Detailed information on CNT30710507


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q949Q5|PSAO_ARATH, E-value = 2e-30

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30728236Glycine maxCorchorus capsularis4.9832.4883.33114forward
CNT30200122Glycine maxPisum sativum2.1421.6889.849forward
CNT3084323Glycine maxVigna radiata3.9829.3593.4191forward
CNT30644492Glycine maxCannabis sativa4.1142.3485.1194forward
CNT30585013Glycine maxEchinochloa crusgalli4.0222.2883.792forward
CNT30724407Glycine maxLupinus angustifolius4.7629.6289.91109forward

Expression of CNT30710507

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MHFHYQKYYISTLQYYTIYYHLILSLINISEKNNC*

>peptide 2 (34 aa)
MLLFYFKFQILLAKSFYMLLYLVKGYLSYGSCFF*

>peptide 3 (85 aa)
MNKPRCHVTSHNLHDVCLVLIISVSRRKCFERENNRRRYVLFILFNKLHSFYLWSHGLVVRTLDSESSNPSSNLGGTFILLLTLV*

>peptide 4 (67 aa)
MCLYNSYFECNLLSSQGDEKKKKKERERLPYLFLTFESVIIGLTNSKQQSKHILVRFSLCARSNTSK*

>peptide 5 (44 aa)
MNTTRIQTYSRCVCITVTLNVTYFHLKEMKKKKKKKERDFLTCF*

>peptide 6 (32 aa)
MLSKKRPVRLLPLIAGMLEGASQPINPNPITL*

Sequence

>CNT30710507
GGCGATATTACATAGATTTCTCCTAGTAAGAAGGAAAAAGACCATAGGTTTAGAATTCAAAAGTAGTCTTCAGTCCTTCCCTTGAATCCAATTTGCCCAA
AAGTGAGGACAATGAACAAGCCAAGGTGCCACGTAACCAGCCATAACCTGCATGACGTATGCCTCGTGTTAATTATTAGTGTGTCTCGAAGAAAATGCTT
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AATTTCAAATATTGTTGGCAAAAAGTTTTTATATGTTGCTGTATTTAGTGAAAGGCTATTTGAGTTATGGTTCTTGCTTTTTCTAAAAAAAAATTATAAA
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AATTATATTTTAATACCAAGTGAAAAAAAAAAGCTCGTCAACCTCGGTCATCATCAAACTTGTCAAATAGAGTTTGTAAAAGAAAAGAGATAACAAGCAT
CCGAGAGTCCACACAAATATTCTTTTGGTCAACCATAGAAATGTTCTAATAATTAACAACACTTTGGTCCACTAAACGAATTGGGCTTACATCGTTGAAG
AATTTGCAATCTGGGCCCAAGTCCACACCATTCTCATATTTTTGTTGTTAAAGTTGGGCAAAACTATTATAAATATTCATAGCCAAAATAAGAAAATACT
ATCATGCATTTTCATTATCAAAAATATTATATTAGCACATTACAATATTATACTATCTATTACCATCTTATTCTCTCATTGATTAATATAAGTGAAAAAA
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CATGTTTGGTTGGAATTGTTTTTGAAAAAAAGAAATCACTTATATTTAAAAAAAAAATCTGTAACTTTGTATTTCATCAACTATTTTTCTCGTGAACTCA
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AGTCTCACACATACAGACTTCAAATCAAAGCTATAAAATAATTACTTTGACATTTTTTGTTTTGAAAAGTGTGATTTTTGTGTTAAACATGAATACAACC
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GAGACTTCCTTACTTGTTTTTAACATTTGAAAGTGTGATTATTGGCTTAACAAATTCTAAACAACAATCCAAACACATACTAGTTAGGTTTTCTCTTTGT
GCAAGGTCCAACACATCCAAGTGACTCATTTCAATTTCATTTTTCTCTTCATTCCTCATCATCATCTTCTTCTTTCTCTTTCTCTTAATATTAATATGAT
TATAGTTGTTGTTGTGAAGTAAAGAACCATTGAATAATAATAATAATAATAATACGGAATGAAAGAAAAGTAATACAAAGGGTGAAGTGACAAACCAAAA
GGACGAAGTAAGGGCAGGAGGGCTGGGAAAGTGAGCAAGCTCAGCACCAATGCTCTCAAAGAAGAGGCCAGTCAGACTTTTACCGTTGATAGCCGGTATG
CTTGAGGGTGCTAGCCAACCAATCAACCCAAACCCAATCACACTGTAATCTGCCCGCAGCCAATTCCTCTCAAAGCTTTAAGGATTCCTAGCAATCACTG
GGGATTTCACAAACCCTGCAAACAAATTACATAACATGTCACACAACATGCTCATCGATCTTTAATTCTTGATTGATCCTGCTCTATGCTTTCACATTGA
ATCATCCAAAATCACATTGAATTTAGATAAATTTTGAATTAATGCAGAGTCTAAAATTAATTTTGAATTAACACAAGTTAGGTCAATT