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Detailed information on CNT30100124


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30691513Oryza rufipogonOryza sativa98.6294.1699.771291forward

Expression of CNT30100124

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (70 aa)
PPSSSYLFFLVLPFSPSRLTLSQCRRFLGSAGDAAALPSAGYRAPLRRPLKQMSRSRESVYWLHASLPLS*

>peptide 2 (40 aa)
MINIVLVIHLLAWLFPSCTCDTSTWLVRWDNLKLFVNFLN*

>peptide 3 (38 aa)
TTFFILSLFPRSPLLSLTAHALPVPPLLRQRRRRRRSP*

>peptide 4 (33 aa)
MVVTTTAAAAACFGLHDQPETWVGNDSHKLFYQ*

Sequence

>CNT30100124
CACCACCTTCTTCATCTTATCTCTTTTTCCTCGTTCTCCCCTTCTCTCCCTCACGGCTCACGCTCTCCCAGTGCCGCCGCTTCTTAGGCAGCGCCGGCGA
CGCCGCCGCTCTCCCTAGCGCCGGCTACCGCGCCCCACTCCGGCGACCCCTCAAGCAGATGTCCCGCAGCCGCGAATCGGTTTATTGGCTCCACGCTTCT
CTGCCCCTAAGCTAACCCCAGCCACCAGTCTCCTGCTGCTGCAGCCGCCGTGGAGATGGCTGGTGGAAACACAGCGCAACTCCGGTGGCTGCATCCCTTT
CCCCCATAGGATCTACTCTCCTCCCCTATTTTAATTTTTTGGTTACCTCGGTTGATTCTACCGTGATTGAAAAATGTGTGGTTCAGCTCCTCCTCCAGAA
CTCCAAGTCTTCTCTTCTACTGCTGCTCTTCTGGATCTAAGGTAATTCTCCTCCTTGGCTCTTGCTCTACTGGTAATATTTGACTGCTTCCTGACATCTT
CCTTGATCTGCTTCTGGTGATTCTCTTCCTCCTCTTCAGACTGATCCTCTTGCTTGATTTTCGCTCCATCTTGCTTCTTGACCTGAGTTTCATCTCTTCC
TAGAGCTGAAACCCTTCTTCATCCAAGAACTAAACAACCCTGCTTCTCCTTCAGATTTGGTTTTCCTCTCTCTGATTACTTGGCCATGGTTACTACTATT
GTTGGTTCATGTATTGGTTTGAGCTGGACTTCAGTTGAGCTATTTCTCTCTGGGTGGAGCTAACACTTAAGCTAATTTTTCCTGGAGCTTGGTTCTATGG
TTGTAACTACTACTGCCGCAGCTGCTGCTTGTTTTGGTTTGCACGACCAACCCGAGACTTGGGTTGGAAATGATTCACACAAATTATTTTATCAATGATA
AATATTGTACTGGTGATTCACCTGCTTGCATGGCTATTCCCATCCTGTACTTGTGACACCTCAACATGGCTTGTTCGGTGGGATAACCTAAAGCTATTTG
TTAATTTCCTTAATTAATGGAAAATTGGTAGAGTCTGAGGTGTTTGATACTTTTGCACTTGAATCCCTCAAGTCTGGTAAAATTGGAGGTTACCATTAGT
TTAGGGACTGATTTGTAATTTGTTCTATAACGCAGGGTCCCTTTTTGAAATATTACTAATTACACGATATGTTCTCGGCTAATGTATTTGTACAATATAT
GAAATGCATACTGTATAATAAGATTTTAAATATATAACTATATCCATGTATGTATGGATGGTTGCAAAACTGTACTGATCAATTGTGAATAAAGTGCTAT
AGCTTCCAT