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Detailed information on CNT30104696


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002495, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30695002Oryza rufipogonOryza sativa7.0720.5883.05177reverse complement
CNT30117984Oryza rufipogonOryza nivara20.1650.699.8505forward

Expression of CNT30104696

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (43 aa)
MYPPSKKNQLLAMNLYTCRNWFSWDGAVSCNTSSILPNLQCKI*

>peptide 2 (59 aa)
MNCTACEVKKKGVQVEFYAWLGLIVTNDCILSVYCIESKCHSIFRALQSPLLTPSTRSM*

>peptide 3 (64 aa)
MIKVFNMCIACNTKYHPSFLLTADRFQAFFSLEMVTIFTEDTEPVSMKWVHSYVLMLISGFTNV*

>peptide 4 (41 aa)
MKEREKSVSVGISSHILTHFLSFYLHAIKKKSFYLHCSLLR*

Sequence

>CNT30104696
AATATGGATATAAACCAAGTAGTTCTTGTCATTTCCATGTAGAACTCTGGTTGTCTTTCCTTATCCGGAACTCCTCCTATATCTGAAGGTTGTTTCCGTA
TAAGACATGGTATGTGGTGGGTCCTGACGAGATTTAAACAACTACTATTAGGTACGTGGTATCCATAACCTTGACATATTCATAGCTAATTTGTTAATAA
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TCTTGGAATTAACTTCTAAAATTTAAAATTGGTCGTGGCTCAAACAAACTGGCACTTAGCTAGCCACTCGAGTAGGTTGGACGAGAAAAGGTTAAAGAAA
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GACAATGGAACGTTCACCAAGACATTAGTTTTTTTTATTATTAATTACTTGTATAAACTTATAAAAAATACAACAAAGTTAAAATATTTTGAGACCTTTT
CTTTGGACAAATCTAGCCCTGCTATTTTCAAGAGTTCAATAAAAGTATTTAAAATAAAGAGATTTTGATGATTAAAGTTTTTAACATGTGTATTGCATGC
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TTAGTATGAAGTGGGTCCACTCCTATGTTCTTATGCTCATATCAGGTTTCACAAATGTTTGATTAACCAGCTGATCCATAAGCTCCATGTTGGCAGTATT
TCAGTTGGTTAAAAGAACAAAAGCCCATTTTACTCCTCCAAACTAATTCAATGATCTAAACCTCCTAAAGTATTATTTAGCTCATTTTACCTCCAAACTA
TTAAAAATGATTCACTTTACTTCTTAATAATATTTCTCTTGTTTTAATCTCCATACAAGTTTTATTTTAAGCTAAAATTTGTTAGAGCATACTAGACGGC
ACCGGTACCAAAGTTTAAACAATATTCAGATTTTTTCAGGGCCGTTTGCTTGAACTTTAAAAATCTTGATGTTTAAACCGGTGTTAAGTAATTCCAACCT
ACATAAACAGTGAAATTTCTTTAAAATATGTTAGGATGTACCCTCCGTCCAAAAAAAATCAATTACTAGCTATGAACCTGTACACATGTAGGAATTGGTT
TTCTTGGGACGGAGCAGTAAGTTGTAACACATCTAGCATCCTACCAAATTTGCAGTGCAAGATATGACTTAAATGCAGAGAAATAAAGAGAGAAATAGTG
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TTGGGCTAATAGTAACAAATGACTGTATCCTAAGTGTATATTGTATTGAATCAAAATGTCACAGCATCTTCAGGGCATTGCAGAGCCCTCTTCTGACGCC
AAGCACACGCAGCATGTGATGTAACTTTCCCAGCTACTTTAGAACATGCCTTGTTCATTATCTGCAAGATGAGATAGTGGTGTTTTCTGTAAGTTTCACT
TCTATGTAACAGAAGCTCTATCCAACAATTGAACTATTGAAGTGCCATCTTAGATGATTGTCATATGGTACATTTCTTTGTGCAATGAGCGAATGGCGAT
GTAACGTTTGATATTTGTAATTTCAATATTCAAGATCATATGGTAAATTGGGAAAAAGAAGTGGCACAAAGTTCTTGCTACGTCCAGTATGGAAGTCAAA
TACTC