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Detailed information on CNT3046894


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30284769Prunus dulcisTriticum aestivum7.1835.718875forward

Expression of CNT3046894

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MQHQPFNTLFDGADALRDKRSEHLKSSTEPLILSPWNL*

>peptide 2 (57 aa)
MIKVPHQLSNLGYNRLLSVIRAIFHLSPAIPSLLARVLFLKTFLIVVRISIHVMTSI*

Sequence

>CNT3046894
GCAGCAACCCTTTCGACCAATGGACTGGTGACTGGTCACAGCAGCACTGAAGTCAGTAGTGGCTAGCTGTGCTTGTATTGAGTCTGATTAAGTGACTAGA
CTCAAACCCAGATGATTAAAGTACCTCATCAACTCTCTAATCTCGGCTACAATCGGCTGCTATCGGTTATCCGAGCAATATTTCATCTCTCTCCTGCTAT
ACCTAGCTTGCTAGCTAGAGTTTTGTTTTTAAAAACATTCTTAATCGTTGTACGTATTTCGATTCACGTGATGACATCGATCTAATATTAAGCAAAAAAT
AAGTCCATCGATCAGGTAGTATTTCAAAACCAAAGATCGACTTGACAATTAGACTGACGGATGAGCCTTAGCTTTTGCGGTAATAAATGGCTCCTATAAC
TATAAGGGTCCTAAGGCAGCGAAAATTCTTGTCGTGAAAGTTTTGACCCACACAAAAGGCGTAACGATCTGTTCAGATATATCATGCAATTCTTCATAAA
AAATTGTTGAACTTGGTGGTTTTTTCTTAAATTTTTTATTGTTTACAAATTTTAAATTATTTAATAAATAATTTTTTTCTTTAATCCATGTGACGTGATA
TTATTGGATATGTGAGCCCCATATGTATGCAACATCAGCCATTTAACACACTTTTTGATGGGGCAGATGCATTAAGGGACAAACGGAGTGAACATCTAAA
ATCCTCTACGGAACCTCTAATCTTGAGCCCTTGGAACCTCTAATCTTTCTCATATCTGGTCATCTGGATTTTTGTTCAATTTCGAACGTCCAATTTCAAC
CTTTAGATGCATCCAACAGCTGCTTGATACAACACCTGATTTAAAACAACACTTGTACTTTTTGTCCACATCACTAAAACAATAAGACTCGCGATTCTCT
CTTTACTCTGTTAATATTCCTAGGTTTTATACTGTGTATCACCGTTGCCGGAGCACCGCTATCTCTCATGTTGGGCTAATAAACCCAGATTGGGCAAGGG
CATGTGGTTTTTTGCTTTGAATCTATTTGGTGATTGTTGGTGAG