« Back to Oryza rufipogon search


Detailed information on CNT30103954


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30103954

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (69 aa)
MYDLRLICLQLGGLSDEVSSSSLVISWSLSSSSCFTGSSEMDLFLIRGPLLVCSCKGNEVFVICAIYYK*

>peptide 2 (29 aa)
MAEDLFRTNGQLVSLGDMMIACSLVDVTK*

>peptide 3 (66 aa)
MFLATFSSGQSESSIRTFRPFRFVTLENATALFGGASPSCSFSQKLLLLEAASNSPQLLRICSYRF*

>peptide 4 (54 aa)
MLRSSMTGRPTLSLSSWFGIPGNFNVLRNSVGYMCSMLLLFVIALQTVSQLSKM*

Sequence

>CNT30103954
GTGCTTTTTCTAATTTGAGATTTTTTTGTTATATTCGTATTTATTATTAGTAGAGCATCGCAGAATTGAATGGTTTAAAGCAGCTCCCATCTTCTTTTCC
CCACTTCCTTCTTCCTGAATTTTTCCCCTCACTCTCTTATCTCATCTTTTCCCCACTTGCTTGCTTCCTGAAATTTTCCTTTTCCCTCTCTCCTTCCTGC
GTCGCCGCCGGTCACCTGAGTCGCCTCGGTGTACTTCCCTTCCAGCTTATTGTGGGGAAACCTTGAAGGGCTCCCTGGGGTCAGATCCGTTTGCTCACGG
ATCGGAGGTGTGCGGCACTGGGGATATTGATGTGCGACGAACCGTCGTCGGTATCGGAGGACCTTCGGCACAGCAAGGGTCCTTTGACGAAGCATCTCGT
TTGCTGTCCATGATTGGAGCAGTGGCTCATGGTTTCAGGTAAATAGGAATATTCATGCATATCATTCGTTTTTGTCTCTTATGCAAAATATAAAGTTCTC
TTCTTGCTTGTTGGCTGTTTGATTTGATTAGCAGTGTGAAGCTGGCAGTCTTCCGTTGGGGATATCATTAGGATTGATTCATTTGTCTCTTTTATTGAAG
GAAAAGTGTACTGCTCTTTGACGCACTCCATCAAAAATATTTTACATCAAGAAGTTTATCTTCTCAATCTTTGCTGGGGGAAACATTTGAAGATATATGG
CTATTTGAGATTTTTGCTAATTGATTTTTTATGCTTCAAATATTTTTATTGGTTGACTGAGATGAATTTTTATTAGATTAGTAGATATATATGGATATTA
AAAATATACTATTTCAGAACAGTATCAAGATAAATAGAACATTTCCTTAAATAAATTGATATTAGATAATGTGAACCTACCAGCACCCTATCTTAAGCTC
GATATACGTTTGAGAGGACTTTCTTATCAAATGGGTCTTATTGAATAACATTTGTGCATCTATAAACTTGAATAACACTGGTACAATTAGAGGATTTTAA
ATACTGTGGGTATATGTCAGAGGACTTTTTACATAGACTGTCTTTCGAGCTCACCGTTTCTGCTTGCAGTAAACCTTAAAAATATTAAGTCAATTAGAAA
ATCTCCTTGTATACAATGTTTCTAGCGACATTTTCTTCGGGACAATCTGAATCATCAATCAGAACCTTCAGGCCATTTCGGTTTGTGACTCTAGAGAATG
CTACCGCCCTGTTTGGGGGAGCTTCTCCCAGCTGCAGCTTTTCCCAAAAGCTGCTTCTGCTAGAAGCTGCCTCAAACAGTCCACAGCTTCTGAGAATCTG
CAGTTATAGATTCTGAAAAATGAACTAAGAAGCCAGAAGCTGGGTTTCAGAGCTTTTCCAGATTCTCAAAAGCTGGCTACCAAACAGCTGCTTCTCGGAA
TCTAAAGCTCCCCAAACAGGCCCCCATGGCAGAAGACTTGTTTAGGACAAATGGCCAGTTGGTGTCGCTCGGTGACATGATGATTGCCTGCAGTTTGGTT
GATGTTACGAAGTAGCATGACAGGCAGGCCTACTTTAAGCTTAAGTTCGTGGTTTGGTATTCCAGGGAATTTCAACGTGTTGAGGAACTCGGTAGGATAC
ATGTGCTCCATGCTACTGTTGTTTGTCATCGCTTTGCAAACGGTGTCACAGCTTAGCAAAATGTAAGGTGGAGGCGGTGCAGTGGTTGGGTCACGGGTCG
GCCAGGGTGGCGAGCCTGGGGGAATCGGCGGGCAGGCAAAGGTGTCATTTCTGATTTCCGCCTTTGTGGATTTTGCATGAGCGCCTTTTGCATTTTTGCC
TCGAACTTTTGCATCTACGCATTTTATCATACTTGTTTCATTGCTCTCCTCTTCTGAATCATCTTCTATTATGTATGACCTCCGTCTTATTTGTTTGCAA
CTGGGAGGTTTGTCAGACGAAGTGAGTTCATCTTCACTCGTGATTTCCTGGTCACTATCCTCTAGCTCTTGCTTCACGGGTAGCAGTGAGATGGATCTGT
TTTTAATAAGAGGGCCGCTGCTGGTTTGTTCCTGCAAAGGCAATGAAGTATTTGTCATATGTGCTATATATTATAAATAAATGAAAATTTGTATTATATG
TTCAAATACCTGTTGATTTGTCTCTCTATCTTGTTTTAGTATGTTATCCACATCGTCG