Detailed information on CNT30577218


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT001400, E-value = 3e-109

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30597073Oryza barthiiOryza meridionalis21.3642.8194.19396forward
CNT30103149Oryza barthiiOryza rufipogon71.4154.4999.851324forward
CNT30117366Oryza barthiiOryza nivara19.8577.899.73368forward

Expression of CNT30577218

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (52 aa)
MVTLLEHHLLLLQVGLSAVSLQHLLAALVYMVRYVKILIDIWICYFPCFSWC*

>peptide 2 (47 aa)
MLYINTMYKMHMYNIYNGYVYAWIYISVCMYVCMYRMHATDNQIVCE*

>peptide 3 (47 aa)
MLYLSAFGAGDSPAWTTWLLLALKPHQGMFGGIILRGSLIYNLMEIW*

>peptide 4 (74 aa)
LKPTTTQPTHLLPLLSFSRSLPSSRFPLSLSRSLLSLAHERCAPRAHRRRFLLSPPSFLPLFPCSNPNYPSPLQ*

>peptide 5 (67 aa)
TKAHNNTTHPSSSSSLFFSFSSFLPFSPFSFSLSSLPGARALRSQGASPPLPPLPPFLPSSLSLFKP*

>peptide 6 (30 aa)
MAGAKHCATPAALFYPHECALGSLLLPLPL*

>peptide 7 (43 aa)
MAAASVETSPGHVRWNNFERLTNLQFNGNLVKLGYLVILHSSP*

>peptide 8 (41 aa)
MTRKRSKNHLRSIIEQQSTYLYVLASIVAQSTPLSASVIKSL

Sequence

>CNT30577218
ACTAAAGCCCACAACAACACAACCCACCCATCTTCTTCCTCTTCTCTCTTTTTCTCGTTCTCTTCCTTCCTCCCGTTTTCCCCTTTCTCTTTCTCGCTCT
CTTCTCTCCCTGGCGCACGAGCGCTGCGCTCCCAGGGCGCATCGCCGCCGCTTCCTCCTCTCCCCCCCTTCCTTCCTTCCTCTCTTTCCCTGTTCAAACC
CTAACTATCCCTCGCCTCTCCAATAGCCGCTGCTGCCGTGGAGATGGCCGGTGCCAAGCACTGCGCAACTCCGGCGGCCCTGTTCTATCCCCATGAGTGT
GCTCTCGGGTCTCTACTTCTTCCTCTCCCCCTCTAATTTCTAGTGTTTATATTGTGATTGAAAAATGTGTGGTTCAGCCCCTCCTTCAGAAACCCAAGTC
TTCTCTTCTACTGCTGCTCTTCTGGATCAATGGTAACTCTGCTAGAACACCACTTGCTCCTTCTTCAGGTTGGTCTCTCTGCTGTCTCACTTCAGCATCT
TCTTGCTGCTTTGGTTTACATGGTAAGATATGTGAAAATCTTGATTGATATCTGGATCTGCTACTTCCCTTGCTTTTCCTGGTGTTGATCCTCTTGCTTG
ATTGCTGCTCCTTCTTGCTTCTCCTACTACTCCTCTGACCTCTCATTCACTCACTCTAGCCTCTCCTGGCTGCACACACAAGGCTGCTACGGCTGTGGTG
AAGCATGGTTGAGATGTTGAACTACTGATCTACTAGCTGTGATTATTTCTCTTTCTCCCAATCTCCACTGATTTCCAGCCGAGGCTGCTTGCTGTTGCTG
GGATCTTACTACTACTATGGCTGCTGTACTACTGGGAGTTGCTAGCTGTAGCTAGGTGTCTATCGTTGCAACCAAGGCTGGCTCTACCAGACTCTGGATA
ATTCACATTGTTATGCTTTATCTCAGTGCATTTGGTGCTGGTGATTCACCTGCTTGGACCACATGGCTGCTGCTAGCGTTGAAACCTCACCAGGGCATGT
TCGGTGGAATAATTTTGAGAGGCTCACTAATTTACAATTTAATGGAAATCTGGTGAAATTGGGATACTTAGTAATTTTGCATTCCAGTCCATAAGCTTTT
GGAATTTTGGAGGTTACTCCAGAGTTAAGGGACTGATTAATAATTGCCCTAGAACTCAGGGAGTTGTATGCAAAAATGGATAATTTTGGAAGTTGGCTTG
AGATGGCTCAGTTTGTAGATTTTTGTGTCCCTAAATAGTTGGATGCAAAATTATAAATTGTAGCAACTCAAAAATATTCGTTTATTGTTACTATTTCGAC
TTTCTAGAATGCAAACCTCCTAAATTTAAATTTGCGATCATAAATCACACAAACATTTTCTAATACATTTAATTTTGTATTTTAACTTGTATGCATGGCG
TGTGAGTTTATACATTAATGTTGTATATAAATACAATGTATAAGATGCATATGTACAATATTTATAATGGATATGTGTATGCATGGATATATATATCAGT
CTGTATGTATGTATGTATGTATCGCATGCATGCAACCGATAACCAGATAGTTTGTGAATAATTTACTATAGTTTCAGTTGTGATTTCTACTGTGCACGTG
TACCTTGCTTTGTGATGACTAATCCACGCTATAGTTTAACCCAAAACTAAATTATCCCACTCCTCACCAGGTTTACTCTAACTAAAAATAAATCAATAAT
TCATATGGATATGACTTGATAAATAAATGACAAGGAAACGATCGAAAAATCATTTAAGATCCATAATAGAACAACAATCAACATATTTATATGTCCTAGC
CAGCATTGTGGCCCAATCAACACCACTCTCAGCCAGTGTGATCAAGTCATTAGC