Detailed information on CNT30574760


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT006521, E-value = 2e-40

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30690644Oryza barthiiOryza sativa62.5188.7198.91367forward

Expression of CNT30574760

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (67 aa)
MNTLTILVSIGLADADLPGFLFFAALFKISIVFLVLQFIWCSKIVALTTCVRRELSSVHSQMAVGFY*

>peptide 2 (41 aa)
MTRELKFSSAPFVVGLKGAPLLKHSCIKSSANVNNNLQISI*

>peptide 3 (42 aa)
MLIIIFRFLYEFYVQCVQFQDLDFFFLYQWSMTWEIYQTEIY*

>peptide 4 (34 aa)
MNRNYWNGRLKSFFMIISIHISSACVLVNIRSTK*

>peptide 5 (37 aa)
MCKKRALFSPLSDGCRVLLAAESSIHLPRKLQECISW*

>peptide 6 (30 aa)
MACHQQCFIIILKLYLLKYDLIRFVFLLYW*

>peptide 7 (33 aa)
MQIYQVSFSLPRCLRFPLYFLFCNSFGAPRLWL*

>peptide 8 (54 aa)
LLLASFQLLLQFQADSQLNPNTHLLFLLPGYSVASLNALPPSFHLCFIPVIFVT*

>peptide 9 (84 aa)
MAFPEHIYQISNHVVFFFCISITIIFSVYQASDKFILSMYPLVSVCCSYDSKAYSKNGERSQGRLPVCVGIWKLLNITYELKFL*

Sequence

>CNT30574760
TTGCTCCTTGCCTCCTTCCAGCTTCTCCTTCAGTTCCAGGCCGATAGCCAGTTAAACCCAAATACACATCTGCTCTTTCTTTTGCCCGGTTACAGCGTAG
CTTCTCTCAATGCTTTGCCCCCCTCATTCCATTTATGTTTTATTCCTGTCATCTTCGTGACCTAGTTAGTTTCTTAATTTGTGTTCTTTGCGATAATAAT
CTGAAGTAAACAAGTTCTTTATGAACACTCTCACTATTCTCGTCTCCATTGGATTAGCAGATGCAGATTTACCAGGTTTCCTTTTCTTTGCCGCGTTGTT
TAAGATTTCCATTGTATTTCTTGTTTTGCAATTCATTTGGTGCTCCAAGATTGTGGCTTTGACTACATGTGTAAGAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCT
CAGATGGCTGTAGGGTTTTATTAGCTGCCGAATCATCCATTCACCTACCAAGAAAGTTGCAGGAGTGTATCTCTTGGTAGCGGACTGGATGACGCGGGAG
CTAAAATTTAGCTCTGCGCCGTTTGTGGTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTTGCTCAAGCACTCGTGCATAAAATCATCCGCTAATGTTAATAATAATCTTC
AGATTTCTATATGAGTTTTATGTCCAGTGTGTTCAGTTTCAAGATTTGGACTTTTTTTTTTTATATCAGTGGTCAATGACCTGGGAAATCTATCAGACAG
AAATCTACTGAAGCATTGACTAGACTATCCAAGCCTGTCTGGATATGGCTTGTCATCAACAGTGCTTTATCATCATTCTTAAGCTGTATCTACTGAAGTA
TGATTTGATTCGGTTTGTGTTTTTACTATACTGGTGAGGAAGGAATATATGTCCCCAACTGTATGCTGTTATTGTACATACAATATTCAGGGTGTGTTTA
GTTCACGCTAAAATTTAAAGTTTAGTTAAAATTGGAACGATGTGACGGAAAAGTTGAAAGTTTATGTGTGTAAGAAAGTTTTAATATGATAGAAAAGTTG
GAAGTTTGAAGAAAAAGTTTGGAAGTAAACTCGGCCTCAGTTCAAAACTACAGGCATGTAAAGCATTATTAGTTAAAAATGACAACGTTAACATTATTGT
AAATGTGTCTATGCATGGAAATCTCTTTATTCACATCCTGCGGCCCGTACATATTGCATAAGTGCTCAGATTACCACGAGGCCTAGAAGGTTTTACTGAG
ATCATTGCCGAAATCCAGTTTCAGGGGCAGCTAGCCAGCTAAACATTGACTTTCTGTTACTCAGATTCTTCAGGTCAGTTAATTCAGAAGTTGGCAGTTT
GTTAATGAATTCTCTTACGGCATTCTGTAACTAGCTAGCTATTGTATAAATTAAGACCTATATTTAATTTACTATTTGGGTAGAGATCGATGAGTTATAT
TTGTGTAAAGAGTGTTTGGATCTACTATCTCTAGGATCTGTTGTAGGGAATTAAACGCAACTTCAAGGATTAGTGGTGCTTACATGGATGCATGCACATT
GGACACATTGAGATTGATCTGTTGTATACATCATCAGAGGAGGATGTAAACCCAGAGGACATATACTAGTACTATATGGTTAAGGATGGCTTTCCCGGAA
CATATATATCAAATTAGCAATCATGTAGTATTTTTCTTTTGCATCTCCATCACAATTATATTCTCTGTGTATCAGGCATCTGACAAATTCATTTTGTCAA
TGTATCCTCTCGTATCAGTATGCTGCAGTTATGACTCAAAGGCATACTCGAAAAATGGCGAGAGGAGTCAAGGACGACTACCGGTCTGTGTTGGAATTTG
GAAACTTTTGAATATAACGTATGAACTGAAATTCCTGTAACGCTGGAATGTGAGATTCCAGATTACCAGCTGATACAACGTATGAACAGAAATTACTGGA
ATGGGAGACTTAAATCCTTTTTCATGATAATAAGTATACATATTTCAAGCGCATGTGTTTTAGTTAATATTCGAAGTACCAAGTGATTACGTGATTATTA
TTTTTTTAGAGCGGGGTGATTACGTTATGGCAATATTGTAAACCGTCGCAGGGCATACATTGTGTTCAACACAGTCCAAGATGTACTGCTAGCTGTAGTT
GCTGTTTGCCTGTCCACGAGAAGACCCAGTTTCTGCTGGTGTGGAATTATTTTTTGTTTTGTGTGTGTGTGTGTTGCTGTGTGTGGG