGATACACATTTAAAGTATTAAACGTAAACTAATAATAAAATAAATTGCATATCCCAGATGTAACCTGCGAGACGAATTTATTAAG
CCTAATTAATCTATCATTAGCAAATGTTTACGGTAGCATCACATTGTCAAATCATGGCGTAATTAGGTTCAAGAGATTCGCCTCGCAATTTACATGCAAA
CTGTGCAATTGGTTTTTTTCCACATTTAATGTCCCATGTATGTATGTGTTCAAATATTTGATGTGACGTTTTTAACAAAAAAAAATTAATCTAAACAAGG
CCTAACACAGTACTCGCAGCAAATGAAGCATGTCCTGTCCTGCGCGCTAGTACAAGCCCGGACACTGTCAGGATCGAAGCTGAACCGAACCGCCCCAGAG
ATCACGAACGTACTAATCATCGCCAAAATTACTAAACGCTTGGAGGACACCGAGACACGATCCGCTCTCACTGCCACCAATTCAGCGAGGACGACGATCT
CTCGCACACAGCTTTGCATTGCATTGCTGTAAGTAATGCTGTGCCATCGTGCTGATTACCACAGCGTCGTTAGGCTCACGACTCCATTCCATTAATTGAT
TTCATATTCTGATGTTGCCCGTCACTAAGTATATAATTATTGGGTTCTTTGTTCTCCCTTTCGCTTCACGCTGCTGCTTCCTGCTCAAGTGCTTACACAT
TAGACAGATCAATCACGAATTTAAGATGCAACTTTTATATGGCTACTCGATCGTTTCCTGCCCACAGAAACTTTAGCTTAGCTGCTGTCATATGTGTGTG
AATCAAGAACGGATAATAGATTGCGCACGCACGTCAGAGTTTCGGTTTCCTTTGACTGACAATATCAGCTTAGTACCTGTGTTGATTAACAGCTTGAGCA
GGAGAATTTTGCTACTACTCCTCCTATAAAGTCCTATCTCGATCTCTTGCCCCTCTGTACAACAGGACAAACCATGTGGAGGCCGTGAAGAACGGGGATG
TTCCATGTGTCACACCGTCATGCATCAGAGGAAGTTCCAGATTCAGCTTTGCTTTAATTAGTTGTAGCATCTATCCCGATTTCTTTAATTATCTGATTCA
ATGTTGGTAGGTTAAGATCTGATTCCAGAGATATACCACTTCAGCTTTATTCAGTCACAGGCCTGCTAGTACTCCCTCTGTCTCAAAATAATTGCAGTCA
TAATTTTTCGCGCC