Detailed information on CNT30691176


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONOSAT000352, E-value = 1e-68

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30552519Oryza sativaOryza glaberrima89.8165.9899.162019forward
CNT3068352Oryza sativaLeersia perrieri9.9227.8884.75223reverse complement

Expression of CNT30691176

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (54 aa)
PARELISYMVLATGIYTLQLSSAGHEEQQAASYIYFSLILKGYIYFGEDRSVHG*

>peptide 2 (57 aa)
MHENYHFRVLQFMECLCVCVANAQFMDDLATAKMMLRINIIVFLSETNRSSGNTHIN*

>peptide 3 (54 aa)
MVSAAAMHVIPIPQKLILLTVRCKRCKQSAHDTHSQRASCMLLITMEQITPIPF*

>peptide 4 (50 aa)
MHENHHFRVLHFMKCMTDFNPSDSRKFSNKLAGAKWFLRPLCMSFPFPRS*

>peptide 5 (50 aa)
MLYFLLTARVLLLYCWSVGPSHDPEDRKGVIHDLPLKTINKASLKLLIIN*

>peptide 6 (50 aa)
MYYGLNGCLYICTVKNYRVYVCRGRYTLGVAGAQASTVSTRTMRVLRNLH*

Sequence

>CNT30691176
AACCTGCAAGAGAGCTAATCTCCTATATGGTCTTAGCTACCGGGATCTATACCCTGCAACTGTCATCAGCTGGGCATGAAGAACAGCAGGCGGCCAGCTA
TATTTATTTCAGCTTAATTCTCAAAGGGTATATATACTTTGGTGAAGATCGATCGGTGCATGGTTGATTAGAGAGCCAACTGAATGGGATTTCGCTCAGT
TTGATCCTCATCACAGTAGGTGCTTAATTGGAGGGAGTATGAAAAGCTGGCTTGCTTAATTGTGCACCATGCAGATCAAGAGCAGGGAATGCAAGAAAAT
GCAGCATATGGTATGTAAAATGCACGATGCTGGTGAGTAATGTTTTAATGCCCCTTATTTGTTACTTTGGTTAATTAATTTCTACTTAATTTTATCCAGT
TTTGCCTGATCAGTACCCTACTTTAATTGTTTCACTATATAATTTGCACCCGGTTATTACTATATTGTTGTAGTGTGTCTATCTTACCATTAATAAGATA
CTCCCTCCGTCCCTAAATATTTGACGCCGTTGACTTTTTTAAACATATTTGACCTTTCATCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTAATTCCTTTTCTA
TCATTTGATTTATTGTTAAATATACTTTTATGTATACATATAGTTTTACATATTTTATAAAAGTTTTTGAATAAAACGAACGGTCAAATATGTTTTAAAA
AGTCAACGGCGTCAAACATTTAGGGACGGAGGGAGTAAGAAGTATAAGGCTAGTTTTTGTAACATATATAGGGTATCCACTATATATCCCTCTATTCCTT
TGCAATAGTACTGAACTGCTATGCTTATACTAGGACATTAATTACTTTGGTTACACAGTTGGGAGGTGTCAGTTTAGTCCAGTGGCTGTAGCACAATGTT
GTCTTTTGAGGTGATTTTTTTCATCAAGTTTATTTTGCATGATACTCCCTGATCATTAAGATTTCTTAGCAACATTTATGAAACCACATTAAAAAAAGGA
CGTACGCATAGGCAGATATATAGCCCGTGCTTCACTTGAAGATTTGTCATTCATGCCTCAATTTTCACTAGCTAACACAGAACGTTTATGTGTACAATAA
TCCATCTCTCTTTTATGGTTTTTATGTGTGTGACCACGTTCTTACTAGATGCACGAAAATTATCATTTTAGAGTTTTACAGTTTATGGAATGCTTGTGTG
TGTGTGTTGCAAATGCTCAGTTTATGGATGATCTAGCAACAGCTAAAATGATGCTACGGATTAATATTATTGTTTTTCTATCTGAAACAAATAGATCATC
AGGCAATACACACATCAATTGAGGAACAACAGCTAGCACACAACTTATTTCATGACCACGTTCTTAATTAGTTTCTTACTAGATGCATGAAAACCATCAT
TTTAGAGTTTTACACTTTATGAAATGCATGACAGATTTCAATCCTAGTGATAGTAGAAAATTTTCAAATAAGCTAGCTGGTGCAAAATGGTTTCTGCGGC
CGCTATGCATGTCATTCCCATTCCCCAGAAGTTGATATTGTTAACTGTTAGGTGCAAACGTTGCAAGCAAAGCGCGCATGACACACACAGCCAGAGGGCT
TCATGCATGTTATTAATTACGATGGAACAAATTACTCCGATCCCATTTTAGCGCATGAAAAGATGGTTTTTGCTAACCAGCCATCTTAAAATGGATTCAT
TTGCAATTGAACAGTATAAATTTACATATTAATTGTATTGTTTTATGCTCTACTTCCTTCTCACGGCGAGAGTCCTGCTACTATACTGCTGGTCAGTCGG
ACCGAGCCATGATCCGGAAGACCGGAAGGGAGTCATTCATGATCTCCCTCTTAAAACAATTAATAAGGCTAGCTTGAAGCTTCTGATCATTAATTAACCT
ACGATCCGTCTAGCTATACTAAGCTACTCTTCGCTAATCTGCTTAACAACTTTCAGGAAGTTTTTTTCAAGTATGTACTATGGATTGAATGGCTGCTTAT
ACATATGTACTGTGAAGAATTACCGTGTATATGTATGCAGGGGCAGATATACTTTGGGGGTGGCGGGGGCTCAAGCCTCTACTGTTAGTACCAGGACTAT
GAGAGTTCTACGAAACCTCCACTAAATTTTTTATTTTGCCATACGTATATGAGAAGAGGGTTATAGTTTTATTTAATTAGTTTGTTCAGATTCCTTGTTA
TTTTTTCATGGATCTACCACCGTGTTTATGAATAAATTTTGGTACTCC