Detailed information on CNT30554464


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONOSAT000968, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30693830Oryza glaberrimaOryza sativa36.9653.9794.631081forward
CNT30596243Oryza glaberrimaOryza meridionalis17.8894.2390.44523reverse complement
CNT30107829Oryza glaberrimaOryza longistaminata36.9260.4793.521080forward
CNT30103630Oryza glaberrimaOryza rufipogon13.380.0495.37389reverse complement
CNT30577063Oryza glaberrimaOryza barthii32.5810098.95953reverse complement
CNT30115482Oryza glaberrimaOryza nivara20.89101.593.13611reverse complement

Expression of CNT30554464

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MLNPFKAIILFQLMHYFRMSSGGEPFPIN*

>peptide 2 (35 aa)
MLILAIINQPQLKKKDPEGEDVWLIPQLSCLWEWT*

>peptide 3 (58 aa)
MFFVISLTPLTIIIDAITGNNLLSSWFGVRSVQPGMVVQDGWACAAWVCCSVLIKISD*

>peptide 4 (58 aa)
FTVHLPAQAEPEPAVPCIVPPPPPSKSRLPVAPFSKLVEGKYSSYLPLSLPSKIGANR*

>peptide 5 (41 aa)
MLYIYNCLAMLRNISIINGVNYTILLFMIIFNGSSRWLIVL*

>peptide 6 (38 aa)
MDLYIKLSVCVPRLIPGRGFYAQISSEITSEFPGVTIA*

>peptide 7 (38 aa)
IYCSSSSSGRARASRAVHSAAASSFQISPPRCSFFQIS*

>peptide 8 (36 aa)
MGNSFTFCIAWFIAGHQTEKRREVRGGRCGVHASGF*

>peptide 9 (37 aa)
MVGCEHMVLKVVLMAIKDWFASYCCETLTVPTTSQHG*

>peptide 10 (51 aa)
MVHCGELCCAGGIVTASIRVLSSIATHGRHDVEAMSCGYSATPLARVKLFE*

>peptide 11 (77 aa)
MVTFARWRFGSLGGKGFLEIFFIVAWHIWKQRNGLVFENVAPSFQSWKSLFTKEILLHMCRMKEPLKQSVFDWLQTL*

>peptide 12 (29 aa)
MDLYLKMWPPPFSPGSLFLRKKFFYICVE*

>peptide 13 (29 aa)
MRCRGIAGVLFGFQMSTLQSTFTSLISWL*

>peptide 14 (72 aa)
MLLLQMSLFYAILWYPCELAYLLCGLLSMSYAHSCNNQSTSVEEKGSRRRRRLAYTPIELPVGVDLKPSLDR*

>peptide 15 (64 aa)
MKVKVFAWLLFRDRLNTRGMLNRRHYAKEDDDLTCVLCDGGHRETRLHVPSVLGAGNTWALFGI*

Sequence

>CNT30554464
ATTTACTGTTCATCTTCCAGCTCAGGCAGAGCCCGAGCCAGCCGTGCCGTGCATAGTGCCGCCGCCTCCTCCTTCCAAATCTCGCCTCCCCGTTGCTCCT
TTTTCCAAATTAGTTGAGGGGAAATATTCGTCTTATCTTCCTCTATCTTTACCCTCAAAAATCGGAGCTAATCGTTGAGTATCTTATCCGAATCGAACTC
GTTTTGAGTTTATCTCCAAAACCGAGTTTTTGATTTCCCGGAGCGATTTCTTGCGGGAGGAGTCCGATCTCTTCGATCCAAGGCTATAAATAGGACCCCC
TAGTCCTCCTCTTTCGTTTGCCCCCTCTCCCATGATCTCCCGTGCCTCGTAGCGCCGCCGCCACGTGCTCCACCCCGCCATCATCGCCGGCCGAGCTCCA
TCCGCGTCGCGCCGCCGCCTCCGTCGTCGCCGCCGGTCACCGTCACCACCGTTAGGTGCGTGGGAGGGTGGAGAAGCCCGGCCGCCTGTCCCCCGAAGCC
GCCGACCACCGCAGCTCCGGCGCCACCGCCGACCGAAGCCGCCGTCCACCTCGCCGCCGGCCGTCGTCGTTCGTCGTTTGGTTCAAGGTTTCCGACGTTC
CGGAGGGGAGCGTTTTCGTTGAGGAAGGTTCAGAAGTGTTTGCGGAAGATCAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAACAATCCTTTGAGCATGTTGAACCCG
TTTAAAGCTATTATTTTATTTCAACTTATGCATTATTTTCGAATGTCATCGGGTGGTGAGCCTTTCCCAATTAATTAATGGCCGAAGATAACTTTATTTT
CCTATGGGTTATAATTTGATTAGCTAGAACCTTATATATTGGTTTGGTTCAGCTAAATGCTATATATATATAATTGCTTAGCCATGCTTAGAAACATTAG
CATCATTAATGGGGTGAATTATACTATATTATTATTTATGATTATATTTAATGGTAGCTCACGATGGTTAATCGTGTTATGATAATTAATTGGTAATTAA
AATATGATTAATGGTGGGTTGTGAGCACATGGTTTTGAAGGTCGTGCTCATGGCAATTAAGGACTGGTTCGCGAGCTACTGTTGTGAGACATTAACCGTG
CCAACCACAAGCCAGCATGGGTAACAGCTTTACCTTTTGTATAGCATGGTTCATTGCGGGGCACCAGACTGAGAAGCGGCGAGAAGTCCGTGGGGGTCGC
TGTGGAGTCCATGCCTCTGGTTTTTGAGGGGGTGATTATGATCTAGGAATGGTGCACTGTGGTGAGTTATGTTGTGCAGGGGGTATTGTCACAGCCTCTA
TTCGGGTACTTTCCAGTATCGCGACGCATGGTAGACATGATGTTGAGGCTATGTCTTGTGGGTACAGTGCTACACCTCTGGCCAGAGTAAAACTATTCGA
ATAGCCGTGGCCGCGGTTATGGGCGAGTTGAGCAATGTTTTTCGTGATTAGTCTCACACCTCTCACAATAATTATTGATGCTATAACTGGTAATAATTTG
CTTAGCTCCTGGTTTGGAGTTAGATCTGTACAGCCGGGTATGGTTGTTCAAGATGGTTGGGCCTGTGCAGCATGGGTGTGCTGTTCAGTGTTGATTAAAA
TTTCTGATTAATTACTCCACTATTTTACTTCTCTTAAATGTTTGCTAAATGTTGCTTTTGCAAATGAGCCTATTTTATGCCATCCTTTGGTATCCTTGTG
AACTTGCATATTTGCTGTGTGGCTTGTTGAGTATGTCATATGCTCATTCTTGCAATAATCAATCAACCTCAGTTGAAGAAAAAGGATCCAGAAGGAGAAG
ACGTTTGGCTTATACCCCAATTGAGTTGCCTGTGGGAGTGGACCTGAAGCCATCGCTAGACCGTTAATTCCGCTGCTGTTGTTTTCTTTTTTTTTTAAGT
ATGTAACGTTATTATTAAGATGGATTTGTATATTAAATTGTCAGTTTGTGTACCTCGGCTGATTCCTGGACGAGGATTTTATGCACAAATTAGTTCGGAA
ATTACTAGTGAATTTCCGGGCGTGACAATTGCTTAGTGCACCATTCAGTCTGGTAATTCAGCCCTCTTCTGGGAATATCTATGGAATGATGAACTCCTAA
GTGATAAATATCCAAATTTATGTCATCTAGCTTTGCAGAAGGAGGAATCAGTAAGTAATATGTGTTCAAGGTCTTTGGAGGACTCTTTTCTTCTGCCTCT
GTCTACATAGGCCTATGTGGAGTTTTTGCAGCTGGAGGAGCAGCTCAATTCTCTGAACTTGAATGAGGTGCAGGGGTATAGCTGGAGTTTTATTTGGATT
TCAGATGTCTACACTGCAAAGCACTTTTACAAGCTTAATTTCTTGGCTTTGAATCCTCCAAGACCTTTTGTATGGCTATGGAAAACGAAGTGTGTTATGA
AAGTAAAGGTCTTTGCTTGGCTGCTTTTTAGGGATAGGCTTAATACAAGAGGCATGCTGAACCGAAGACATTACGCAAAGGAAGATGATGATCTCACATG
TGTCTTATGTGATGGAGGACATAGGGAAACTCGGTTGCATGTCCCTTCAGTGCTAGGTGCTGGCAATACTTGGGCATTATTTGGAATCTGAATTTGGAGT
TCTTTCAAATGGTCACTTTTGCAAGGTGGAGATTTGGTTCTCTGGGTGGGAAGGGCTTCCTGGAAATCTTTTTCATAGTTGCTTGGCACATATGGAAGCA
GAGGAATGGACTTGTATTTGAAAATGTGGCCCCCTCCTTTCAGTCCTGGAAGTCTCTTTTTACGAAAGAAATTCTTCTACATATGTGTAGAATGAAGGAA
CCACTGAAGCAATCTGTTTTTGATTGGTTACAAACATTATAGATTTCAAGGTTTTGTTGTAATTAAACTCTTGTAAAAATTCTCTTTTAATGAAATCACA
CTGCTAGGCAAAGCCTTGGCAGTAT