Detailed information on CNT30178594


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q05540|CHIB_SOLLC, E-value = 4e-57

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30283870Secale cerealeTriticum aestivum4.8290.6797.06340forward
CNT30226298Secale cerealeHordeum vulgare1.0522.1686.4974forward
CNT30383613Secale cerealeTriticum turgidum10.9989.894.58775forward
CNT30131347Secale cerealeLolium perenne2.6851.3683.07189forward
CNT30679711Secale cerealeTriticum urartu7.1298.0593.63502forward
CNT30341126Secale cerealeEragrostis tef1.8459.6383.08130forward
CNT30103592Secale cerealeOryza rufipogon3.9792.4184.29280forward

Expression of CNT30178594

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (39 aa)
MNLDVDMPNYPNQIYQVQVQLLPMSAHWPILLRISLLSS*

>peptide 2 (47 aa)
MCKHEFWKLDASMVNFGIPYILQTLACVFSNPNLGCFGLACFLAIMM*

>peptide 3 (52 aa)
MPCCFCTIAWAWDKCRSTRLVDLWFSRKRVCITHKKRGSALICYICICPTWE*

>peptide 4 (50 aa)
MLPKFPAELLLLVSRCVTRLGGFIRVMEPGRGLLVLLKKSSGNTPNLSKF*

>peptide 5 (55 aa)
MHLSYMGVEYTFDILFSCFLWEEFAIYDFKTLYIDAPAACLILCDARQRDVAGAS*

>peptide 6 (55 aa)
MLHLRGFTGVYRLLPNFINIGPPDYHGGGAPPQLTSNQKPPHKINPVNSCKNLYV*

>peptide 7 (54 aa)
MLICQIIQTKFIKFKFNYSQCQLIGQFCFALVCFPHRTELKLALDMFVLHKLLP*

>peptide 8 (54 aa)
MSVRLWNKSKLKQMSLFIYILFMELASDGREGYAKDTQLSCSRVNLSDMYVFTM*

>peptide 9 (61 aa)
MFSLVSLVSMSSLPYPDARYFLPDRSMCTHTIIQYGSRHREVADPCWGRPSPMLDGAPAGT*

>peptide 10 (60 aa)
MLHRMPLPIPSLCVYKWPCPPSNSSPCSSLFLNPIPCTTDPPPHGEIVPTNPSICFHSSM*

>peptide 11 (58 aa)
PPPQGTPSTLVTASRVPWRVLQVHLVSSGPRKIPVKFGLHLKFLFIETQKQGKNRNWH*

>peptide 12 (58 aa)
MQKLGVCSLGLYSLMLYFELIKSTTYRKKIIYMFNPLFHQKCYIYGALQESTGSSQTS*

>peptide 13 (91 aa)
MRSTLASFRPMPHSSPPLMILVITPYPGTRPAALSAAVGVQRRRATLWHDGLLPCAVIQNHMAVLKDTTASVDTRSGLLTRSFPIALPARS*

>peptide 14 (93 aa)
MYEQVFVLALRPHVHVDLWLSFGYDLVVVFKVSRRLMGGSHGRRHVHGLRFVQCPYCMVTAIVVLVISLFSSVLPSLLDSVMLDCLAMIDLQL*

>peptide 15 (67 aa)
MQERVPGVGRWQVGEAADKGGNHNISCILPWPSSTLSWIGNVCPCFRRNKSSCGWQGAFDADDHEVD*

>peptide 16 (81 aa)
MALPSIQFLPLLLPFPQSNSMYNRPPTPWRDSPNQSVHLLPFIHVDPLRRDGRRPLLPPPLISIDHILLASYLCNLLHKLL*

>peptide 17 (65 aa)
PPPPGHALHPCDCLEGPLACTPSPSRVFWSKKNPRKVWTPFEIPFHRNSKTRKKQKLALGSVVIG*

>peptide 18 (66 aa)
MPIELVDVAVVYGTREDLELLFSFFSRPQYLIELARCVKGKPQNQQVTCFVLHTRVRSISCHDKRS*

>peptide 19 (35 aa)
MIGLVCRKAKALECWMRKLTGLRTECLFNITNQLI*

>peptide 20 (34 aa)
MSRFLFWHYALTCTWTYGSHSAMTWWLFSRSLDG*

>peptide 21 (36 aa)
MLLIQHFMTNLHRSLCGPVPISSCVNMSFGSLMLQW*

>peptide 22 (35 aa)
MPLDWITENVPRNFRQNHNKFLLTRTKTWNSWAPF*

>peptide 23 (29 aa)
MAFIYFVVDRKRVPVFQEKQIKLWMARGI*

>peptide 24 (30 aa)
MYASMFSLLTVCVVLPPIQFTCRNFSTTQY*

>peptide 25 (30 aa)
MACSHTNNKLNFVYREQLSLFAWQNANRVS*

>peptide 26 (37 aa)
MEQSKIIYTLETYQGMLGCYTHQVLSRTITTQDEFGC*

>peptide 27 (48 aa)
MVFVQHNKPFATCRCDSLCVCFGVACAYLSYAEAGCMLIGFVFLDALF*

>peptide 28 (48 aa)
MQDISFLTEACAHIQSSSMGRAIEKLQIPVGVGHLRCWMELRPAPSSP*

>peptide 29 (49 aa)
MLGFLSLWYLHIWLSYLFAALEVRPLIHPCLIHGNQLASLPVLCHLVQM*

>peptide 30 (50 aa)
MLAYMDCVMTEPTLCAAAPPTATASRSAASAANRAMLTSSPSADQLVQCI*

>peptide 31 (40 aa)
MWKMLQRLSYRPQLGILLTLSIGWVPVHSRVAMWPCLSLP*

>peptide 32 (42 aa)
MRGTPSDPIYLSQLQYNSILKLYESCDTFYGSEGVTCLVWSP*

>peptide 33 (45 aa)
MCDTTWWFHSSNGTGEGPPCSSKKIQRKYTQLVEILALFARKQKL*

Sequence

>CNT30178594
CCCCCCCCCCCCAGGGCACGCCCTCCACCCTTGTGACTGCCTCGAGGGTCCCCTGGCGTGTACTCCAAGTCCATCTCGTGTCTTCTGGTCCAAGAAAAAT
CCCCGTAAAGTTTGGACTCCATTTGAAATTCCTTTTCATCGAAACTCAAAAACAAGGAAAAAACAGAAACTGGCACTAGGCTCTGTGGTAATAGGTTAGT
CCAAAAAATCATATAAAATAGCATATAAATGCATGTAAAACATCCAAGATAGATAATATAATAGCATGGAACAATCAAAAATTATATATACATTGGAGAC
GTATCAGGGCATGTTGGGCTGTTACACTCACCAAGTGCTATCAAGAACAATAACAACACAAGATGAATTTGGATGTTGATATGCCAAATTATCCAAACCA
AATTTATCAAGTTCAAGTTCAATTACTCCCAATGTCAGCTCATTGGCCAATTCTGCTTCGCATTAGTTTGCTTTCCTCATAGAACTGAGCTCAAACTTGC
TCTGGACATGTTTGTATTGCATAAACTGTTGCCTTGACCGGATCACATGGTTTGATCTTGTGTTGGTTTCTTTCTGCTTATGTATGTATGCTAGCATGTT
TAGCCTCCTAACTGTATGCGTGGTACTCCCTCCGATCCAATTTACTTGTCGCAACTTCAGTACAACTCAATACTAAAATTGTATGAAAGTTGCGACACGT
TCTATGGATCGGAAGGAGTAACATGTTTAGTTTGGTCTCCCTAGTATCAATGTCCTCCCTTCCCTACCCTGATGCAAGATATTTCCTTCCTGACAGAAGC
ATGTGCACACATACAATCATCCAGTATGGGTCGCGCCATAGAGAAGTTGCAGATCCCTGTTGGGGTCGGCCATCTCCGATGCTGGATGGAGCTCCGGCCG
GCACCTAGCAGTCCTTGAAAGCTGAAGGATTCAAGTGGTTGACCCAAACTCTGGTACCAGCTATATTCTGCATGCTGGGGTTCTTGTCATTATGGTACCT
ACACATATGGCTTAGTTATTTATTTGCTGCTCTGGAAGTGCGCCCTCTGATCCATCCCTGTCTGATACATGGGAACCAACTAGCTAGTTTACCTGTCCTG
TGCCATTTGGTTCAAATGTGACCGGCATCAAATTATTGCTTGATTTATCATCCTTTTTTACCAAGGCATTTGGAGGTGTTGTGTAGTGTGTGTTCCTTTA
GATGATCATGGATGTTCTCTTCCTGAACATAGCTATTGATTTTGGTTTGGTCAATATTATGATTGTTTAAGCAATCTCTAGTGTTGTGCATAGTGCTAGC
AGTCAAGACTATTATTTTGAACATGTTGATCTGTTTTTGATATATTCCTTAATTTATCTTCCTCCTGTTTAGCACCGATTAATTTTCATGTATGAGCAGG
TTTTTGTTTTGGCATTACGCCCTCACGTGCACGTGGACCTATGGCTCTCATTCGGCTATGACTTGGTGGTTGTTTTCAAGGTCTCTAGACGGTTGATGGG
AGGCAGCCATGGCCGTCGACACGTGCATGGTCTAAGGTTCGTTCAGTGTCCGTACTGCATGGTCACGGCTATAGTCGTTCTGGTAATTAGCTTGTTTTCC
TCGGTCCTCCCCTCCCTGCTTGATTCTGTGATGCTGGACTGCCTTGCAATGATTGACTTGCAACTATGACTTCCTTACTGTTTACATAGTTAATTTAATT
AGGGTGTCATGCTTTTAATTCATGTTGACAATTCTAGGCTCCATGGTTTCTTTAATTAATTCATAAACCTTTGTAGCATTATATCTATGTTGTTGATACA
ACATTTCATGACAAACTTGCACCGATCTTTGTGTGGACCTGTGCCTATCAGTTCATGTGTAAACATGAGTTTTGGAAGCTTGATGCTTCAATGGTGAACT
TTGGAATTCCCTATATTTTGCAAACTTTGGCATGTGTGTTTTCCAATCCTAATTTGGGCTGTTTTGGCTTGGCTTGTTTCCTTGCCATCATGATGTAACT
GTCAAGAATAAGTTGGTAGCAACTATAAGTAAATTTGTGTGTTGTGCAAGTGACAGCATTCTAGTTGCTCATGGAGTTTTTTGTTTCACCCTTTTTTGAG
GTTATTCTTTTACTAGTAATTCTCCGAGGGAGGTGTCGTTGAGATTGGTGACCCAAAAGTGGAAGAGGGTGGCAGGCAGGCAAGAGAGAAAGAGATGGCC
TAGATTAGGAAGCACTAGATAAAATGGTCAAATGAGTGTTCGGCTGTGGAATAAGTCGAAATTGAAACAGATGTCCTTGTTTATTTATATATTATTTATG
GAGCTAGCTAGTGATGGTCGAGAGGGATATGCTAAAGATACTCAACTTTCTTGCTCTCGTGTCAACTTGAGTGATATGTATGTGTTTACTATGTGAGATA
TCTGTTTTCAGATTGTATGAAGAATGCATATTGTGAATGAAGATAAGTAAAATGAAATTCTTCAATTTGTCGATTCATTTTTGATTTGCTTTGTTGGCTG
AGTGAGAGGAATTGATTACATTACGGTGGTGGTGCAAATGGTTGTCTGTATGTTTTGCTCAATTTCCTTTTTCTTTCTTGGCTGAGCCCTGAGACATACA
CATCCATCGCTCCTGGTATACAAGTTGTGATGGTAAATCTCATTCCTGTGGCAGCAACTTTATTTGAGTCGGCTGATTTTCATTTCATATAAGTAGACAT
AATTAGACATCGCTTCAAGAGATTTGTTTCCAAATAATTAAACATCATTATGAAATCAATCGAAGGTGAGACATCATCAGGATTTGCTCAGTTTATGTGC
TAAATCCCCAACCAGTCTGGCCACTCCTCTCCATGCTGCACCGCATGCCTCTCCCTATCCCCTCTCTGTGTGTGTATAAATGGCCTTGCCCTCCATCCAA
TTCCTCCCCTTGCTCCTCCCTTTTCCTCAATCCAATTCCATGTACAACCGACCCCCCACCCCATGGAGAGATAGTCCCAACCAATCCGTCCATCTGCTTC
CATTCATCCATGTAGACCCCCTCAGGCGAGATGGCAGGCGGCCTCTTCTCCCTCCTCCATTAATCTCCATCGACCACATACTACTCGCCAGTTACTTATG
CAATCTTCTTCACAAGTTGTTGTAATTCTCGGCTAGTCTGTCTTTATCTGGTTGGTTTCCTTCTCTCAATGTCTGTCTGTCAAATCCACCAGGATAGGAA
CATTGCATATTACGTTTGAATGACACCTAATCTAGTTCTCTAATAACATGTCAAGATTAGTTGGTACTCCCTCTGTAAACTAATGTAAGAACTTTTAGAT
CACTAATACTATTCAACGAGTAATGCTGCATTTTATTGGCATTTCTTTGGTTATAATTTAAGTGTCGCCCTATTTGGCAAACATGTATAGTGATCTTTAC
TTCCGTAGATTGCCAAGGAACCATTCAGTCTAGCCGTTGCTGCAAGTTATTGGTGTGTGAGCTGCAAAACTTGTTTCTTTCGCTGTTGTGTGCTAAATTA
GTTAGCTCTGATATGATACTTGAATACATGTTGAATCTAATCTTCATTTTTAACTACCCACTCCTTATTTGTTAACTAATCCAGCCTCGGCATGCGTGCA
AATCAACAACAGAACTAATTCTGATGGAGTGCCTAATAGTGTATATCACAGACATGCCAGGTTTGAATATTATATTTTAGTTTTGTCAGGCTTTGTTGTC
ATATGCCGTTAGATTGGATTACTGAAAATGTTCCGCGGAACTTCCGTCAGAACCACAACAAATTTCTATTGACACGAACTAAGACATGGAACTCTTGGGC
TCCATTCTAAGAGTGTTGCGTCATTATATGTTCTAGCTAGTCATTAAGCGGTGCAGCTGGAAGGGCTAGCAAATTTTAATAACATGAAAAGTTATAAGAA
CTTAAACATCGGGAAATCTTAGTTAGAGTATACTTATAAACATTGTCATATTGCTGCAAGTATGGGAGCAATAATTTTCTTGTTATTAGTAGGGTGATAA
TAGTAAACTTTGTTTATAGAAACGAGTATAATGTAAGCGTGCATGCACATCACCACATGGCTTGCTCACACACCAATAATAAACTAAACTTTGTTTATCG
AGAACAACTTTCTTTGTTTGCTTGGCAGAATGCCAATAGAGTTAGTTGATGTTGCTGTTGTATATGGTACAAGGGAAGACCTCGAGCTTCTGTTTTCCTT
TTTTTCACGTCCCCAATACCTAATAGAGTTAGCTAGATGTGTTAAGGGTAAACCACAAAACCAGCAAGTGACCTGTTTTGTTTTACATACAAGAGTAAGG
AGTATAAGCTGCCATGATAAAAGAAGTTAATGCCATGTTGTTTCTGCACTATTGCATGGGCCTGGGATAAGTGCAGGAGTACTAGACTTGTGGACTTGTG
GTTCAGTAGGAAGAGGGTCTGCATTACCCACAAAAAAAGAGGGTCTGCATTAATTTGCTATATATGCATTTGTCCTACATGGGAGTAGAATATACATTTG
ATATTTTATTTTCATGTTTCCTCTGGGAAGAATTTGCTATTTATGATTTCAAAACATTGTATATTGACGCCCCTGCTGCTTGTTTGATACTTTGTGATGC
TCGCCAGCGGGACGTAGCTGGTGCTAGCTAGGTGACTGACAGAGGAGGCTTTTCGAGATGCAAGAGCGGGTTCCCGGAGTGGGACGATGGCAGGTTGGCG
AAGCTGCTGATAAAGGTGGAAACCACAACATTTCTTGCATTCTGCCATGGCCTTCATCTACTTTGTCGTGGATAGGAAACGTGTGCCCGTGTTTCAGGAG
AAACAAATCAAGTTGTGGATGGCAAGGGGCATTTGATGCTGACGATCATGAGGTAGATTAATTCTTCCCAACACGTTATGCTGCCGAAATTTCCAGCGGA
ACTGCTCCTCTTAGTGAGCCGATGTGTGACACGACTTGGTGGTTTCATTCGAGTAATGGAACCGGGGAGGGGCCTCCTTGTTCTTCTAAAAAAATCCAGC
GGAAATACACCCAACTTGTCGAAATTTTAGCCTTGTTTGCAAGAAAACAAAAGTTGTAGGGTGTTGGCTGTAAAATGATTGGGCTTGTTTGTAGGAAAGC
AAAAGCTTTAGAGTGTTGGATGCGAAAACTGACTGGTTTGAGAACAGAGTGTTTGTTCAACATAACAAACCAGTTGATATAATCTGATTTTATTCAATTT
TCATAACTTAGTCATATTACCATACGAATCAACTGATCACATGTTGAATTGTTTATTCCACGATGGCATAAGTATTGCCATTTATTCATAACACGTGCAT
ACACTGTCTAACTAGCAAAGTTTCCCTATATTTCCCTGTATAATGGTGTTTGTTCAACATAACAAACCATTTGCTACTTGCCGGTGTGATTCTTTATGTG
TGTGCTTTGGTGTTGCTTGTGCGTATCTTAGCTATGCAGAAGCTGGGTGTATGCTCATTGGGTTTGTATTCCTTGATGCTTTATTTTGAGTTAATAAAAT
CCACCACTTATCGAAAAAAGATCATATATATGTTTAATCCTTTATTCCACCAAAAATGCTACATCTACGGGGCTTTACAGGAGTCTACAGGCTCCTCCCA
AACTTCATAAACATCGGCCCCCCTGATTATCATGGGGGTGGGGCCCCTCCCCAACTAACATCCAATCAAAAACCGCCACATAAAATCAATCCTGTAAACT
CCTGTAAAAACCTGTATGTGTAGCATTGTTGTTATTCCACAACGGCATATGTATTGCCATTCCATTTATTCGTAACGAGTGCATACACTGTGATGTCGTA
CCCTGCATATATCAAGCGAGCAACTTCTAGCTAGCGAAGTTTCGCTGGGTGTAGCAGTCGAGGTTGCCCCCGGTGGCCGTGCCGAGCATGCCGCAGTAGC
GCGTGTAGTAGCCGATGCGGTCGACGTTGGCATCGTTCCGGCCCATGCCGCACTCGAGCCCGCCGTTGATGATATTGGTGATTACGCCGTATCCGGGCAC
CCGTCCAGCAGCGTTGTCGGCGGCCGTCGGCGTCCAGCGACGTAGGGCGACGTTGTGGCACGACGGCTTGTTGCCCTGTGCCGTCATCCAGAACCACATG
GCCGTCCTGAAGGACACCACCGCGTCCGTGGACACCAGGTCCGGGTTGCTCACCAGGTCCTTCCCGATCGCTCTCCCGGCGAGATCGTAGTTGGAGCGCC
TGGTCAATTGCGCAAGGAAATTTTATCATCAAAACAATCTCTTCGGCAAAGCAACCCGACCGGGTTTCTGTTATTATTGCAGCGAAAACGAGAGCTTATT
GGGATTAGGTCGTGATTAGCGGCTAGCTAGAATGTCAACGCTGCTGTACTTTTCAAGCAGATTTTTTTCTACAGATTATTTCAGTCTGTGATATCAGTGT
TGACCAATATACTGTTTTCATGTGGAAGATGCTTCAGAGATTGTCATATAGGCCACAACTTGGGATTTTGCTTACCCTGTCAATTGGATGGGTCCCCGTC
CATAGTAGGGTGGCGATGTGGCCTTGCTTATCTCTTCCTTGAAGCAGTAGCCCCATTGGAACTGGTCGGCAGCGCCTCTCGTCCCTCCTACACGTTGACA
CGGCATGCACAAGCACGTACACGATTAACCGAGGCAGCGATGTCCAAATCAAAAGTGCCACGAAATCCGTTTAAAACAGCAATGGAAATCAACAGTGGCT
AACTGACGAACCGGTGGTCTCGTGGGAGGTCTGGCCGAAGAAGGCGGCGACCTCGCGCTTGACGTCGTCCGTGCTGCCGGTGGTGCCGAAGCCCGGGAAG
GTGTTGGCGGCGGCGATGAAGGCGTCGTACGTGTAGAACCCCCTGGCCGGGCACAGCGAGTTGTCGCGGTTGGGCAGCATGCTCGCGTACATGGACTGCG
TGATGACGGAGCCCACGCTCTGCGCCGCGGCGCCGCCCACCGCCACGGCCAGCAGAAGCGCGGCGAGCGCAGCAAACCGCGCCATGCTCACTAGCTCACC
TTCAGCTGACCAGCTCGTGCAATGTATATAGCTCAAGCAGAGTGGAGAGCTTGC