« Back to Oryza rufipogon search


Detailed information on CNT30104193


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT005738, E-value = 6e-67

Expression of CNT30104193

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (71 aa)
AAFLPPPAPSLRRRRWCSVAGRHHHRRRCAAAPFSAAVRWIDLQSSSSQQLGGRAGRAEKSRNWEEERQGT*

>peptide 2 (51 aa)
LPRFYHHRRRLYAAAVGAVSPVATTTVAAVLLLRFLLLFGGLICRAAVANN*

>peptide 3 (41 aa)
CRVSTTTGAVSTPPPLVQCRRSPPPPSPLCCCSVFCCCSVD*

Sequence

>CNT30104193
CTGCCGCGTTTCTACCACCACCGGCGCCGTCTCTACGCCGCCGCCGTTGGTGCAGTGTCGCCGGTCGCCACCACCACCGTCGCCGCTGTGCTGCTGCTCC
GTTTTCTGCTGCTGTTCGGTGGATTGATTTGCAGAGCAGCAGTAGCCAACAACTAGGGGGCAGGGCAGGAAGAGCAGAGAAGTCAAGGAATTGGGAGGAA
GAGAGGCAAGGTACCTAATGACATCGATCAACATGGGGCGGGAGTAACTCCCTTGGACTACACATTATTATTGCACACAACTGAAATTTAGTTTTAGATT
ATACTTTGCTCAGCATAAGTTTTGCATAGAAGTTGTAAGGGTCATTAAGGTTCTGATTCTTATTTTTCACGTGGGATTTGTGGAGCTAGGATGGTTTGGA
TTGTGTGGATTATATCGGTATTGACTTTTCTTATAACTGCCTGTCGTGGATGTCCATATTTTTAGGGGAGACTGGCGAAATTTCTAATAATTTTAGGATT
AGTTTTTGAGTGTATTTTGGTATGGCATTCTAGGTACGTGGTTACTGGGGGTGTTACAGCGTCAACCAAGAATCATGCCATGATGTGATTTCAGTTCCAT
TTTAATCTTCTAATTACCTGCCATGATTTTAGGTGACTGATATCTGGTTCCCTTCTCTAGTTCTCTTGTTCTGCAGCTGCTCCTCTGGATTCTGATTCAA
GGATTCTCCCGATGGAACTCTAATTTCTCCTCTTTAAACTCGGGCACCTCCAGATTGATTTGTACTATGGCATACTAATCCTGGAACTAAAACTCCTTTC
TTTACTTGAAACTCAGCTATGGTTAATTGATGTATTGATTTGTGCTGGATTTCACTGAGCTACTACAGCTGTTGTTGCTCTTCTAAGCGGAGCCATACTA
CTCTACTACTGTTGCAACTGCTGCTAATGCTGTTCCTCGAGGTTGTCTCCCAGCCAAAACAACATGATGGCTAGTCTACTAGCTAGGCTAATATTTGTAT
GTAATTTGTGAGGGCATGGTGATGCAGCTGCTTGCATGTCGGTTTGGAAAAGGATTTGCTGCCACCTCATTTTTCACCTAATCAATTTGGGGTGAAAAAG
GTAATTTCCTCTTTGATGTCATTTTGGTGATTACATGGAAACTAAAGTCAGTAAATTATAATTACTGCAGGAAATTGGTTTTATACGTATACCTATGGAA
TTCTTACATTCTAGTCCTTAAGGTTTCATAATATTTAAGATTTTACTAGAGCTCGAGGGCTGATTGGTAATTGCTCTAGTTTTATTTTCATTTTCACAAT
TCCTCTATTGATTTGTATATAATAGCTATGAGTTGAGTATGTTACAGAACATTTGCAAAGCATAATATGGATGTATGCATGCATGCATGTATGCAGATAT
ACACTGATCATTTGTGAATAAAGTGTCGTAAC