Detailed information on CNT30340693


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FRG8|GRF9_ORYSJ, E-value = 2e-122

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30448603Eragrostis tefSaccharum spontaneum2.1225.7788.02167forward
CNT30147738Eragrostis tefBrachypodium distachyon1.3625.4287.85107forward
CNT30579587Eragrostis tefEchinochloa crusgalli4.4146.1487.61347forward
CNT30116324Eragrostis tefOryza nivara2.2120.9488.51174forward
CNT30593969Eragrostis tefEragrostis curvula9.5888.1795.48753forward
CNT30558858Eragrostis tefPanicum hallii5.1225.6984.12403forward

Expression of CNT30340693

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (32 aa)
MSTTAGVAMRCDNLESSVPRYDPTDWTYGPTF*

>peptide 2 (32 aa)
MLKQAATLSPDVHAWLSEAPRQKRKAEKQICK*

>peptide 3 (43 aa)
MGLWLRALGHPFVFCRSFLFANFCSSNVNRDLMVASAVGAAWL*

>peptide 4 (45 aa)
MDSSFTYSLFARGKRWVLVIRAARMFRTVRALMLRLSLDHGILIM*

>peptide 5 (40 aa)
MPQYSFIGTILFVNIKSLSLACWISSVTCESSQTPLKYLK*

>peptide 6 (42 aa)
MPKCLCNILIASLVYLREFDHIRELWLLIRRSWLVAIAPRLI*

>peptide 7 (37 aa)
MSPSLGDGTVTLRPCSPITSPSSMAATAAAEKNSALI*

>peptide 8 (40 aa)
MAFCEVSGFQRSTKWIYMNKTLKPTFRIKINENSYINSAA*

>peptide 9 (34 aa)
MEDRRIGHKHLLDKHTVISTFFFYHCSLSWKVCC*

>peptide 10 (31 aa)
MTEMICADRWNKKREEKRDMIKMTVCADEPF*

>peptide 11 (30 aa)
MVKRSAKTKAQSRKANLQMKCHSLGWVGAQ*

>peptide 12 (29 aa)
MFLRRILHKKPWRNTCMTSMAIYERLVFL*

>peptide 13 (32 aa)
MCPHLFISQDVRVINTKLACANIPETSASLLC*

>peptide 14 (54 aa)
MEFGHMTSRGIQVPRFSWPDAPRWIRALHIAFLPEEKGGFLSYAPRACSVPFER*

>peptide 15 (52 aa)
MAMAFLLQSLPDQYGALIAVARVKDGLMVTRPWTPICFLQIFFVCKFLFLKC*

>peptide 16 (72 aa)
MAMLLHELSCKRLIQQIHFSFMRRSIFPIVSLVCQLGQRPLLLLRGWDDNNILSILMLDSLKDHLMSFVRVV*

>peptide 17 (68 aa)
MDQTTSKPKRTFGKKINENTVISGFLGRKYEWTKPLPNQKPFSDSGTVTAPFQKLLADTLLCPLPFQP*

>peptide 18 (81 aa)
MVSFMFWSLLWLFTLSLVLAWLGIDKTLYLLSDAETYLFKDKTFDSLLLPILHSYSHVICVVRTYELGFCKTILVVVVACM*

>peptide 19 (80 aa)
MAISIDMPLTIFVIGHRLLRTSPLLSICSTASSRFWVRLCICVALIHWSPTHCIREARRYGRLGIEILVYEGLMLKLHPL*

>peptide 20 (64 aa)
MNGPNHFQTKSLFQIQELLRLRSRNFWLTPYSVRCRFNPRSPILVEHITARWTRVRAISGRRPA*

>peptide 21 (68 aa)
MAGMTKTYIFSMLTLDLFKDQNIDEYCACLSHCTLLSVLCVKSFDPYVLLVPNGFDFFFFRELKSWSW*

>peptide 22 (67 aa)
MFLLLSWLLLPQAFSVVSEEVDSLSPVTLNLSGLFCCFSWVSNDKLPCDTAHDNEPAGGASFEVFLG*

>peptide 23 (63 aa)
MRLRNFSVRLLLCNSFGIFSSSPGSFVFSSFIHGSLVIRKSCGFRIRWLWLSCSNRSQINTGL*

Sequence

>CNT30340693
GCCAGGTGGATAAGGCTATACACCAGCACCACAGGAGAAAGCCAGGTGTGCCCCAAATCCGCTTACCATTTCTGATGGTCTAATCGTACCCCAAAATTCG
CGAATCACCAGCAGATCTCTCAAGATCCCGAGCTTTCGGTAGCAGCCTCGAGACCTACACCAACCAATTTCGTTCCAAGAAAGCTACTGGCAGTGCTTAA
TCCCCCTGCTTTGTTTCTTTCTCTTTGTTTTACCCAAAAGTTCTTCTCGCATCTGCTCGGCGGGTTTCGTCCCCTTTTTTATTTGATTCTAATACGATGG
AGTTTGGCCACATGACGAGCCGTGGCATCCAGGTTCCACGGTTCTCGTGGCCCGATGCTCCCAGATGGATTCGAGCTTTACATATAGCCTTTTTGCCCGA
GGAAAAAGGTGGGTTCTTGTCATACGCGCCGCGCGCATGTTCCGTACCGTTCGAGCGCTGATGCTTCGTCTCTCTTTAGATCACGGAATTTTGATCATGT
GATCTTCGTCGAGTAGCAAACTTGGCGTTTCTTTTCTTTATTTTCAGTTTCTTCTTTGCGATGTTAGTTCTTAGTTGTGGTTTGATAAGGCGTATTTAGT
TGTTTTCTGCGTGTCTATTATGACAAAATATATTTATCGACGCCAATTCTTAATTTAAATTAAGGGCCAAAATATGATTACCTTATTTGAGCGTGTCTGA
GCCGATGCGACGATGGTTGCAGTTTGATAGCCGTTTATGGTGGTCTTTTAGATGATCGAAGTGTTCAGTTTGTTGGTTTTGCTATGCCCAAATGTCTCTG
CAACATCTTGATTGCCTCTCTGGTTTATTTACGGGAGTTTGATCATATCCGTGAGCTGTGGCTTCTGATTCGTCGCTCATGGCTTGTTGCAATCGCTCCC
AGATTAATCTGAGGCTCTAGTAGCCACGGCCCGAGAGTAAAACATGGGCTTGTGGTTTCGGACCCTCGCACATTCCTAACCTTACTGAAGCAGCTTGCTG
TTGCTGCGCGGTGGTGATGACTGATGACATGGTTGTTTGGTGATTCTGATCCTTGACTGACTCTGATGAGTTTATTTGCGGTTTCTTTGTGTGCCGCTAC
TTATTTTATGTCTACATTTCTGTCTCCAAGTTTTCTTCTTGTAATTTCCTAGTGGCAGGGGCAGTTCAGTGCTTGCTGAATCTGTGTGTTTTCTGAACTT
ATGATTTTTGCCCAGATGGTGTGAGTTTCGTCGTTTCATCTCGATGGCAATGCTGTTACATGAGTTAAGTTGTAAACGGCTTATTCAGCAAATACATTTC
TCCTTCATGAGACGGAGTATATTTCCCATTGTATCTCTAGTTTGTCAACTCGGACAGCGTCCTCTGCTGCTCTTGCGTGGCTGGGATGACAATAACATTT
TATCGATTCTGATGCTAGATTCATTGAAGGACCATTTGATGAGCTTTGTGCGTGTCGTCTGAGCCAACGCACAGAAAGCCGCCTCCTTCATTGTTTCAGA
GTTATGGTCAGTTTTATGTTCTGGTCGCTCCTCTGGCTGTTTACTCTATCCCTTGTTCTTGCTTGGTTGGGGATTGACAAAACCTTATATCTACTGTCTG
ATGCTGAGACTTATTTATTCAAGGACAAAACCTTTGATAGTCTTTTGCTTCCGATCTTGCACAGCTATTCTCATGTGATTTGTGTGGTTCGAACCTACGA
ACTGGGATTTTGCAAAACGATTTTAGTAGTTGTGGTAGCCTGTATGTAAGATGTGATCTTTGTACTTTCCAAATTGGAACATGTGGGGGTCAGTCTGTTA
TTGTGATTGAAATCATCATTTTCCTTCTAGGTGGGGGTCAGTATGAGCAACATACTCTCTAATGCCTCAGTATAGTTTTATTGGTACTATCTTGTTCGTG
AATATCAAATCCTTGAGCCTAGCTTGTTGGATTAGTAGTGTAACATGCGAAAGCTCTCAAACTCCTTTGAAGTATTTGAAATAAATGACTTGCGCCACTG
AGGTAAATTGTTTCTGATTGTCAACGAGTTCCAACCTTATTTATCTGTTAACCGACCATTAATCTTCTCAGACAATCCTTTAAGTTTAATGACCCTAATG
CTTCTAATGATCATGTTATATCTGTGATTATTGAAATATAGAAAATGTGTAGGATTGCCTTTTGTGGTGCTGATATGCCGAGGCTTTTTAGGTATTGTAA
CTATGAAAAATGATTTACTTTCTGGCACGGCCCATGTAATGCCCATTTCTCAATGTATATGAGCTCAAATCAATATTTTTAGTTAATTGTTTTAATCAAT
TACATGGAACAATGCATCTACGAAATGTTTTAATAATGTTCTGTTGAGCTTATATTTTCTCTGATAAGCAAAAGTGCCAAGCCTAAATACTAGCAAGATC
TCATCTCCAAGCCCAGCTGAAGTTGTTAAGGATCGGAAAAGTTATAACACTACAAGCATACTAAGATGAACTGTCAATATAGGCACATTATTTTGTGTAG
ATGTTTCTTCGTCGGATACTGCATAAGAAACCATGGCGCAATACTTGCATGACATCCATGGCCATATATGAGCGTTTGGTCTTTTTATAATGAAGATACG
AGTTGTGGTTATATAATATTCTATAGAATCTCAATGGTACTTTAGCCGGATTTGTTTCCTTTTCATTACAATCTATACTCCGTACTACTGTATAACATAG
AGATGCAGGGCAATGGTGGTAACTCGTTTACTTTCAAGTAGCGTTGGTCATGTGCCCTCATCTCTTCATCAGTCAGGACGTTCGTGTGATTAACACAAAA
TTAGCTTGTGCAAATATACCTGAAACCTCAGCATCATTATTATGTTAATCTAAAATTTGTGAGTGTTACTAGACCATACCTCCACAAGTTAACTTAGCAT
CTCTGAAAACTAAGTAGTTGAATCCTGCGTTTTTCTATAAAATTTGTTTTTTGTGAAGTTCTCGTATGGCCTTTTGTGAAGTTTCTGGGTTCCAAAGGAG
TACTAAGTGGATATACATGAATAAAACTCTAAAACCGACATTCAGAATAAAAATAAACGAAAACAGTTATATCAATTCTGCCGCGTGATGGACCAAACCA
CTTCCAAGCCGAAAAGGACTTTCGGAAAGAAAATAAACGAAAACACAGTTATCTCGGGCTTTTTGGGCCGTAAGTATGAATGGACCAAACCACTTCCAAA
CCAAAAGCCTTTTTCAGATTCAGGAACTGTTACGGCTCCGTTCCAGAAACTTCTGGCTGACACCTTACTCTGTCCGCTGCCGTTTCAACCCTAGATCCCC
AATTCTCGTCGAGCATATAACGGCTCGCTGGACTCGTGTCCGAGCAATCTCCGGTCGCCGTCCTGCATGAGATTGAGGAATTTTTCTGTGCGCCTTTTAT
TGTGTAATAGCTTCGGCATTTTCTCTTCTTCACCTGGTTCGTTTGTGTTTTCTTCCTTCATTCACGGGAGCTTGGTCATTCGAAAAAGCTGTGGATTCCG
GATTCGATGGCTATGGCTTTCTTGCTCCAATCGCTCCCAGATCAATACGGGGCTCTAATAGCCGTAGCCCGAGTAAAGGATGGGCTTATGGTTACGCGCC
CTTGGACACCCATTTGTTTTCTGCAGATCTTTTTTGTTTGCAAATTTTTGTTCCTCAAATGTTAATCGGGATTTGATGGTGGCATCTGCGGTTGGTGCTG
CGTGGCTGTGATGACAAATTGATATCTGCTATCACTGATTCTTAATTTCATTAAGGACCGAATTTGTGATGACCTTATTTGTGCGTGTCTGAGCCAATGC
AGCATCCATTTTGCTCGAGCTGTTCTTTGTGGCTACATCTAGGTAGAGGCAATAATCAGTGCCTGATCTTTTTGTTTGTCTAACTTCTGTCTGTCGAGGG
TTTCGCACTATTGTTCATTTGTTCACTCCATGGCTATCACTGTTCTTGCAGTTTCAGGTGTATGCAAATGACCTGATTCCGCAAATTGCCTGGTTTTGAT
TAGGCCTGCATTATGTTTTGTGGTTAACAGGATAAATAGCGACTGAATAGATTTCATTTTGTATTCTGTGTCTCTATGGTTACGCACCCTTGGACACCCA
TTTGTTTTCTGCAGATCTTTTTTGTTTGCAAATTTTTGTTCCTCAAATGTTAATCGGGATTTGATGGTGGCATCTGCGGTTGGTGCTGCGTGGCTGTGAT
GACAAATTGATATCTGCTATCACTGATTCTTAATTTCATTAAGGACCGAATTTGTGATGACCTTATTTGTGCGTGTCTGAGCCAATGCAGCATCCATTTT
GCTCGAGCTGTTCTTTGTGGCTACATCTAGGTAGAGGCAATAATCAGTGCCTGATCTTTTTGTTTGTCTAACTTCTGTCTGTCGAGGGTTTCGCACTATT
GTTCATTTGTTCACTCCATGGCTATCACTGTTCTTGCAGTTTCAGGTGTATGCAAATGACCTGATTCCGCAAATTGCCTGGTTTTGATTAGGCCTGCATT
ATGTTTTGTGGTTAACAGGATAAATAGCGACTGAATAGATTTCATTTTGTATTCTGTGTCTCATCTGTGTATATGGCTGTTCTCGCATGGCTGGGATGAC
AAAAACATACATTTTCTCGATGCTGACACTTGATTTATTCAAGGACCAAAACATTGATGAGTATTGTGCGTGTCTGAGCCATTGCACGTTGTTATCAGTT
CTTTGTGTGAAAAGTTTTGACCCTTATGTGTTGTTAGTTCCCAATGGATTTGATTTTTTTTTTTTTCGGGAGTTAAAAAGCTGGAGTTGGTGATTGGATC
AATATTGCATAGCTGATTTGAATGATGAACTAATTGAGCGACATGGATCTGGAACACTAAAGTCTTATCCACAATCATGTTATCAGGCATGAATACTTGG
AATACAAACGATTCACAAATAATGATAAAAAAATGATGTTAACTCTGCATGATTTGTCTTTGAATGGATGATCATATAGTAAATAGCTTATTATAATAAA
AAATGATGTTGATAATCCTGCAGGATTTGTCTGCAGGATTCATAAGTAATCTGTACCTTTGTCTAGGACATGAATAGCTACATGATTATAGTAAATAGCT
TATTACTTATTGAGGGTTTCGTACCACCAGTGCAGTAATATGATGATACTAACCGCTAATCCTTCAGTACAACCCTTGAAGGTCAAATGATATCAATGCC
TGTAGGGGCCATACAGATTTATCTTCATCTGTTTAATCATTGATTAACTAGTCTAGTCTACAGGGAAGATATGTGCGGTTGCTGTTTTGCACTCATTTCC
TTTGCTTCAGCAATAATAAATTTAATTTCTTTCTGACAGTGGTTTGCGCAAAATCATTTATTCCTTGTGACTCTTGCATATTATAGCTACCTTTTCTGAC
AATTTTCCGATAAGTCAAAATGAATCTTCATGCTTCTTCTGATAAAGTGAAATCACATTATAGCTAGCTAGCAATATCTTATCGTTGAGGGAAACTTGAT
AAAGGATACAGCCAGATTCAGAACAGAAAATTAAACTAGTTGAATACTAAAAAATGGAAGACAGAAGGATAGGCCACAAGCATCTACTGGACAAGCATAC
AGTCATTTCGACCTTCTTTTTTTACCATTGCTCCCTTTCATGGAAGGTATGCTGTTGAGGTCTCCATTGATTGATGAATCATGTTGCATGGTCAAGATTC
AGTAGCCAACCATAGGACCTTGATTCACACTTCTTGGCTAAGTCCTCGTTATTTTTGGAGTTAGTTAAGATCTCTCCTAGAGGTCCACCTTGAGGCATCT
GCCAAGAACTTGAGATGCAATCCTCCTGTACTTGTGTCATGTTAGGTGAAAGGCAGGTGGTGCGTGGACCTTCTGCAGAGTAGAAAGTCGATGAAATTAG
CATGGAATCAGGATATTTGTTTTTCCCAGACTCCATCTTCTCATTGTTAGCCAGGCTGAAGTTTTGAAGAACTGATTGGAGACAATCAGCATCATGAAGC
TGAGTGGAGGAAATGTTCTTATTGCTCTCATGGTTGCTACTGCCCCAGGCTTTCAGTGTTGTGTCTGAAGAGGTCGATTCACTATCCCCTGTAACACTGA
ACTTATCCGGCCTATTCTGCTGCTTTAGTTGGGTGAGCAACGATAAGCTACCCTGTGACACAGCACATGACAATGAGCCAGCAGGAGGTGCCTCCTTTGA
GGTCTTTCTAGGTTGATTTTCCACAGGCTTTCTTGAACGATGGCGATTTCTATTGATATGCCGCTCACAATATTTGTGATCGGCCATCGCCTCCTTCGAA
CATCGCCACTTCTTTCCATCTGTTCGACGGCATCTTCCAGGTTCTGGGTCAGACTCTGCATTTGTGTAGCCTTGATACATTGGTCTCCAACTCACTGCAT
TAGAGAGGCTAGAAGGTATGGGCGCCTTGGCATTGAGATACTTGTATATGAGGGCCTGATGCTCAAGCTCCATCCACTGTGACGGAGTAAAAGGCCTCTT
GGTCCTGGACAGCAAGAAAGCCTGCTCATTTGGCCTTCCAAGATCCAAACCTAGATGACGAAACAAGGAGAATATCAAGCCTGACCAATGCTGAAGCAAG
CAGCAACCTTATCTCCAGATGTACATGCATGGTTAAGCGAAGCGCCAAGACAAAAGCGCAAAGCAGAAAAGCAAATCTGCAAATGAAGTGTCACAGCCTT
GGCTGGGTAGGGGCCCAGTGAAAGGGAAATGCTGCAACTGTCTATGATGAGTTGCAGAGAACATATTCAAGACCATGCGGCATCTTCTTGGTTGGTTTTC
CATACATGAAAATAGATGGAATAAAAAGGCAAGGAGAAAAGGGACATGACAGAAATGATATGTGCTGACAGATGGAACAAAAAAAGAGAGGAGAAAAGGG
ACATGATAAAAATGACAGTATGTGCTGATGAGCCATTCTAACCTGAAGGCAATGTTTGAGCGGCGGCAGCAGCCTTGGAGAACCTGAGCATCTTCTGTTC
ATCCAGGAAGGGGGAAGGGTAGGATGCAGCAGCAGCACCCTGGTTGAAGCCTCCTCTCCTGAGGAGTCCCATGTCACCGTCCTTGGGGGATGGCACCGTG
ACTCTGAGGCCTTGCAGCCCCATCACTTCTCCGAGCTCCATGGCGGCAACGGCAGCAGCAGAGAAGAACTCGGCACTCATCTGAGGAGATGCGGACGAGG
AAGAGGCAGGAGAAGAGTGTGGGTGGCTGTGGTGTGCATTGTTGGGGACAAGACTGGCTGGTGGTTGCTTAAGAGGGTGAAGATAGAGAGAGAAGGTGGT
TGTGCTTTTCTGGGAGGCAGGGAGGTGGTGGTGGCTCTTTGGGGGACTAGGGGTGGCCCTTAAATAGCAGGAGTCCTTTCATTCTTTTGTGCTTTGGAGC
TGCGAGGTTTTCGTCTCTTCTTTTCGAGTTTTTGGGCGCTCACGCACGCTTCACTTTCCGGGGCTTATGTAATGGCCCATGAGTACCACGGCCGGTGTAG
CAATGCGATGTGATAACTTGGAGAGCTCCGTCCCAAGATATGATCCAACAGATTGGACCTACGGCCCTACCTTTTGAAATGGTTAGTGGTTTCTCGCGAC
GTATTGGCGCGTGAGTTTTCGTCGTCCGTGTTTGTACGTTTAAGGAAAAAAGGCGTGATGTATACTGTAGGCTTCTCTTGAAAACAGGTTGTGTTAATGG
GAGCGTTAAGATGTGGAGATAGATAGGGCCCGTCGGTCAATAAGTGTGTGTGAGCGCGTGAGTGGGGTACGTACATGAGTAGTAACTTCTTTGAAGTACT
AGTACTTCAGTAAGTACGCCTTCTGTATGGTTGCACGTAAATATGTCAAAGTAAATGGCCGGGC