« Back to Oryza rufipogon search


Detailed information on CNT30103010


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT005507, E-value = 5e-144

Expression of CNT30103010

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (42 aa)
MAVLLLLLLLLPLLAAYADLHDQTEAGSQIAELIYVGIFSES*

>peptide 2 (63 aa)
MAAAIEIWCNCGAGLLATALLSLSFEMVLHTNCLLLLLLRLRLLRHGCALAVATTTATACCLC*

>peptide 3 (29 aa)
MQMQHPRPTHTSICTDQHSCHLLRFIFQV*

>peptide 4 (31 aa)
MHITKLPYLMVLLWLWKTNDRVTLLWFYSFF*

Sequence

>CNT30103010
TTTCACCCTAAATCCAATTATATGGTGATTCTATACAATCTAAAATATATACTACTGTTTACTAATTGAACTAGCCTAATTGATAGAGTTGTTATGGTCC
TTATGTTTCATGATAAATTGAATATGTGCTAGGGTTCAGATACTAATTTCCAAGTCCATGGCTAAATCTAAAATCTGATTTTATCTATATGTCAAGAATA
TCAATATTTGTACTATGAATAAAGATCTGCAGTTACTAAATTTGATAAAGACATAAGACTGATGATATCTTTATATACATTCTACTGTTTCTTGATTTAT
CACCTGAGCACCTGTTTATCTATAGTAAAATTTTAGTTACACAAACCGTTCTGAAGATCAAACTATTAATGTGAATATTTTACTGAATCAGAGATGTTCT
GGTTCAGCTTCTAATGGATGCAAATGCAACACCCAAGGCCTACACATACTAGTATATGCACAGATCAACATAGCTGCCATCTCCTGAGGTTCATTTTTCA
GGTTTAATGCATATAACTAAATTACCTTATTTGATGGTTCTACTGTGGCTGTGGAAGACTAATGACCGTGTGACTCTCCTCTGGTTCTACAGCTTCTTTT
GAAATTGGTCAGGGTGTTGCTCCTCCTCTTGTTTACTGCTGCCCTTCCGGATCTGCTACTTGTTTCTCCTCTTTAAATTGAAACCCCTTGCTCTTCTTGA
AACACATGCATCCCCTTTCTTTTCCTTCTACTCTCTCACCCTGGTTGTTTTTCTATGGCTGCTGCTATTGAGATTTGGTGTAACTGTGGTGCCGGATTAC
TAGCTACTGCTCTGCTATCTCTCTCTTTTGAGATGGTTTTGCATACGAACTGCTTGCTGCTACTGCTGTTGCGGCTGAGGCTGCTGCGACATGGCTGTGC
TCTTGCTGTTGCTACTACTACTGCCACTGCTTGCTGCCTATGCTGATCTGCACGACCAAACCGAGGCTGGTTCACAGATAGCTGAGTTAATATATGTGGG
AATTTTTAGTGAAAGCTAAGTGACTCACCTACTTGGGCTAGATGGCTGCTCCTAGCTTTGACACCTATGCAGTGCTTGATCGGTGGAGTATTGTAGGGTT
TCACTAATTTTTTTTATTAGATAGTCTGATATAATTAGGTACTTTTGCACTTGAGTCCCTCAGAGTCTCTAATATTGAAGGTTGCTTTGAGATTAGGGAC
TGATTTGTAATTGCCCTAGAACTCAAGAGTTTTTCTGAATAAATAATTAATTGAATCTTTGAC