Detailed information on CNT30552478


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002741, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30691190Oryza glaberrimaOryza sativa8.8671.2591.02813reverse complement
CNT30100171Oryza glaberrimaOryza rufipogon5.5786.1788.26511forward
CNT30575232Oryza glaberrimaOryza barthii8.410098.7771reverse complement
CNT30116012Oryza glaberrimaOryza nivara10.28100.4394.39944forward

Expression of CNT30552478

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (57 aa)
MKIAVSLFQTFLGFSLDATILSTQTLCFLLDYFIFKCSASWNLNLNFCFSRNEFFNQ*

>peptide 2 (69 aa)
MLLGGFLYLRTFSSINAFDMLFGLQNIIFVSRVTVVFSSLNFNLVLLVRFLLLQSFSFSIFYLDFKALL*

>peptide 3 (51 aa)
MHFAAHLSLYKIMVSLYQTFLVFFLDTSFSILSFKPSAFCWISLFSTVLLY*

>peptide 4 (51 aa)
MVVFSSLSVNLVFSSIIKFLFLKILFGLQSFILFLKSPFPKFLYKPLLTSL*

>peptide 5 (46 aa)
MHTRIGHGYVRVLLCMLGIKLSLRISLHVKKCSNINFINTLMHFYK*

>peptide 6 (48 aa)
MHLARFLYLRTLSSINAFYMLFGLKYFILVSRVTVVFSSLSFNLVLFI*

>peptide 7 (29 aa)
MAQCANFVPLYGRMQDLYIAATHKHGLGT*

>peptide 8 (30 aa)
MKITVYIWLHLIDFSKIVVCLSRTIFWFLR*

>peptide 9 (30 aa)
MKIVVYNWLHLIDFMKIVVSLSRTIYWFLR*

>peptide 10 (32 aa)
MTLETQRQHVTFASPTSLNGNIILGTSHKQTM*

>peptide 11 (29 aa)
MFFLHRFFKYPFWSFQLFWLSQFVFLKFV*

>peptide 12 (37 aa)
MFPCLSKKCLGLQPTDIMKTVVCLFRTIYWFSVDGSF*

>peptide 13 (33 aa)
MLRVLSALMFRLITKFKTYVSLLIEKMSWFAAY*

>peptide 14 (38 aa)
MFCKFSWIPLFSNILLESIFQISFLEFPNFSVITIRLP*

>peptide 15 (38 aa)
MKTKYSFALKPTISFCSDINFELIIELYSWVSLFIETK*

>peptide 16 (37 aa)
MTNYHLENKYFQPLRCNPKFCSIYLYFPNRLTCCLKT*

>peptide 17 (46 aa)
MHLVGFIYFRTFSCINAFDMLFGLYKFGLSSDVCFSALCFNLVLLV*

>peptide 18 (45 aa)
MKIMVSLYQTFLGFSLEDSFSILSFKPYAFSWIYLFSNVLLYQCF*

>peptide 19 (42 aa)
MKIAVSLYQTFVGFSLDGSFSVLSFKLNAFRWISLPSNVLLY*

>peptide 20 (40 aa)
MLFGLENFILVSRVTVVFSPLNFNLILSFWKFYLDFKTLF*

>peptide 21 (38 aa)
MFCNFSWIPLFSNVIVALVLQISFSEFPKFSFITVRLP*

Sequence

>CNT30552478
ATAACTTTGTTGTGTGATGGATTGATGCATTTTTTTTGCACCTTCAAGCTTTTATGAAAATCGTCGTTTACAATTGGTTGCATCTTATTGATTTCATGAA
AATCGTAGTTTCCTTGTCCCGAACGATTTATTGGTTTCTCCGTTGACGCTTCATTTTTCATCTATAGGTTTATGTTTTGTAAGTTTAGTTGGATTCCTTT
ATTTTCAAACATTCTTCTTGAATCGATTTTTCAAATATCCTTTTTGGAGTTTCCAAATTTTTCGGTTATCACCATTCGTCTTCCTTAAGTTGGTTTGAAC
TTTGATATCTGGTTTATAAAAAATTTTACTTTGGTTTCTCCCGTGACGGTTGTTTTTCATCATTGAGTTTCAACTTGGTACTTTTAGCTGGATTTCTTCA
ATTATAAAGTTTATCTTTTTCGAACTTCTCTTTGGACTTCAAAGCTTCATTTTAGTTCTGAAATCTCCATTACCTAAATTTTGTATAAACTTTTGCTTAC
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TTTATCAAAAAAATATCTTGGTTGCAGACAAGTTGTCTACATTTGGTTGCATGCTTTTGATTTTATGTAAACCGTAGTTTGCTTGTACCGAACGATTTAT
TGGATTCTCCGTTGACGCTTTATTTTTCATCCATAAGTTTAAATTTTGTACTTTTAGTTGGATTTATTGATTTTGTAACATTCTTCTTGCATCGATTCTT
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TCATTTTGCATTGCGGCCTAACCGTTTAATTTTGCTCTGACGTTAATTTTGAAGTTTTGATTGAGTTGTATAGTTGGGTCTCCCTCTTTATTGAAAACAG
ATAACTTTGTTGTGAGCTGGATTGATGCATTTTTTTGCACCTTGAAGCTTTTATGAAAATCACAGTTTACATTTGGTTGCATCTTATTGATTTCTCGAAA
ATCGTAGTTTGCTTGTCCCGAACGATTTTTTGGTTTCTCCGTTGACGCTTCATTTTTCATCCATAAGTTTATGTTTTGTAATTTTAGTTGGATTCCTTTA
TTTTCAAACGTTATTGTTGCATTGGTTCTTCAAATATCCTTTTCGGAGTTTCCAAAATTTTCGTTTATCACCGTTCGTCTTCCTTAAGTTGGTTTGAACT
TTGATATCTTGTTTATAAAAACTTTACTTTGATTTCTTGCGTGATGGTTGTTTTTTCATCATTGAGTGTCAACTTGGTATTTTCTTCAATTATAAAGTTT
CTCTTTTTGAAAATTCTCTTTGGACTTCAAAGCTTTATTTTATTTCTGAAATCTCCATTTCCTAAATTTTTGTATAAACCTTTGCTTACTAGTTTGTGAA
AAGAAAATAGTTGCATGCATTTGAACCTTGCAGCTTTTTTGTGCTCTTGCATTTAGACTTATAACAAAGTTCTAGAGTTACGTTTCCCTGTTTATCGAAA
AAATGTCTTGGTTGTTGGCTAGTTGTCTACAGTTGGTTGCATTCTATTGATTTTATGTTGATTGTTGTTTGGTTATTCCAAACGATTTATTGGTTTCTTC
GTCGACGCTTCATTTTTCATCCATAAGTTTTAATTTTGTACTTTTAGTTGGATTTCTTTATTTTGTAACGTTCTTCTTGCATCGATTTTTCAAAAATTCT
TTTTGGAGTTTCCAATTTTTTTTGGTTGTAGCGGTTCGTCTTCCTAAAGTTTGTTGGAACTTTTTTTCATTTTGCATTGAGGCCTAACAGTTTTATTTTG
CTCCGATGATAATTTCTTGAAAATTGTAGTTGTTTTGTCCCGAACGATTTATTGGTTTCTCTGTTGACATGCCATTTTTCATCCAGAAGTTTATATTTTG
TACTTTTAGTTGGTTTCCTTGATTTTCAAACGTTCTTTTTGCATCGATTCTTCAAATATCATTTTTCGAGTTTCCAATTTTTTCATCGTCTTCCTTAATT
TTGTTTGAACTTTGATTTCTGGTTTATGAAAACAAAATATTCTTTTGCATTGAAGCCGACCATTTCATTTTGTTCTGACATTAATTTTGAGCTTATAATT
GAGTTGTATAGTTGGGTCTCCCTGTTTATTGAAACCAAATGACTTTATTGTGAGTTGGGCCCATGCATTTTGTTGCACCTTGAAGTTTTTATGTAAATCG
CGGTTTCCTTTTATCAAACTTTATTCTCCCTTGACGCTTCATTTTCAATCCTTTCGTTTGAACTTGATGCTTTCAGTTGGATTTCTTTGTTGGCGAATGT
TCTCGTGTATTCATGCTTTTGTCATGCTATTTGGACTTTAAAACTTTACTTTGGATTCTCAAGCGACGGTTCCTTTTTCATTCTTGAGATTCAACTTGGT
ACTTTCAGTTTGATTTCTTTGGTTTCAAACTTTCTCTTTTTCGATCTTCTCTTTTGCTTTAAAGCTTTAATTTAGTACCGAGATGTCAATTTCCTAAATT
TTGTGTGAACTTATGCTTTCTTGTTTGTGAAAGAAAATATTTGCTTACATTTAAAAATATCTTGGTTGCGGGCTAGACATTACATTTGGTTGCATCTTAT
TGGTTGCGGGCTAGATCGGTAAATTCCAGCACTGCATCACTTATCTTGACCAATTTCTTTAAAATAATCTATTTATCCAAAAAATCACCATTCCTTTCCA
GATTGGAAAAAAAACTTTGTTAGGATCATGAATATATATTTTTTTCCTAATTTATAACCCATCTAACATAGTCTTTTGCTTCAGTTTGCGCCTTGGGACT
GGATAGGACAGCATCTGGCAGACTGGCACATAGACCTATTTAGCTCTTCCATTAAAATTTCTTGATAAACACCATTGCTAAATTTTATTTTATTTTAAGG
GGGGTAGAATACCATGACCTTAGAAACCCAGAGACAACATGTAACCTTTGCAAGCCCCACAAGCCTAAATGGAAATATCATACTAGGAACAAGTCATAAG
CAAACTATGTAAGTTAAGTTGAGATGGCTCAGTGTGCAAATTTTGTGCCCCTTTACGGTCGGATGCAAGATTTGTACATCGCAGCAACTCACAAACATGG
TTTGGGAACTTGACTTGTAGGTTTTGAAAACTTCTCTAAGATGATCCATTTGTTTTAAAATTACCATCTTTTTCTAGGATAAGGAGAGCCTTGTTATGAG
TCTGAGTTAAGAAAATGTTTAATTTTGTCAGCTTGTCCTAGCCTGTAAAGAGTTGCAACCCTTCCCATGCCCATGAAATACCTTGAGTAGGATCAATAGT
CTCAAGAACAATTTTGCCCAAAGGATTGTTCTATGGAATGTATGCAATACAAAATATCTTCATAATCATTGTATCATTTCATACATGCATCGCATCATTT
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AGTATATGGATGCAGATAATGAGAACGTCCTGATGCATCCAAGTATGATTCGACAAATATTCCTAGAACACCTTGTATTAGATTGCATATGACTAATTAT
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AAATTTGTCGAATGTGAGATCAACAAGGTTAGATCATGACCGTAGACCATGAAGACTTGAACCTTGTTACATCCTAACGGTTAGAGATACTTAATCTGGT
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ACTTCCATCCACGACCCGACACAAATCTCGGGGACGTGATTTATTTTAAGGGGGATAGACTGTTACATACCCGAACTTTAGGATCTAAAAATTTCATGTC
AAATAGTTGGAAGAAAACTAATCCATTTTTGTGAACCTCAAATATTCATTTTGAAGCAAGGTGAGGACAATCCGACCTTTGCATATAGAGAATTTAAGGG
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TCTGTGCATGTTGGGTATAAAACTAAGTTTAAGGATATCACTTCACGTCAAGAAGTGCTCAAATATAAATTTTATAAATACTCTAATGCATTTCTATAAA
TAAAAACACATTGATTGTATTAAAAATATCTTGGTTGCAGGCTAGAGTTACATTTGTTTACATCTTATTGATTTTATTAAAATCGTTGTTTGGTTGTAAC
AAACGATTTCTTGGTTTTTCTGTTGAGGCTATTGTGTACTTTTAGTTGGATTCCTTGACTTTGAAATGTTCTTCTTGCATCGATTCTTCAAATATCCATT
TTGGAGTTTCCAATTATTTTGGCTGTCACAGTTTGTCTTCCTTAAGTTTGTTTGAAATTTGATTTCTAGTTTATGAAAACGAAATATTCTTTAGCATTCA
AGACCAACCATTTTATTTTATTCTGACATTAATTTTGAGCTTATATTTGAGTTATAGAGTTGGGTCTCCCTGTGTATTGAAAACAAACAACTTTGTTGTG
AGCTGGACCCATGTATTTTGTTGCATCTTGAAGCTTTTATGAAAATTGCGGTTTCTTTGTTTCAAACGTTTCTAGGTTTCTCCCTTGACGCTACAATTCT
GTCTACTCAAACTTTATGCTTTCTGTTAGATTACTTTATTTTCAAATGTTCTGCTAGTTGGAATTTAAATCTTAACTTCTGTTTTTCGCGTAACGAGTTT
TTTAATCAATAAGTTTCAACTTGGTACATTAAGTTTGATTTCTACAATTAGTTTCAACTTGGTACATTAAGTTTGATTTCTACAATTACTAACTTTCTCT
TTTTTCATTTATTTTGGACTTTAAAGCTTTATTTTAGTTCTGAAATCTCAATTTCCTATATTTTGTATGAACTTGTGTTTACTAGTTTCTGAAAAGAAAA
TAGTTGCTTGCATTTAAACCTTGAGGTTGTTTTGTGCTCTAGCGTTTTAATAGTAGACTTATAACTAATTTAATTTCAGAGTTATGTTTCCCTGTTTATC
GAAAAAATATCATGGTTGCGGGCTAGACGTCTACTTTTAGTTGCATCTTATTGATTTTATGATGACTGTAGTTTGCTTGTTCCAAACGATTTATTGGTTT
CTTCGTTGACGCTTCATTTTTCATCCATAAGTTTAAGTTTTGTACTTTTAGTTGGATTTCTTGATTTTGTAACGTTCTTCTTGCGTCGATTGTTCAAATA
TCCCTTTTGGTGTTTCCATTTTTTTGTTGTCACTGTTCGTCTTCCTAAAGTTTGTTTGAAGTTTGTTTTCTGGTTTAATAAAACAAACTATTCATTTTGC
ATTGATGCCTAAGCATTTTATTTTGCTCTGACGTTAATTTTGATCATATAATTGAGTTGTAGAGTTGGATCTCCCTGTTTGTTGAAAACAAATAACGTTT
TGTGAGATGGACCCATGCATTTTGCTGCACATCTAAGCCTTTATAAAATCATGGTTTCCTTGTATCAAACATTTTTAGTTTTCTTCCTTGACACTTCATT
TTCCATCCTTTCGTTTAAACCTTCTGCTTTTTGCTGGATTTCTTTATTTTCGACAGTTCTCTTGTATTAATGCTTTTGACATGCTATTTGGACTTGAAAA
CTTCATTTTGGTTTCTCGAGTGACCGTTGTTTTTTCACCCTTGAATTTCAACTTGATACTCTCTTTTTGGAAATTCTATTTGGACTTTAAAACTTTATTT
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CTTTTGCATTATAATTGAGTTGTAGAGTTGTCTCCCTGTTTATCAAAAACAAATAACTTTGTTGTGAGCTGGGCCCATGCATTTTGTTGCACCTTGAAGT
TTTTATGAAAATCAAGCTTTCCTTGTATCCTTTGGACTTCAAAACTTTACTTTTGTTTCTGGCGTAACAGTTTTTTTTTCAACATTAAGTTTCAACTCGG
TACTTTAAGTTTGATTTCTTCGATTACGAAGTTTCTCTTTTTGATCTTCGCTTTGGAGTTTAAAGCTTTATTTTAGTTCTGAATTATAAATTACCAAAAA
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GTTCAAGACTTATGTTTCCTTGCTTATCGAAAAAATGTCTTGGTTTGCAGCCTACTGATATTATGAAAACCGTGGTTTGCTTGTTCCGAACGATTTATTG
GTTCTCTGTTGATGGTTCATTTTAAATCCATAAGTTCAAATTTTGTACTTTTAGTTGGATTCCTTCATTTTGTAACATTCTTCTTGCATTGATTCTGCAA
ATATCCTTTTGGTTGTCACGGTCCATCTTCCTTAAGTTTGTTTGAACTTTGTTTTCTGGTTTATAAAATCAGAATATTCTTTTGCATTAAGGCCTAGCTG
ATTTATTTTGCTCTAACATTAATTTTGCACTTGTAATTGAGTTGTAGAGTTGGGTCTCCACTTGTAATTCTCCATGTTGTGAGTTGGGCCCATACATTTT
GTTGCACCTTGAAGCTTCTATGAAAATAAAGGTTTCCTTGTATCAAACATTTTTAGGTTTCTGACTTAACGCTTCATTTTCTGTCCTTTCGTTTAAACCA
TATGCATTTAGCTAGATTTCTTTATTTACGAACATTATCTTCTATTAATGCTTTTTACATGCTATTTGGTCTAAAATACTTCATTTTGGTTTCTCGAGTG
ACGGTTGTGTTTTCATCCTTGAGTTTCAATTTAGTACTTTTTATTTGATTTCTTCAATTACAAAGTTTCTCTTTTTTGATCTCCTCTTTGGACTTTAAAT
CATTATTTTAGTTCTGAAATCTTTATTTCTTGAAATATCCTTTTTGGACTTTCCAATTTTTTCGGTTATCATTGTTCGTCTTCCTTAAGTTTGTTTGAAC
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GTTGGGTCTCCCTTTTTATTGAAAACAAATAAGTTTATTGTGAGCTGGATGCATGCATTTTGTTACACCTTGAAGATTTTATGAAAATCGCAGTTTCCTT
GTATCAAACGTTTGTAGGTTTCTCTCTTGACGGTTCATTTTCCGTCCTCTCATTTAAACTTAATGCTTTTAGGTGGATTTCTTTACCTTCGAACGTTCTC
CTCTATTAATGCTTTTGACATGCTATTTGGACTTCAAAACATTATTTTTGTTTCTCGAGTGACGGTTGTTTTTTCATCCTTGAATTTCAACTTGGTACTT
TTAGTTCGATTTCTTTTGTTACAAAGTTTTTCTTTTTCGATTTTCTATTTGGACTTTAAAGCTTTACTTTAGTTCTGAAATGTTAATTTCCTAAATTTTG
TTCGAACCTATGCTTAGTTATTTGTTAAAATAAATATTTGCTTGCATTTAAACCTTGCGTCTTTATTGTGCTCTGACGTTTTAATTTTGCTCTTATAATT
GAGTTGTAGAGTTGGGTCTCCCTGTTTATCGGAAACAAATAACTTGTTGTGAGCCGGGCCCATGCATTTTGTTGCACATTGAAGCTTTTATGAAAATCAT
GGTTTCCTTGTATCAAACATTTCTAGGTTTCTCCCTTGAGGATTCATTTTCAATCCTTTCGTTTAAACCTTATGCATTTAGTTGGATTTATTTATTTTCG
AACGTTCTCTTGTATCAATGCTTTTGACATGCTATTTGGTCTTTACAAGTTTGGTTTATCGAGTGACGTTTGTTTTTCAGCCTTGTGTTTCAATTTAGTA
CTTTTAGTATGATTTCTTCAATTACAAAGTTTTTCTTTTTTGATCTTCTCTTTGGACTTTAAATATTTATTTTAGTTCTGAAATGTCAATTTCCTAAATT
TTGTTTGAACTGATTCTTAATAATTTTTGACAAGAACATATTTGTGTGCATTTGAACCTTGCGGCTTTTTTGTGCTCTAACGTTTTAATTTTGGCCTTAT
AATTAAATTATAGAGTTACGTCTCCTTTTTCATCGAAAAAAATATATATATTGGTTGCAAGCTGGACGTCTAAATTCGCTCGCAACTTATTGATTTTATG
AAAATCGTAGTTTTGTTGTACTTTTAATTGGATTCCTTAATTTTGAAACATTCTTCTTGCATAAATTCTTCAAATATCCTTCTTGGAGTTTCCAATTATT
TTTGTTGTCACGGTTCATCTTCCTTATTTTTATTTGAACTTTGTTTTCTGGTTTATAAAAACAAAATATTCTTTTGCATTTTTCCCTGACCGACTTATTT
TGCTCTGTCGTTAGTGTTGAACTTTTAATTGAGTTGTAAAGTTGAGTCTCCCCGTTTATTGAAAACAAATAACTTTGTTGTGAGCTGGACCCTTATAGTT
TGTTGCACGTTCAATCTTTTCGGAAAATCACAGTTTCCTTGTATCAAACGTTTCTAGGTTTCTCCCTTAACGCTTTATTTTTCGTCCTTTCATTTAAACT
TTAAGCTTTTAGTTAGATTACTTTATTTTTTTAATGTTCTCTTGTATACATGGTTTTGACATGCAATTTGGACTTTAAAAGTTAACTTTGGTTTATGGTG
TGATGGTTCTTTTATCATTCTTAAGTTTCAACTCGGTACTTTGAGTTTGATTTCTTCAATTACAAAGTTTCTCTTTTTGC