Detailed information on CNT30695654


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30102916Oryza sativaOryza rufipogon18.4670.05100594forward

Expression of CNT30695654

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (61 aa)
MCQVRLQLKTFPLNQSLTISLTSICCLGNKCYSFEIIVIRNYNSYLTPKRAQIKSLSTKTT*

>peptide 2 (49 aa)
MIIFCYTTTYTVIGTRFNGVVSTGTNYSVPSGLHNFFLILQMLKYRKNI*

>peptide 3 (29 aa)
MKKFDKKHAYISCVIIGTGFNCKPVPMDS*

>peptide 4 (32 aa)
VGYKDELYSYIGYYKKIMERYIEMLCELCGMI*

>peptide 5 (31 aa)
MYDLVYQFVIRTDTNNFGGLWCWFLKQTGYR*

>peptide 6 (38 aa)
MTYRRSSKQGTSAAGSQQPSVSEPPADRRMIWSKQSRR*

>peptide 7 (33 aa)
MTFSDLMRDSPFFYTRLAIWASRNVNTSSIFWK*

Sequence

>CNT30695654
AGTAGGTTATAAGGATGAATTATATAGTTATATAGGATATTATAAAAAAATAATGGAGAGATATATTGAAATGTTATGTGAATTATGTGGCATGATTTAA
CCTGTTTGCATTTTAAATCTCTAAAATTTAATAAATTATAAAATTATAGATAATATAGCATGTTCGTATGATGCTTAAATGTAATTGTTAGTAGATGATG
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ATGCTTGCATTTTAAATCTGTAAAAATTAATAAATTATAAAATTATAGATAATATAGCATGCTCATATGATGCTTAAATGTAATTGTTAGTAGATGATAA
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GAGCTCTAGAAATTTGACATAAAATTTATCTTCACCCGACTTCCATATGAAAAAGTTCGATAAAAAACATGCGTATATAAGTTGCGTTATTATCGGTACT
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CGCGTACTTCCCCGGCCCATGATAAATACATAGCGCGTGAGCAGCGGAAGCATGCATAGAAGATATTCATCGGATCGAAGATGGCGTTCAGCTATATTGT
AATAAGGAACATATAAGAATCCAGCCATACTTCCCGGCGCACCATCTCATACATGTGTGTATAGCATACGTACGTGCGCGCGTATAAATATCCATACACA
ACCACATTGCCGGTGTGGCAGGTAATCACTAGTTCGTATACTCGTACACATGTACTCGTGGGCGTACGCACTATACTATTAAATGTATATGCAATACTGT
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AGAAATAATAAAATACAAAAGTTTATTACAAGCGGTTGCTTTGTAAGCTGTGCTACATAATTATAACCTATGTCCCATAATAATTGCAATTATAGGATTC
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