« Back to Solanum tuberosum search


Detailed information on CNT3090385


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONSTUT001768, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
nothing found

Expression of CNT3090385

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (39 aa)
MMTKKTKEKRNTLQVKYRKTKFRTFHLHLNLVKAILRQT*

>peptide 2 (34 aa)
MYTYLLKNNRKEFKDSQVIDSIFFIQQKEQIKAS*

>peptide 3 (32 aa)
MKPSKVVQPRYYPKWKICKHRISQLINRTQSN*

>peptide 4 (36 aa)
MLEYEDEVKPVQIQNCSNKMKNKTLKLGVIASKLLG*

Sequence

>CNT3090385
AGCTCTTTTGCAATTGTATTAGAATGAAAAATATTTAAGAAAGTGTATTTTCTTTAGATCAATTTAGAAAAATCCATGGCTAAAAAAGGTAATTAAAAAA
AATAGACATTTACTCATTGATTGACAAAGTGCTTCCTTTAGAAAAAGTTTTAGAAAAATAAGTGTTTAGAACAATTTTTTTTTTTTTTAAAGACATTGTC
AAGTTGAACAAAACTTAATAAATCTAGCAGGTTTAAAAATGGTGCAAAAAGAAGTGTTTTAAAAAGATTTTGCCAAATGAAGTTTATAAAAGCTGAAATA
ATTATAAAGGTTTGTTTCTAACTAAAAAGGTACCCAAACTCAAACATCTATATTATGTCAACTATTATGAAACAAGAAATTAACACATATCCAAAACACA
TTAGAAAGTTAAAATAAATAAATGCTAAATAGTAATAAGTAAAAGCGACCCCCAAATGATTTTTGTTGTCATTTTGGATAGTCTGGGTTGTCGAATTCAT
GTATGGGTATGATGGTGTCGAGTCCATGAGACTCTAATTTTGCGAGAGTCCTTAATTGAGACTCCATTTTTGCTCTAAAGTGTTCATGCAAATAAAGAAA
GAATAAAGAGATTCGTGATGTGAATCCACTTTAAGACTATATCGAATAAACCAAACATGAAACCTAGTAAAGTCGTACAACCAAGATACTATCCGAAATG
GAAAATATGCAAGCATAGGATAAGCCAACTTATTAACAGAACTCAAAGTAACTAGCCTACAAGATAAATCTAATTCTCAAGTTTATCCAATTTAATCTAT
AACGAAGTTACATTTTAAGGCAAGAAGATAATTAAAACAAGTAATTTATTTAAAACTTATAAGAAAGACTTAAATACATATACTATATATGTTGACATAA
TAGGAAAGAAACTTAAAAACTCACATTTTTAAAAATAACATATTCAGAGATTTACATGCCATTTATTTAGAAAAATTGAAGGAAGCTTATGTACACATAT
TTGCTAAAAAATAATAGGAAAGAATTTAAAGATTCACAAGTTATTGACAGTATATTTTTCATTCAACAAAAGGAACAAATAAAAGCATCATAACATAAAA
TCTCTTGCCAGATAAGGATACCAAATGCCAAAGATAACATTTTCATCATGATGACAAAGAAAACAAAGGAAAAGAGGAACACGTTACAAGTCAAATATCG
AAAAACAAAGTTTAGGACATTTCATTTGCATCTTAATCTAGTAAAGGCTATACTCCGACAAACATAAACAAAGCAATACATATTTTATAGGCTTAACATT
ATCTCAAAACAGTGGAAAATATATTCGGTTAACATCACTTAAGTATGCTGATAAGTATTTTACTCATTTGTCAAACTTCAAGCAAAGCATAGTTTCCAAA
GAGTTTACAACCTAAAAATGAGTCTTGGAAACATGATTTCTAAAAAATAAAATAAAACAATCTTCAAAATACTTTAACATCTGATTTTTACAAAAGAAAT
GAACAAACAGTGAATATTAAAATCAAAGATCAACTAAGTTACATTCATTCATCATTATGCCAAAAACACAAAAGTGTTGAAATGAAACTAACAGTAAGTC
CATAACACATTAAAACACAAATTCGTCTATATCTCACGAAAATAAAAAATAAAAAAACTGGATGTCACTGACCTATTTTGGGGCAGTGAACTGGGGGTGT
TTTCGGTCGAAGATCTATGCTCGAATATGAAGACGAGGTTAAACCCGTTCAAATCCAAAATTGCAGCAACAAAATGAAGAACAAAACTTTAAAACTAGGT
GTGATAGCTTCAAAGCTTTTAGGGTAGACGAAAAGCTGAAAAACTTATCCTCAATTTGACTCCAAATACAAGTATTTATAGGGAGAAAACAGAGTTTATG
AGCAGGAATTCAAATTTTTTAAATTGGTAAAAAACAAACCTTCAAATCCAAACGTTGGAAACCCTTAGGATAAGATTTGTAGGAGCCACATGATTGAGAG
GACATTGGCGTGAAGATGGAGTACCTACCCTCTGCTTATTGTTGACAAAATACGCTAATTTTCCAGAAAAAATGAAAGAGGAGACATGATGTGTGG