Detailed information on CNT30100105


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT005811, E-value = 4e-83

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30690660Oryza rufipogonOryza sativa3.3922.188175forward
CNT30552538Oryza rufipogonOryza glaberrima23.7655.0998.621228forward
CNT30595789Oryza rufipogonOryza meridionalis14.738.495.53760forward
CNT30109128Oryza rufipogonOryza longistaminata3.6631.4593.12189forward
CNT30575040Oryza rufipogonOryza barthii1.9720.6589.22102forward

Expression of CNT30100105

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MDDGTFYFISPTLYTTLKSFFSINNMKFD*

>peptide 2 (30 aa)
MFSLDQFIFRSTRLLVDICKYPYLVERRSS*

>peptide 3 (42 aa)
PARLAYAPARRGHRTGRPAAGMHAASGCSYHRMPQVLLGLDP*

>peptide 4 (45 aa)
MNLLYYSDHHLLVLISLQINEYGSDHIRLMWHIYSLLVLKCIIKL*

>peptide 5 (33 aa)
MANTPSENKPNLADNSIGTSRRYNDRIWNFFRF*

>peptide 6 (41 aa)
MFGGSLYIQTYDIYMRPCLFKQLNWFLIFSKFIMYVIHCGN*

>peptide 7 (50 aa)
MYKIDGRYFCKCCNFIWNFLWLIFIMYKCLEVHYISRLMIYICALVCLNN*

>peptide 8 (51 aa)
MSAAICMFEPIVVLWFLTFLYICYTIYRKEISIKKITSMVPRFNRIFLARK*

>peptide 9 (47 aa)
MDWFHQLLSVRATRNRWISQDSRYVMTALSSYLKTEVVIGPCFCAFI*

>peptide 10 (48 aa)
MIEFGIFFGFRFFKNIYRNNLSAKKNYKNRLCRPPLGRQADVANGGGTG

>peptide 11 (81 aa)
MIFWYMILYVHHSFCPLLEKTCCLSENKTILCKYETKYDSPKNVYICCYRTNKKRNMEYLTCILIRYCITFVIFGSLANKT*

>peptide 12 (76 aa)
MDLGNNRHKICMDLLISPQICAHLSFNSFSYCSSQDWNVRCISLIRGGDGKRKEISLRSAKYSFHLTNHQIDQVSS*

>peptide 13 (64 aa)
RPPALHMPLRAAATAPAGRPPACMPRPGALIIVCPRYSSGSIRDPAKFFGRLPYAAGSTTTVSR*

>peptide 14 (61 aa)
ARPPCICPCAPRPPHRPAGRRHACRVRVLLSSYAPGTPRARSVILQNFLGGCRTRPDLQRR*

>peptide 15 (55 aa)
MFIILFVPSWRKLVVYQKIKQFYANMKQNMILQKMYTYAAIEQTKKEIWSTLHAY*

Sequence

>CNT30100105
CGCCCGCCCGCCTTGCATATGCCCCTGCGCGCCGCGGCCACCGCACCGGCCGGCCGGCCGCCGGCATGCATGCCGCGTCCGGGTGCTCTTATCATCGTAT
GCCCCAGGTACTCCTCGGGCTCGATCCGTGATCCTGCAAAATTTTTTGGGCGGTTGCCGTACGCGGCCGGATCTACAACGACGGTGAGTCGGTGACGCAC
GCACGCGCGTGTGTACTTGCTGCACGGATTCCCTCTTGCTTTGTACGAAGAGTCCTTTGATTTGTCCTGCTAATTTTGTTCGTCTTTTCCAAGGGATCCC
AACTCCCAACTGCCTTTTCCTTTCTTGGGATTACAAAATACTAACTGTATTTACTGTGACATTGACTGATTTTGATTGGTTCCAAGAGATGGATCTTGGA
AATAACCGACATAAAATTTGCATGGATCTACTGATTTCCCCTCAGATCTGCGCGCATCTCTCGTTCAATTCCTTTTCTTACTGTAGCTCTCAAGATTGGA
ATGTTCGTTGCATCAGCTTAATTAGAGGAGGTGACGGGAAGAGGAAAGAAATTTCCCTCAGATCTGCTAAGTACTCCTTCCATCTCACTAACCACCAGAT
CGATCAGGTCAGTAGCTAGCTATTGCTGCCACAGATTTCTTGTGTGTCCTCTACTTGTTCAGTTCTACACGTGTCGCTGCTGCTTGAAGTAATTGCGTGA
TAGAACCCCTGTCTCCTGAATCCTGATAGCTCCAGAAATAGTAGGGACTAGGTCACTGTCCACTTACTGTTCTATTGGTGACGTCTCGTACTTATCTCTA
CAATGCAAGCCGCCGTACTTATCTGCAGTGCCACTGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGTACATACATTAGCTTCAACCATTTTGGTTTAG
GGGAGATCTAGCTGGATGTGGAATCTTGTTAGTCTTAATCTTTTAAGAAAAAAAGAACTCTCTTCGGTTTTTGTTTCATTTTCAGCTTACTAGAAACAAA
TGGTCCGGTTGTTTCTCTTATTCTGTTTAACCAGATAAAGTAAATTCAGAGGTTTTATTATGGTGCTAAACATATCTATCAATTGATGGTTCCTGCGCCC
GAAGTAAAGTTCGCTTTTTATTTCATTCGTCACTTTGACTGTGAATGCCATGTTCTCTCTTGATCAGTTTATTTTCAGGAGTACTAGACTACTGGTTGAT
ATATGTAAATATCCATATCTAGTAGAGAGGAGATCTAGCTAGCTAATGCAACATCTTCATGTCTTTTAATTCTTTTAACACAGTTAATCTCTCAGAATCA
TTCTCATTACCCTCTGCTAACAAAATTTGATATTTTGCGTTTCAAAGACATCTCGGCTGGTGGGTTGTAAGTGTAACTAATGCATAACATGTTTCCTTGC
AAAAGTTGAGTTCTTCTACTGGCAAAATATGACATCCAGATTTCACATCGATCAATCCAACTAATTAAAGCTAATTTAGATATACTGTATTCCAGGTAGC
TATATTTCTATATACCACTACATGGAGACCAAATTTAGATGTAAAGTTATGAATGTATAAAATAGATGGGCGCTATTTCTGCAAGTGTTGCAATTTTATT
TGGAATTTTCTATGGCTAATTTTCATCATGTATAAATGTTTGGAGGTTCACTATATATCCAGACTTATGATATATATATGCGCCCTTGTTTGTTTAAACA
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GCTTATTTTGAATGAGTATCAATAGTTCCAAACTTATATATGCAGTATTTTTTTGGACACCAAAAGTGTCTATATATGGATATGTAATGTTAGATTGAAT
TGTGTGTTGTGTCCAAAAAGATATCTTAGAATATCATGCTTACTCTAGTTAAAGTGATGATATAGCCAATTTTTGTTCAACCAAGTTTGGATATATAGTT
TATGACTAGCGCTAGCTAGTTCGTAGTACCTTCATTCAAAAGTTGCGTACACATTTTTCTGCTCGAGTTCCCTCACACTGATATGTCTGCCGCTATATGC
ATGTTTGAACCAATTGTTGTACTATGGTTTCTCACTTTCTTGTATATATGCTATACCATCTATAGGAAGGAAATTTCAATTAAAAAAATTACTTCTATGG
TCCCTCGCTTCAATCGTATTTTTCTTGCAAGAAAGTAGATGATTTTTTGGTATATGATTTTGTATGTTCATCATTCTTTTTGTCCCCTCTTGGAGAAAAC
TTGTTGTTTATCAGAAAATAAAACAATTTTATGCAAATATGAAACAAAATATGATTCTCCAAAAAATGTATACATATGCTGCTATAGAACAAACAAAAAA
AGAAATATGGAGTACCTTACATGCATACTGATTCGATATTGTATAACATTTGTTATATTTGGATCACTAGCTAACAAAACATAACCTATAAAATTGGAGA
TGTGTAAATATAACTAATTTTGCAACCACTATATAATAGTATATCAGTCTCAGTATGTACTGAAATAAAAAAAGGACGCGTCTACAACGAGATCGCTCTC
TGTATGGTCATAACTAGCTACCTTAATCTCATATCTAGTTGCTACTAGTATACTCAAAAGTGCATGTATTTTTTTTCTTATGGAATTTTCTCTTAGATTA
CTCATCCGATTTACGACCCCATTACACCATTGTGTTTATAACAATTAAATCTTTATAACAAGATCTCACATGACTATATTTTCATGAAAAAAATACAAAT
TAATTTTATAATATATCTAAATTACTTTTAGATTTCATTAAATTACTTCTTAGTCATAAAAGTAATTTAGTAAAGCCTGAAAGTAATTTAGATATATTAT
AGAAGTACCTTAAAACAAAAGTAAAGTAACTTGTTACGACATTAAAAGAAATCTATACATTCATAATGTTATTCATAATATTGTGAGTTGTTTATTTTAT
AATCATTTCTAGTCAGTGACGTAATTTGTGTTGATTAAATTTAATTTCTATATAGACTCATCTTTTTACCTCTATAATGGATTTACTTTTGATGTTGTAA
TAAAGTTACTTTCTTTTTTTTAAGTTACTTTACTAATTTATGTAAATTACTTTTAGACTTTACTAAATTTACTTTTATATGTCTAAGAAGTAATTTAGTG
AAATCTAAAAGTAATTTAGATATATTATAAAATTAATTTATAATTTTTCATCAAAATATAATCATGTAAGATCTTGTTATAAAGATTTAATTGTTAAGAG
CACAACGGCGTAATCGGATCATAGATCGGATAAGTAGTTTAAGAGAAAATTTAGTTTGAAGTATAGGTGGTTCCTATTTGCTTGAAACATAGGGATAAAC
TACTCTCTCTCTCTCCCTCTCTAGCGTAACAGAGTGCGTTACGTGGCTTCCGATTCGGTCTGTTCTGGCCTTCTCGGACAGCACGTGTTCAAATTATGAA
TTTTACTGGAGTATTCCAATCTATACCTTTTATATAGTTGATACCCATTAGCAATTATTACAAGCCAAAACTCAACATACAAATATAAGCATGTAAGTAT
TATGATAGAGTAAGACCCATCATCTAGAATGTTATATCATAGAGTTCAATTACATACAAGTATATGATCTTCCTAGCATCATTATTATATATATTAATAT
TTATTGTTCCTATAATATTTAACGTATAGTCAGCCATAAATATCTCGTCACAAAACACTGGGTATCACCAAGTTGATATTAAAGTTATGTTCAAATGGCA
CATGCCTACGGTTTTTCGCTTTGCTGTTAATTACACGATAATGTGAACGTCGTAATCTTGATTTTTTACATAACACTGCAAATATTTGGATCCACTTCAT
TATGCAACAAAAGGAAATTTCTGTATGATTTCTTATTCTATAATGACCTTTGAGTATACACTGTTCGATAGAAGCGTATGCATCTAAAAAAGAAAAGGGT
TAATAGTAAGTAATCAAGGCGAATATTACAATTGTGTATCTAGTTTGATGATATATATATTGGTCCTATATATATATCCATATCGTCACCTACTTGTTCT
CCTATTCAGATCATCATGAATTTGTTATACTATTCAGATCATCACCTACTTGTTCTTATCTCTTTGCAGATTAATGAATATGGATCAGATCATATCAGAT
TAATGTGGCATATTTATTCTTTGTTGGTCTTGAAGTGCATCATTAAATTATAAATATAAATATACACAGTATGTTCATTAGCTTAGTTTGCTTTAAGGTT
CTCCCAATACCCGTTTGCTTTGAGATTCATAAAGCAAGAAACTAGAAGAAAATGGACGATGGAACATTTTATTTTATTTCACCGACTTTGTATACCACAC
TAAAATCATTTTTTTCTATTAATAATATGAAGTTCGATTAGGGGTGAAAAAACGAAGCTCGTGACTCGGATTGAGTCAAACTCGTAGTATTAACGAGTCG
AGCCAAACTGATGAGCAACTAGAGATAAAAATGGAGCCTCTGGGTTTGGATGGACTGGTTTCATCAGTTGTTAAGTGTGCGCGCTACACGAAATCGGTGG
ATTTCTCAGGACAGTAGATATGTGATGACTGCACTATCGTCATATTTGAAAACGGAAGTAGTAATCGGCCCTTGCTTCTGTGCATTTATATAAATACAAA
TATATATCTTTTTATGCATAGCAAATATAGTTATCAAAGTGGTATTATAATCTGACTAACATGATTAAATAGTTCAAATCTCTTTTTTCTTCTTTAATTA
ACGTGTTAATTTCATTCTCTACCTTATGAGAGTGGTATTACGTTCCTTTTCTACGTCTCCTAAACCTTGCAGGCTTGCAGCCTGATCATTTCTAGCTCAA
GTAATAAGTGATGGATATCAAATTAATGTGACATTTTCGTGAGTTGGTTTGAATGGCAAATACTCCGTCAGAAAATAAACCCAACCTGGCTGACAACTCT
ATCGGCACATCACGGCGATACAATGATCGAATTTGGAATTTTTTTCGGTTTTAGATTTTTTAAAAATATTTACAGAAATAATCTATCGGCAAAAAAAAAT
TACAAAAATAGGCTCTGCCGCCCACCTCTGGGGCGGCAAGCTGACGTGGCAAACGGGGGAGGAACGGGC